More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5133 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_5133  amidohydrolase  100 
 
 
407 aa  821    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.519765  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  70.65 
 
 
387 aa  566  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  69.69 
 
 
390 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  69.84 
 
 
387 aa  553  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  69.31 
 
 
387 aa  552  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  69.05 
 
 
387 aa  550  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  69.84 
 
 
387 aa  549  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  69.05 
 
 
387 aa  547  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  69.05 
 
 
387 aa  547  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  69.58 
 
 
387 aa  543  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  67.1 
 
 
387 aa  543  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  61.95 
 
 
389 aa  490  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  63.5 
 
 
389 aa  489  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  62.79 
 
 
389 aa  484  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  60.45 
 
 
394 aa  482  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  59.95 
 
 
394 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  59.95 
 
 
394 aa  484  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  61.48 
 
 
396 aa  482  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  59.95 
 
 
394 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  59.95 
 
 
394 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  59.45 
 
 
394 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  59.19 
 
 
394 aa  480  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  60.87 
 
 
396 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  60.87 
 
 
396 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  60.87 
 
 
396 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  60.87 
 
 
396 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  60.61 
 
 
396 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  60.61 
 
 
396 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  60.61 
 
 
396 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5140  amidohydrolase  63.57 
 
 
389 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.778625 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2598  peptidase M20D, amidohydrolase  62.72 
 
 
396 aa  464  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.572475  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  60.67 
 
 
390 aa  458  9.999999999999999e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6319  amidohydrolase  64.29 
 
 
373 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.834758  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  59.49 
 
 
399 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3769  amidohydrolase  60.64 
 
 
396 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  58.42 
 
 
392 aa  448  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  58.82 
 
 
399 aa  448  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  58.09 
 
 
395 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2379  amidohydrolase  59.29 
 
 
402 aa  447  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  57.91 
 
 
399 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2175  peptidase M20D, amidohydrolase  58.78 
 
 
396 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.20985 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  55.73 
 
 
425 aa  438  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4728  amidohydrolase  56.14 
 
 
393 aa  437  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  55.92 
 
 
412 aa  436  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5935  amidohydrolase  57.98 
 
 
396 aa  436  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2992  peptidase M20D, amidohydrolase  55.88 
 
 
399 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5374  amidohydrolase  55.88 
 
 
399 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4721  amidohydrolase  58.51 
 
 
396 aa  435  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4896  amidohydrolase  58.51 
 
 
396 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.873901  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0252  peptidase M20D, amidohydrolase  58.24 
 
 
396 aa  431  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24772  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5250  amidohydrolase  58.24 
 
 
396 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  55.61 
 
 
403 aa  429  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2753  amidohydrolase  56.78 
 
 
391 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114457  normal  0.226959 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2611  amidohydrolase  57.85 
 
 
391 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5424  hippuricase  55.7 
 
 
388 aa  422  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  57.11 
 
 
406 aa  422  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5569  amidohydrolase  55.53 
 
 
401 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544377  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  57.74 
 
 
405 aa  420  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2549  amidohydrolase  55.78 
 
 
389 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1291  peptidase M20D, amidohydrolase  55.75 
 
 
391 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.214577  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4507  hippurate hydrolase  56.01 
 
 
403 aa  415  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0151662 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5222  hippurate hydrolase  56.36 
 
 
398 aa  416  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.22678 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  52.91 
 
 
396 aa  412  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1452  amidohydrolase  57.14 
 
 
404 aa  413  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.127453 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3289  peptidase M20D, amidohydrolase  55.75 
 
 
404 aa  411  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1410  amidohydrolase  56.89 
 
 
404 aa  414  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.044641  normal  0.934375 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  51.4 
 
 
396 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0051  peptidase M20D, amidohydrolase  54.43 
 
 
407 aa  402  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  51.4 
 
 
396 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  48.86 
 
 
397 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  49.87 
 
 
397 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  50.13 
 
 
397 aa  400  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  49.87 
 
 
398 aa  397  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1494  hippurate hydrolase  58.09 
 
 
395 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213987  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1808  peptidase  58.09 
 
 
753 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2111  hippurate hydrolase  58.09 
 
 
395 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.216397  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0378  amidohydrolase family protein  58.09 
 
 
395 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0794  hippurate hydrolase  58.09 
 
 
395 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  51.19 
 
 
388 aa  392  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0476  amidohydrolase family protein  58.24 
 
 
395 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.504077  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  48.98 
 
 
396 aa  394  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  50.38 
 
 
404 aa  392  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5896  amidohydrolase  55.38 
 
 
395 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0480348 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  51.72 
 
 
379 aa  390  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0948  peptidase M20D, amidohydrolase  54.87 
 
 
395 aa  390  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  48.99 
 
 
425 aa  388  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5812  peptidase M20D, amidohydrolase  55.5 
 
 
394 aa  387  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.586057  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  52.19 
 
 
396 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  48.85 
 
 
397 aa  387  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  48.49 
 
 
402 aa  388  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2871  peptidase M20D, amidohydrolase  53.35 
 
 
391 aa  384  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5220  amidohydrolase  51.52 
 
 
393 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  47.03 
 
 
423 aa  383  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5419  peptidase, M20D subfamily  52.93 
 
 
393 aa  384  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.880964 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  49.62 
 
 
403 aa  382  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  47.33 
 
 
398 aa  381  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1302  amidohydrolase  55.78 
 
 
409 aa  380  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.580399  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  47.72 
 
 
397 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3600  peptidase M20D, amidohydrolase  55.03 
 
 
395 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5516  amidohydrolase  55.03 
 
 
395 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>