More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2459 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2459  peptide chain release factor H  100 
 
 		 199 aa  407  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.321859  normal  0.956081 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3902  peptide chain release factor H  46.92 
 
 		 218 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0189567 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0290  peptide chain release factor-like protein  43.22 
 
 		 204 aa  162  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.127156 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3597  peptide chain release factor-like protein  45.81 
 
 		 207 aa  162  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0263  peptide chain release factor-like protein  44.72 
 
 		 204 aa  160  8.000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0268  peptide chain release factor-like protein  44.72 
 
 		 204 aa  160  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0233  peptide chain release factor-like protein  44.72 
 
 		 204 aa  160  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01750  peptide chain release factor-like protein  48.26 
 
 		 207 aa  158  5e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.132154  normal  0.46874 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4861  peptide chain release factor-like protein  44.95 
 
 		 204 aa  157  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0755731 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0364  peptide chain release factor-like protein  42 
 
 		 204 aa  156  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.429875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0349  peptide chain release factor-like protein  42 
 
 		 204 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0332  putative peptide chain release factor  42.45 
 
 		 248 aa  155  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0662498 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0345  peptide chain release factor-like protein  41.5 
 
 		 204 aa  154  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.196976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0354  peptide chain release factor-like protein  41.5 
 
 		 204 aa  154  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0356  peptide chain release factor-like protein  41.5 
 
 		 204 aa  154  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000967755 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3439  peptide chain release factor-like protein  45.5 
 
 		 207 aa  151  5e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.3707  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72200  peptide chain release factor-like protein  46.04 
 
 		 204 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3371  peptide chain release factor H  46.06 
 
 		 178 aa  135  4e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3456  peptide chain release factor-like protein  36.63 
 
 		 229 aa  132  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0652118  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00231  peptide chain release factor 2  45.95 
 
 		 166 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00234  hypothetical protein  45.95 
 
 		 166 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0281  peptide chain release factor-like protein  45.95 
 
 		 166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.568314 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7272  peptide chain release factor-like protein  35.75 
 
 		 210 aa  124  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000014386  normal  0.97905 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3282  peptide chain release factor H  35.82 
 
 		 204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.434629  normal  0.0508518 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0242  peptide chain release factor-like protein  34.01 
 
 		 219 aa  104  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0760  peptide chain release factor H  29.41 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2039  class I peptide chain release factor  34.63 
 
 		 202 aa  96.3  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0838  peptide chain release factor 2  31.68 
 
 		 325 aa  89  4e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0819  peptide chain release factor 2  34.92 
 
 		 349 aa  87.8  9e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0834  peptide chain release factor 2  33.86 
 
 		 349 aa  85.5  5e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1449  peptide chain release factor 2  33.86 
 
 		 359 aa  84.7  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.768033 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0456  peptide chain release factor 2  37.43 
 
 		 338 aa  83.2  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.454858  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1124  class I peptide chain release factor domain-containing protein  36.94 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0397  peptide chain release factor 2  37.43 
 
 		 302 aa  83.6  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0796  peptide chain release factor 2  36.05 
 
 		 354 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.570581  normal  0.0161038 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1786  peptide chain release factor 2  33.14 
 
 		 317 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000314162  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  33.51 
 
 		 372 aa  82.4  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0049  peptide chain release factor 2  32.16 
 
 		 291 aa  82  0.000000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  33.73 
 
 		 372 aa  81.3  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2844  peptide chain release factor 2  33.91 
 
 		 325 aa  81.3  0.000000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02770  Protein chain release factor B, RF-2  29.41 
 
 		 282 aa  80.9  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0501014  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  30.05 
 
 		 367 aa  80.5  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16430  peptide chain release factor 2  29.69 
 
 		 331 aa  80.5  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000953459  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1409  peptide chain release factor 2  35.54 
 
 		 330 aa  80.9  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0056831  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0302  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  29.5 
 
 		 365 aa  80.1  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1030  peptide chain release factor 2 protein  34.91 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.235991  normal  0.771675 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1072  peptide chain release factor 2  33.33 
 
 		 357 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0544  peptide chain release factor 2  28.86 
 
 		 356 aa  80.1  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00703964  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1562  peptide chain release factor 2  33.86 
 
 		 280 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0271557  normal  0.252687 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  32.18 
 
 		 371 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2570  peptide chain release factor 2  33.14 
 
 		 417 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0324776  normal  0.0245297 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004438  peptide chain release factor 2  31 
 
 		 260 aa  79.3  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5555  hypothetical protein  34.32 
 
 		 378 aa  79.7  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.12714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1036  peptide chain release factor 2  33.33 
 
 		 357 aa  79.3  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.178506 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2340  peptide chain release factor 2  30.21 
 
 		 343 aa  79.3  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538916  normal  0.0748941 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1823  peptide chain release factor 2  33.14 
 
 		 374 aa  79.3  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.366518  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0486  peptide chain release factor 2  31.52 
 
 		 349 aa  79.7  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.289866  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02723  peptide chain release factor 2  30.35 
 
 		 365 aa  79.3  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  28.86 
 
 		 362 aa  79  0.00000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3050  peptide chain release factor 2  30.35 
 
 		 365 aa  79  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0895  hypothetical protein  34.32 
 
 		 367 aa  79  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0852209 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0921  peptide chain release factor 2  31.75 
 
 		 349 aa  79  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.181333  normal  0.893084 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0194  peptide chain release factor 2  32.84 
 
 		 299 aa  79.3  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.109294  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0818  peptide chain release factor 2  30.35 
 
 		 365 aa  79.3  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3024  peptide chain release factor 2  30.35 
 
 		 365 aa  79.3  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  33.91 
 
 		 379 aa  79.3  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0648  peptide chain release factor 2  30.24 
 
 		 365 aa  79  0.00000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1360  peptide chain release factor 2  28.92 
 
 		 348 aa  79  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0960  hypothetical protein  34.32 
 
 		 367 aa  79  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0655613 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4596  peptide chain release factor 2  34.12 
 
 		 372 aa  78.6  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1471  peptide chain release factor 2  31.32 
 
 		 349 aa  79  0.00000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1884  peptide chain release factor 2  33.33 
 
 		 459 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344526  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2274  peptide chain release factor 2  33.14 
 
 		 310 aa  78.2  0.00000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  32.37 
 
 		 364 aa  78.2  0.00000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3423  hypothetical protein  30.24 
 
 		 365 aa  78.2  0.00000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0838102  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  33.5 
 
 		 366 aa  77.8  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1963  peptide chain release factor 2  33.16 
 
 		 367 aa  77.8  0.00000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  32.37 
 
 		 362 aa  77.8  0.00000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_509  peptide chain release factor 2  27.86 
 
 		 357 aa  77.8  0.00000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231762  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0801  hypothetical protein  29.85 
 
 		 365 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000691536  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1002  peptide chain release factor 2  32.95 
 
 		 340 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000036065  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1699  peptide chain release factor 2  33.33 
 
 		 367 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822154  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1742  hypothetical protein  30.69 
 
 		 335 aa  77.4  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3112  peptide chain release factor 2  33.33 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.826864  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2722  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  33.33 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2644  peptide chain release factor 2  33.33 
 
 		 367 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2590  peptide chain release factor 2, programmed  33.33 
 
 		 367 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0169  peptide chain release factor 2  28.71 
 
 		 380 aa  77.4  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0400859  normal  0.478253 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1153  peptide chain release factor 2  33.33 
 
 		 248 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449488  normal  0.0907567 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1479  peptide chain release factor 2, programmed  33.33 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2206  peptide chain release factor 2, programmed  33.33 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  35.47 
 
 		 367 aa  77  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1742  hypothetical protein  31.19 
 
 		 335 aa  77  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2135  peptide chain release factor 2  33.33 
 
 		 391 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5423  peptide chain release factor 2  33.33 
 
 		 391 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5960  peptide chain release factor 2  33.33 
 
 		 391 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0813  peptide chain release factor 2  34.3 
 
 		 374 aa  77  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1476  peptide chain release factor 2  29.7 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0780074  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2117  peptide chain release factor 2  33.33 
 
 		 391 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223622  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2027  peptide chain release factor 2  31.75 
 
 		 248 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>