60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4077 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4077  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  317  3.9999999999999996e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.302325  normal  0.129343 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1652  hypothetical protein  56.77 
 
 		 158 aa  168  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2285  protein of unknown function DUF847  53.55 
 
 		 160 aa  164  4e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.249746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0491  hypothetical protein  49.36 
 
 		 160 aa  152  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.494407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6144  hypothetical protein  48.39 
 
 		 160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.550355 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4030  protein of unknown function DUF847  47.44 
 
 		 160 aa  143  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.788419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1650  hypothetical protein  41.1 
 
 		 269 aa  111  5e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0578979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1604  hypothetical protein  41.1 
 
 		 269 aa  110  5e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000491659  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0826  hypothetical protein  41.1 
 
 		 269 aa  110  6e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000568663  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3175  hypothetical protein  47.83 
 
 		 290 aa  110  8.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0236568 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4298  protein of unknown function DUF847  42.04 
 
 		 213 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3888  protein of unknown function DUF847  42.68 
 
 		 212 aa  108  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2437  protein of unknown function DUF847  41.77 
 
 		 213 aa  104  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5041  protein of unknown function DUF847  41.14 
 
 		 214 aa  102  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2014  protein of unknown function DUF847  40.76 
 
 		 213 aa  101  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6576  protein of unknown function DUF847  44.3 
 
 		 191 aa  100  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4087  hypothetical protein  40.12 
 
 		 209 aa  100  8e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.114514  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3382  protein of unknown function DUF847  41.82 
 
 		 304 aa  100  9e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2597  protein of unknown function DUF847  40.13 
 
 		 213 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5744  protein of unknown function DUF847  39.24 
 
 		 214 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0617  protein of unknown function DUF847  38.61 
 
 		 214 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7310  protein of unknown function DUF847  44.03 
 
 		 191 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1717  hypothetical protein  37.78 
 
 		 189 aa  94.4  6e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0666  hypothetical protein  42.64 
 
 		 179 aa  91.7  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2985  hypothetical protein  37.74 
 
 		 171 aa  90.5  7e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.704918  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1027  hypothetical protein  36.36 
 
 		 180 aa  89.7  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0339083 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2370  hypothetical protein  35.9 
 
 		 252 aa  89.4  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672652  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1323  hypothetical protein  33.71 
 
 		 180 aa  84.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.337716 
 
 
-
 
NC_004310  BR0856  hypothetical protein  35.26 
 
 		 253 aa  84  7e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0848  hypothetical protein  35.26 
 
 		 253 aa  84  7e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0666  hypothetical protein  37.76 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00221115  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0771  hypothetical protein  37.76 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0726932  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0674  hypothetical protein  36.72 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0018  hypothetical protein  39.34 
 
 		 177 aa  79  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.88968 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0570  hypothetical protein  38.61 
 
 		 205 aa  78.2  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0018  hypothetical protein  38.52 
 
 		 177 aa  77.4  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0017  hypothetical protein  38.52 
 
 		 177 aa  77.4  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.413407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0018  hypothetical protein  38.52 
 
 		 177 aa  77.4  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.931727  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7163  hypothetical protein  35.19 
 
 		 173 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0984  secretion activator protein, putative  36.94 
 
 		 220 aa  73.9  0.0000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0018  hypothetical protein  37.29 
 
 		 173 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.377986  normal  0.533928 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3063  protein of unknown function DUF847  34.59 
 
 		 260 aa  68.2  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3784  XRE family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000271514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3975  hypothetical protein  36.75 
 
 		 203 aa  63.9  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.620659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3868  hypothetical protein  34 
 
 		 575 aa  62.8  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.845697  normal  0.696464 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0723  protein of unknown function DUF847  26.92 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.711054  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1871  hypothetical protein  37.19 
 
 		 185 aa  61.2  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2671  hypothetical protein  31.91 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0900  hypothetical protein  31.06 
 
 		 203 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0605553 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1963  hypothetical protein  32.32 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1757  hypothetical protein  31.45 
 
 		 203 aa  57  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3374  hypothetical protein  30.82 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.998278  normal  0.344579 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2137  hypothetical protein  33.92 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.330275  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4946  hypothetical protein  34.43 
 
 		 225 aa  53.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1125  hypothetical protein  30.4 
 
 		 202 aa  50.8  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1590  hypothetical protein  30 
 
 		 203 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0864583 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2944  hypothetical protein  30.51 
 
 		 203 aa  48.9  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1584  hypothetical protein  25.55 
 
 		 185 aa  47.8  0.00005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.232051  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2334  hypothetical protein  30.4 
 
 		 203 aa  47.4  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.336603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0276  hypothetical protein  23.91 
 
 		 195 aa  45.1  0.0004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>