140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2357 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2357  putative phosphatase or phosphodiesterase  100 
 
 		 528 aa  1079    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.338667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2583  alkaline phosphatase  56.15 
 
 		 567 aa  580  1e-164  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13330  hypothetical protein  58.25 
 
 		 520 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0826968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12170  alkaline phosphatase  57.29 
 
 		 519 aa  574  1.0000000000000001e-162  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1200  hypothetical protein  58.25 
 
 		 517 aa  570  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03245  alkaline phosphatase  54.39 
 
 		 523 aa  547  1e-154  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4171  twin-arginine translocation pathway signal  52.45 
 
 		 527 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0796  alkaline phosphatase  53.54 
 
 		 513 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515977  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4480  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  52.27 
 
 		 527 aa  538  1e-151  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2698  twin-arginine translocation pathway signal  49.34 
 
 		 532 aa  510  1e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.145958  normal  0.764483 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4636  putative alkaline phosphatase  51.5 
 
 		 523 aa  504  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0793302 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2721  twin-arginine translocation pathway signal  50.79 
 
 		 516 aa  495  1e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.334702  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0798  Alkaline phosphatase  49.81 
 
 		 539 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2182  alkaline phosphatase  47 
 
 		 526 aa  494  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000857232 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0869  Alkaline phosphatase  48.86 
 
 		 539 aa  490  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.717187  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4231  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  51.83 
 
 		 518 aa  488  1e-136  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2978  alkaline phosphatase  48.5 
 
 		 539 aa  483  1e-135  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0308  twin-arginine translocation pathway signal  52.02 
 
 		 520 aa  481  1e-134  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0250  putative alkaline phosphatase (phoD)  51.43 
 
 		 524 aa  474  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1503  putative alkaline phosphatase (PhoD); putative signal peptide  49.72 
 
 		 522 aa  473  1e-132  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.337641  normal  0.661577 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3867  alkaline phosphatase  50.81 
 
 		 519 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.261965  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4157  secreted alkaline phosphatase protein  48.85 
 
 		 526 aa  470  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0120038  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1011  alkaline phosphatase  50.92 
 
 		 483 aa  467  9.999999999999999e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3488  alkaline phosphatase  49.6 
 
 		 520 aa  457  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.223283  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1057  alkaline phosphatase  47.99 
 
 		 546 aa  450  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1306  putative secreted alkaline phosphatase  48.78 
 
 		 573 aa  444  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2977  alkaline phosphatase  47.07 
 
 		 520 aa  433  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5715  alkaline phosphatase  46.12 
 
 		 514 aa  426  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965084  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1561  Alkaline phosphatase D-related protein  47.98 
 
 		 541 aa  428  1e-118  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3035  alkaline phosphatase  43.41 
 
 		 559 aa  425  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.852878 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17510  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  46.38 
 
 		 547 aa  413  1e-114  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0778784  normal  0.245984 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0221  hypothetical protein  44.83 
 
 		 191 aa  154  4e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1051  Alkaline phosphatase D-related protein  25.13 
 
 		 727 aa  128  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4057  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  27.88 
 
 		 585 aa  117  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3741  twin-arginine translocation pathway signal  28.31 
 
 		 530 aa  108  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.803365  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1386  Alkaline phosphatase  27.16 
 
 		 529 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1784  Alkaline phosphatase  28.51 
 
 		 549 aa  107  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.38087  normal  0.37956 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4130  alkaline phosphatase  26.27 
 
 		 530 aa  107  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3226  Alkaline phosphatase  27.62 
 
 		 516 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1743  alkaline phosphatase  26.97 
 
 		 529 aa  105  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.672786 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1650  Alkaline phosphatase  28.6 
 
 		 520 aa  104  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0908494  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2633  Alkaline phosphatase  25.83 
 
 		 531 aa  103  7e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.702418  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2252  alkaline phosphatase  27.25 
 
 		 522 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00266455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2184  Alkaline phosphatase  26.98 
 
 		 587 aa  102  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1769  Alkaline phosphatase  26.87 
 
 		 555 aa  99  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00994552  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3609  alkaline phosphatase  27.09 
 
 		 582 aa  98.6  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0107894 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0227  Alkaline phosphatase  26.1 
 
 		 532 aa  97.8  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0713623 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1209  alkaline phosphatase  27.62 
 
 		 600 aa  98.2  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.258047 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20330  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  27.71 
 
 		 555 aa  97.8  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.616637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1026  alkaline phosphatase  27.41 
 
 		 511 aa  97.4  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9474  normal  0.149537 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4060  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  26.67 
 
 		 573 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0946  alkaline phosphatase  27.13 
 
 		 525 aa  95.9  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4022  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  26.39 
 
 		 573 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1735  Alkaline phosphatase  26.8 
 
 		 538 aa  95.5  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05495  hypothetical protein  25.05 
 
 		 674 aa  95.9  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.840238  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0893  alkaline phosphatase  26.51 
 
 		 554 aa  95.5  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.20064  normal  0.526833 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5658  Alkaline phosphatase  27.95 
 
 		 596 aa  95.1  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0138  Alkaline phosphatase  27.6 
 
 		 523 aa  94.4  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.407746  normal  0.107382 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1493  Alkaline phosphatase  27.21 
 
 		 531 aa  93.6  8e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563109 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2119  Alkaline phosphatase  29.41 
 
 		 538 aa  92.8  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1045  alkaline phosphatase  24.78 
 
 		 528 aa  92.8  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0707  alkaline phosphatase  25.8 
 
 		 541 aa  93.2  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.537391  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3587  Alkaline phosphatase  26.26 
 
 		 588 aa  92.8  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3596  twin-arginine translocation pathway signal  28.01 
 
 		 587 aa  92.4  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000163132  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0765  alkaline phosphatase  26.36 
 
 		 541 aa  92  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.387118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3654  alkaline phosphatase  26.84 
 
 		 588 aa  92  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3777  alkaline phosphatase  26.54 
 
 		 588 aa  92.4  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1126  Alkaline phosphatase  24.67 
 
 		 529 aa  90.9  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0820  alkaline phosphatase  28.45 
 
 		 589 aa  90.5  7e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4333  alkaline phosphatase  28.86 
 
 		 545 aa  90.1  8e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0499289 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0651  alkaline phosphatase  26.26 
 
 		 588 aa  90.1  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6120  Alkaline phosphatase  26.19 
 
 		 563 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51031  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0806  alkaline phosphatase, putative  28.67 
 
 		 588 aa  88.6  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3287  twin-arginine translocation pathway signal  26.93 
 
 		 585 aa  89  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3573  alkaline phosphatase  26.74 
 
 		 550 aa  89.4  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3819  alkaline phosphatase  27.42 
 
 		 523 aa  88.6  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3547  Alkaline phosphatase  26.24 
 
 		 528 aa  88.2  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.493509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2888  Alkaline phosphatase  27.54 
 
 		 540 aa  88.6  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0055599  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1910  alkaline phosphatase  28.18 
 
 		 523 aa  88.6  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.31807 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3820  alkaline phosphatase  27.95 
 
 		 618 aa  88.2  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00587129  normal  0.244243 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03244  alkaline phosphatase D  26.73 
 
 		 558 aa  88.2  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1294  Alkaline phosphatase  25.59 
 
 		 521 aa  87.8  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.455409  normal  0.583657 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3609  alkaline phosphatase  25.19 
 
 		 576 aa  87.4  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2394  alkaline phosphatase  25.95 
 
 		 540 aa  87.8  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.115123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3482  alkaline phosphatase  26.99 
 
 		 588 aa  87.4  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4801  alkaline phosphatase  25.8 
 
 		 502 aa  87.4  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.447394 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03467  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  26.17 
 
 		 564 aa  87.4  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3312  twin-arginine translocation pathway signal  26.99 
 
 		 588 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1695  Alkaline phosphatase  25.22 
 
 		 534 aa  86.3  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0641  twin-arginine translocation pathway signal  26.99 
 
 		 588 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0910  alkaline phosphatase  26.78 
 
 		 589 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000101698 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2122  Alkaline phosphatase  25.77 
 
 		 531 aa  84.7  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.7149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0348  alkaline phosphatase  25.72 
 
 		 574 aa  84.3  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0979  alkaline phosphatase  32.41 
 
 		 622 aa  82.8  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2635  Alkaline phosphatase  27.03 
 
 		 529 aa  82  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.289906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4228  twin-arginine translocation pathway signal  25.7 
 
 		 535 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.183471  normal  0.403324 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1582  Alkaline phosphatase  25.53 
 
 		 530 aa  82  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.870601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003734  putative alkaline phosphatase  24.68 
 
 		 557 aa  81.3  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.139476  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3516  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  28.03 
 
 		 524 aa  80.9  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.195825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01060  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  26.57 
 
 		 540 aa  80.1  0.00000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>