49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2766 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2766  hypothetical protein  100 
 
 		 384 aa  770    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.391487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0487  hypothetical protein  59.18 
 
 		 388 aa  413  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1837  hypothetical protein  40.29 
 
 		 384 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0245984  normal  0.0224069 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2036  hypothetical protein  40.86 
 
 		 379 aa  222  7e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00898362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2888  hypothetical protein  39.18 
 
 		 354 aa  209  8e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.195659  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.15 
 
 		 1016 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5253  hypothetical protein  38.57 
 
 		 419 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.462445 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1075  protein of unknown function DUF1555  40.72 
 
 		 410 aa  186  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1104  protein of unknown function DUF1555  40 
 
 		 410 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.915613  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  36.89 
 
 		 1844 aa  173  5e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3774  hypothetical protein  34.26 
 
 		 389 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0187  hypothetical protein  32.98 
 
 		 396 aa  171  3e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0631  hypothetical protein  34.09 
 
 		 376 aa  167  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4864  hypothetical protein  32.58 
 
 		 394 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.019631  unclonable  0.000000201965 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5061  hypothetical protein  34 
 
 		 381 aa  162  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0250139  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1424  hypothetical protein  34.15 
 
 		 399 aa  161  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0154311  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0310  hypothetical protein  31.91 
 
 		 345 aa  160  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.187979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3038  hypothetical protein  32.2 
 
 		 387 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.79094 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3451  hypothetical protein  31.74 
 
 		 404 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.332754  normal  0.721306 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2778  hypothetical protein  31.74 
 
 		 404 aa  137  4e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.962875  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4386  hypothetical protein  31.58 
 
 		 390 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.47419 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2644  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.73 
 
 		 383 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.465109 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3472  hypothetical protein  30.73 
 
 		 383 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1022  hypothetical protein  33.33 
 
 		 401 aa  124  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.924972  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08866  hypothetical protein  29.97 
 
 		 363 aa  117  3.9999999999999997e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2281  hypothetical protein  30.35 
 
 		 344 aa  114  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1103  protein of unknown function DUF1555  30.43 
 
 		 501 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428306  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1074  protein of unknown function DUF1555  30.43 
 
 		 501 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1903  hypothetical protein  29.01 
 
 		 494 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000927643 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0293  lipoprotein  27.42 
 
 		 348 aa  68.2  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.851518  normal  0.0926992 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6147  hypothetical protein  27.34 
 
 		 494 aa  67  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1211  hypothetical protein  29.26 
 
 		 504 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.816612  normal  0.530795 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0365  hypothetical protein  26.04 
 
 		 469 aa  56.6  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.058637  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2717  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.86 
 
 		 657 aa  56.2  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.814877 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2094  hypothetical protein  25 
 
 		 451 aa  51.6  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0022  hypothetical protein  26.69 
 
 		 297 aa  50.8  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4474  hypothetical protein  23.7 
 
 		 330 aa  50.4  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0032  hypothetical protein  25.38 
 
 		 296 aa  49.7  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2288  hypothetical protein  27.17 
 
 		 318 aa  48.9  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4265  hypothetical protein  25.32 
 
 		 429 aa  49.7  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223589  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1822  hypothetical protein  23.55 
 
 		 451 aa  48.5  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.430536  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1364  hypothetical protein  25.08 
 
 		 283 aa  47.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3554  hypothetical protein  27.91 
 
 		 466 aa  46.6  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2660  hypothetical protein  25.51 
 
 		 322 aa  45.4  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0986775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3119  phytase  22.59 
 
 		 998 aa  45.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.446959 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  23.11 
 
 		 1175 aa  44.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2664  hypothetical protein  24.2 
 
 		 308 aa  44.3  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4033  hypothetical protein  23.34 
 
 		 512 aa  43.9  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104579  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2092  outer membrane autotransporter  26.7 
 
 		 854 aa  42.7  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.142102  normal  0.0191912 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>