105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3901 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3901  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  261  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0698239  normal  0.0160769 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0463  hypothetical protein  72.73 
 
 		 130 aa  175  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.572887  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2593  protein of unknown function DUF1232  67.24 
 
 		 130 aa  161  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2979  hypothetical protein  51.26 
 
 		 142 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.263138  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1439  hypothetical protein  55.65 
 
 		 131 aa  125  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0873  protein of unknown function DUF1232  52.17 
 
 		 124 aa  120  7e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0685526 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1795  hypothetical protein  51.72 
 
 		 130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1269  hypothetical protein  50 
 
 		 132 aa  113  7.999999999999999e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5698  hypothetical protein  46.72 
 
 		 386 aa  107  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3856  hypothetical protein  48.28 
 
 		 124 aa  106  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0230903  normal  0.0305359 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2863  hypothetical protein  48.15 
 
 		 114 aa  103  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0874191  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4882  protein of unknown function DUF1232  45.87 
 
 		 129 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0592  hypothetical protein  55.17 
 
 		 137 aa  100  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632584  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1309  hypothetical protein  44.74 
 
 		 133 aa  100  9e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  46.08 
 
 		 386 aa  99.8  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3871  hypothetical protein  47.86 
 
 		 125 aa  99.4  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3605  hypothetical protein  49.47 
 
 		 118 aa  97.8  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134025  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1462  protein of unknown function DUF1232  45.67 
 
 		 126 aa  97.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.583508  normal  0.293258 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1363  protein of unknown function DUF1232  45.67 
 
 		 126 aa  97.1  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00386396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2189  hypothetical protein  51.38 
 
 		 126 aa  95.1  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124091  hitchhiker  0.000597226 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0754  hypothetical protein  47.32 
 
 		 128 aa  93.6  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2623  hypothetical protein  44.54 
 
 		 126 aa  90.9  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000252463  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3216  hypothetical protein  44.44 
 
 		 111 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.944113  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2543  hypothetical protein  64.62 
 
 		 75 aa  86.3  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3485  protein of unknown function DUF1232  42.74 
 
 		 127 aa  86.3  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0941  hypothetical protein  40 
 
 		 133 aa  84  6e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000582601  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1552  protein of unknown function DUF1232  43.68 
 
 		 121 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000451461  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0560  hypothetical protein  55.81 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0456  protein of unknown function DUF1232  32.48 
 
 		 127 aa  81.3  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3301  hypothetical protein  46.72 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0793  hypothetical protein  44.55 
 
 		 97 aa  75.9  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.569474  normal  0.129325 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1449  hypothetical protein  58.23 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.808576  normal  0.132901 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2654  protein of unknown function DUF1232  46.72 
 
 		 120 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.140494  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1079  hypothetical protein  44.74 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2241  hypothetical protein  39.51 
 
 		 89 aa  72  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0559618 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2502  hypothetical protein  42.7 
 
 		 97 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1695  protein of unknown function DUF1232  38.71 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1980  protein of unknown function DUF1232  40.7 
 
 		 98 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.55739  normal  0.731004 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2380  protein of unknown function DUF1232  39.53 
 
 		 98 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.658738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1977  hypothetical protein  44.76 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.284202 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3740  uncharacterized small membrane protein  40.96 
 
 		 94 aa  66.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0024  protein of unknown function DUF1232  38.96 
 
 		 87 aa  64.7  0.0000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1308  hypothetical protein  37.21 
 
 		 97 aa  63.9  0.0000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.525865  normal  0.365373 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2926  hypothetical protein  44.3 
 
 		 91 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828389  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2183  hypothetical protein  40.91 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.697444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4012  hypothetical protein  43.04 
 
 		 91 aa  60.8  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3716  hypothetical protein  35.44 
 
 		 103 aa  58.5  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270803 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0289  hypothetical protein  27.88 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3332  hypothetical protein  28.28 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0318  hypothetical protein  27.88 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3867  hypothetical protein  27.18 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01225  hypothetical protein  48.89 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.115092  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2657  hypothetical protein  29.47 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90763  hitchhiker  0.00677971 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1386  hypothetical protein  33.78 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3655  hypothetical protein  27.88 
 
 		 116 aa  51.2  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4080  hypothetical protein  26.21 
 
 		 117 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0280  hypothetical protein  31.46 
 
 		 117 aa  50.8  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4167  hypothetical protein  26.21 
 
 		 116 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3972  protein of unknown function DUF1232  26.21 
 
 		 116 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0363  hypothetical protein  38.46 
 
 		 80 aa  50.4  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.029871 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0277  protein of unknown function DUF1232  29.47 
 
 		 134 aa  50.1  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0145  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4049  hypothetical protein  25.96 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3677  hypothetical protein  26.21 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0234  hypothetical protein  29.07 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.74255 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0999  hypothetical protein  35.29 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.178423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0383  hypothetical protein  29.41 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05801  hypothetical protein  34.85 
 
 		 121 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1034  hypothetical protein  42.31 
 
 		 150 aa  46.2  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.383392  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0407  hypothetical protein  34.62 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.38857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4217  hypothetical protein  28.09 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2537  protein of unknown function DUF1232  34.78 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.36697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2278  protein of unknown function DUF1232  33.82 
 
 		 151 aa  45.4  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0751  hypothetical protein  40.32 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18241  hypothetical protein  27.96 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0694351 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3628  hypothetical protein  29.27 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.89928  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1330  protein of unknown function DUF1232  31.25 
 
 		 96 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0836  hypothetical protein  58.33 
 
 		 167 aa  43.9  0.0007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.202842 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1508  protein of unknown function DUF1232  55.26 
 
 		 133 aa  43.5  0.0009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.987063  normal  0.0931118 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0858  hypothetical protein  55.56 
 
 		 171 aa  43.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4803  hypothetical protein  30.53 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.162553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3727  protein of unknown function DUF1232  31.33 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.883988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4460  protein of unknown function DUF1232  50 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1882  protein of unknown function DUF1232  42.59 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0407  protein of unknown function DUF1232  26.88 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0363693  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4050  protein of unknown function DUF1232  31.33 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1826  hypothetical protein  27.85 
 
 		 139 aa  42  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2808  hypothetical protein  27.71 
 
 		 126 aa  42  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2125  hypothetical protein  38.64 
 
 		 144 aa  41.6  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.836422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0098  hypothetical protein  30.12 
 
 		 124 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0842  protein of unknown function DUF1232  33.33 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.101011 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2613  hypothetical protein  53.85 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1295  protein of unknown function DUF1232  42.62 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2908  protein of unknown function DUF1232  40.48 
 
 		 152 aa  40.8  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3765  hypothetical protein  34.21 
 
 		 121 aa  40.8  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000021606  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0012  hypothetical protein  35.85 
 
 		 121 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5352  hypothetical protein  38.6 
 
 		 121 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00015826  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5607  hypothetical protein  38.6 
 
 		 121 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000035022  hitchhiker  2.94963e-24 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0426  hypothetical protein  41.86 
 
 		 50 aa  40.4  0.008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4573  hypothetical protein  44.68 
 
 		 99 aa  40  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>