More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1575 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0615  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.06 
 
 		 745 aa  677    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.685399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4623  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  71.49 
 
 		 770 aa  885    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.408638  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0671  putative twitching motility transmembrane protein  55.39 
 
 		 743 aa  660    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.357708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3351  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  74.15 
 
 		 759 aa  976    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.335724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3187  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  69.91 
 
 		 745 aa  861    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.484204  normal  0.234759 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1575  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 749 aa  1469    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.114033 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3968  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  65.41 
 
 		 777 aa  822    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0103685 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0904  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  77.73 
 
 		 745 aa  1098    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405383 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.33 
 
 		 733 aa  650    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3018  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  72.99 
 
 		 767 aa  1017    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.238689  normal  0.701163 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3575  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  75.99 
 
 		 754 aa  1056    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.946853  normal  0.162427 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1374  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  76.2 
 
 		 759 aa  960    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.43954  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  76.61 
 
 		 692 aa  977    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.534971 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2898  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  76.39 
 
 		 754 aa  1063    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0204496  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0563  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.06 
 
 		 745 aa  676    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.84 
 
 		 733 aa  627  1e-178  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.371682  normal  0.522662 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3896  chemotaxis sensory transducer  50.84 
 
 		 706 aa  536  1e-151  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2549  chemotaxis sensory transducer  44.44 
 
 		 707 aa  459  9.999999999999999e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4989  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.69 
 
 		 686 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4863  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.69 
 
 		 686 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0070905 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5039  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.69 
 
 		 686 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.468878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0475  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.78 
 
 		 686 aa  379  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.178091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5305  chemotaxis sensory transducer  37.61 
 
 		 686 aa  374  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.115158  normal  0.281343 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1245  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.7 
 
 		 543 aa  373  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.403133  normal  0.310409 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.39 
 
 		 678 aa  370  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3691  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.64 
 
 		 704 aa  371  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.02239  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0511  twitching motility protein PilJ  37.09 
 
 		 682 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05360  twitching motility protein PilJ  37.09 
 
 		 682 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3770  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.16 
 
 		 691 aa  363  9e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0491  chemotaxis sensory transducer  38.16 
 
 		 680 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5031  type IV pilus biogenesis protein PilJ  38.01 
 
 		 680 aa  356  8.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01605  pilus biogenesis protein  36.61 
 
 		 678 aa  351  3e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.128934  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3631  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.85 
 
 		 731 aa  344  2.9999999999999997e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.455048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2901  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.31 
 
 		 700 aa  343  5.999999999999999e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.726182  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0128  chemotaxis sensory transducer  56.67 
 
 		 537 aa  342  2e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3086  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.85 
 
 		 678 aa  334  3e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.12197 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1019  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.94 
 
 		 680 aa  330  8e-89  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.58121  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2397  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.87 
 
 		 686 aa  330  8e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.688228 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.17 
 
 		 473 aa  328  3e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0517  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.67 
 
 		 671 aa  326  1e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.104858  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.87 
 
 		 680 aa  323  9.999999999999999e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2156  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.01 
 
 		 575 aa  323  9.999999999999999e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1815  putative chemotaxis sensory transducer  50 
 
 		 475 aa  316  9e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.9 
 
 		 560 aa  310  8e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0237962  normal  0.734928 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2778  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  37.9 
 
 		 1153 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.970502 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  37.9 
 
 		 1153 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1015  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.52 
 
 		 839 aa  208  2e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0741142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2782  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  37.23 
 
 		 902 aa  204  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3745  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.13 
 
 		 852 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0858  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with phytochrome sensor  36.67 
 
 		 1406 aa  192  1e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0185965  normal  0.079214 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3002  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.77 
 
 		 915 aa  190  9e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4950  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.58 
 
 		 975 aa  189  1e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4746  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.57 
 
 		 503 aa  189  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000363987 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0506  chemotaxis sensory transducer  37.46 
 
 		 982 aa  188  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.202983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1064  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  37.65 
 
 		 879 aa  188  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.698769  hitchhiker  0.00000570114 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.23 
 
 		 1079 aa  185  3e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1426  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.57 
 
 		 768 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.541717  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0520  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.97 
 
 		 711 aa  179  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0749  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.78 
 
 		 880 aa  179  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0720  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.78 
 
 		 880 aa  179  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2793  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.53 
 
 		 778 aa  177  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.58 
 
 		 549 aa  177  6e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000597879  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3465  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.11 
 
 		 423 aa  176  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3107  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.76 
 
 		 542 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1425  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.43 
 
 		 787 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.68627  normal  0.569737 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.83 
 
 		 550 aa  174  5.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014913 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4347  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.21 
 
 		 854 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4287  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.21 
 
 		 854 aa  170  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0529  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.08 
 
 		 544 aa  169  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0612  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.05 
 
 		 543 aa  169  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2857  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.04 
 
 		 520 aa  168  4e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000607785  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3778  chemotaxis sensory transducer, phytochrome sensor  36 
 
 		 1100 aa  167  8e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0061  chemotaxis sensory transducer  36.59 
 
 		 752 aa  167  9e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.691552  normal  0.30416 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1029  methyl-accepting chemotaxis protein  34.25 
 
 		 549 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.392996  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3246  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.23 
 
 		 1105 aa  164  4.0000000000000004e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.610597  normal  0.482443 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 540 aa  164  6e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0808523  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.06 
 
 		 544 aa  163  9e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4401  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.29 
 
 		 695 aa  161  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.896591  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.76 
 
 		 570 aa  161  4e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443347 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.14 
 
 		 541 aa  161  4e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  30.62 
 
 		 1142 aa  161  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.380177 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2942  methyl-accepting chemotaxis protein  33.75 
 
 		 544 aa  160  6e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3341  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  30.62 
 
 		 1142 aa  160  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2782  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.23 
 
 		 601 aa  160  9e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.163256  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0400  methyl-accepting chemotaxis protein  35.8 
 
 		 549 aa  159  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1624  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.85 
 
 		 626 aa  160  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.835429  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0909  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.61 
 
 		 754 aa  160  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4055  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  33.9 
 
 		 1781 aa  159  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1033  methyl-accepting chemotaxis protein  33.33 
 
 		 533 aa  159  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2177  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.42 
 
 		 628 aa  159  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4017  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  33.9 
 
 		 1781 aa  159  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.14 
 
 		 564 aa  159  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000139892  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.8 
 
 		 557 aa  158  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2870  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.85 
 
 		 636 aa  158  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1041  methyl-accepting chemotaxis protein  32.43 
 
 		 541 aa  158  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.893443  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0476  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.21 
 
 		 830 aa  158  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0889  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.46 
 
 		 540 aa  158  5.0000000000000005e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0712  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.09 
 
 		 550 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0415  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.6 
 
 		 750 aa  157  5.0000000000000005e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.01 
 
 		 538 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>