More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1060 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_1060  molecular chaperone, HSP70 class  100 
 
 
443 aa  888    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0628  molecular chaperone, HSP70 class  66.42 
 
 
416 aa  533  1e-150  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1409  molecular chaperone, HSP70 class  63.4 
 
 
420 aa  526  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1948  molecular chaperone, Hsp70 class  60.63 
 
 
418 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0757113  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2937  chaperone protein, putative  47.48 
 
 
471 aa  366  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3599  heat shock protein YegD  49.14 
 
 
420 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.638521  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2804  chaperone protein, putative  48.89 
 
 
420 aa  359  4e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.336726  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3623  molecular chaperone, Hsp70 class  48.89 
 
 
420 aa  359  4e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20774  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3173  putative chaperone protein  48.89 
 
 
420 aa  359  4e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0027  putative chaperone protein  48.89 
 
 
420 aa  359  4e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.440282  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1739  putative chaperone protein  48.89 
 
 
420 aa  359  4e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0433  molecular chaperone-like protein  49.38 
 
 
496 aa  359  5e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172906  normal  0.275665 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3610  molecular chaperone, Hsp70 class  48.89 
 
 
577 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0502  molecular chaperone-like protein  48.17 
 
 
416 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2603  molecular chaperone-like  47.92 
 
 
416 aa  355  1e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0567695  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0407  molecular chaperone-like protein  48.64 
 
 
435 aa  354  2e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.172519  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2651  putative heat shock protein  46.94 
 
 
420 aa  353  4e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0740827  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0475  molecular chaperone-like protein  47.9 
 
 
416 aa  353  4e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.342748 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3590  molecular chaperone-like  47.68 
 
 
416 aa  350  2e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2895  molecular chaperone-like protein  48.4 
 
 
422 aa  350  3e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181894  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1795  putative heat shock protein  46.56 
 
 
425 aa  348  1e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.380288 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3529  putative chaperone  48.4 
 
 
416 aa  347  3e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0168986  normal  0.311159 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2728  putative chaperone  48.78 
 
 
422 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141746  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0429  putative chaperone  48.64 
 
 
416 aa  344  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0363549  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4727  molecular chaperone-like protein  43.99 
 
 
423 aa  341  1e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00454686 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4849  dnaK protein, putative  43.99 
 
 
423 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.136541 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4641  HSP70 family protein  43.75 
 
 
421 aa  340  4e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4906  HSP70 family protein  43.99 
 
 
423 aa  340  4e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.767353  hitchhiker  0.00135458 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0576  heat shock protein YegD  43.99 
 
 
424 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.267601  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4441  heat shock protein YegD  43.2 
 
 
421 aa  335  9e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4956  heat shock protein  45.32 
 
 
425 aa  334  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.674531  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4898  heat shock protein YegD  43.17 
 
 
421 aa  333  4e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5657  putative chaperone protein  44.72 
 
 
417 aa  331  1e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0963409 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06860  heat shock protein Hsp70 family  44.71 
 
 
421 aa  330  4e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2228  putative chaperone  46.45 
 
 
416 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00786823  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3100  heat shock protein  44.09 
 
 
417 aa  327  3e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3447  putative heat shock protein  44.58 
 
 
417 aa  326  6e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0639  heat shock protein  44.63 
 
 
417 aa  324  2e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0260  molecular chaperone, Hsp70 class  44.99 
 
 
417 aa  320  3e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.547312 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0682  molecular chaperone-like protein  45.76 
 
 
421 aa  318  9e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.4345 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0508  putative chaperone protein  46.3 
 
 
432 aa  317  3e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00905902 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2203  putative chaperone protein  45.99 
 
 
438 aa  316  5e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1036  putative heat-shock protein HSP 70  43.69 
 
 
418 aa  316  6e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1836  molecular chaperone, HSP70 class  41.95 
 
 
419 aa  315  9e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127585  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64450  putative heat-shock protein  43.51 
 
 
421 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0277  molecular chaperone, HSP70 class  44.19 
 
 
437 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1429  DnaK-type molecular chaperone DnaK  38.26 
 
 
428 aa  308  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.370415 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0352  molecular chaperone, HSP70 class  44.77 
 
 
415 aa  306  3e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0321  molecular chaperone, HSP70 class  44.04 
 
 
415 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0901748  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1532  molecular chaperone, HSP70 class  38.98 
 
 
419 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.868422 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1123  putative chaperone protein (yegD)  42.44 
 
 
419 aa  297  3e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5553  molecular chaperone, HSP70 class  47.22 
 
 
415 aa  296  5e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0927629  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5595  putative heat-shock protein  43.27 
 
 
421 aa  292  9e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1590  molecular chaperone, HSP70 class  43.24 
 
 
415 aa  281  1e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182853  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1020  molecular chaperone, DnaK  37.95 
 
 
420 aa  227  3e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.31559  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3939  molecular chaperone, DnaK  40.24 
 
 
414 aa  227  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0350575  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3200  molecular chaperone, DnaK  40 
 
 
414 aa  223  4e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175793  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4255  molecular chaperone, DnaK  37.26 
 
 
412 aa  217  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.876559  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4252  hypothetical protein  38.85 
 
 
412 aa  212  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271244  normal  0.169706 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4835  putative chaperone  30.4 
 
 
452 aa  200  5e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1384  putative chaperone  30.62 
 
 
454 aa  199  7e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0297823  normal  0.744499 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1764  putative chaperone  31.19 
 
 
450 aa  198  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.475755  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2145  heat shock protein  29.67 
 
 
421 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1622  molecular chaperone-like protein  30.7 
 
 
425 aa  194  3e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1079  molecular chaperone-like protein  32.5 
 
 
425 aa  192  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1521  molecular chaperone-like protein  31.68 
 
 
423 aa  191  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2481  putative chaperone  31.5 
 
 
456 aa  191  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2145  molecular chaperone-like protein  31.59 
 
 
423 aa  191  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1340  putative chaperone  35.87 
 
 
450 aa  190  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.506478  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2787  putative chaperone  31.56 
 
 
456 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1223  putative chaperone  35.87 
 
 
450 aa  190  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3110  putative chaperone  35.87 
 
 
450 aa  190  4e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3761  hypothetical protein  34.25 
 
 
430 aa  188  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.440966  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2523  putative chaperone  31.28 
 
 
455 aa  188  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2603  molecular chaperone-like protein  30.22 
 
 
425 aa  187  4e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3548  putative chaperone  34.69 
 
 
450 aa  182  7e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0999  putative chaperone  30.53 
 
 
450 aa  178  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1974  putative chaperone  34.31 
 
 
457 aa  177  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000699043  hitchhiker  0.00684701 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05559  putative chaperone  30.09 
 
 
450 aa  177  4e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01975  predicted chaperone  32.16 
 
 
450 aa  176  6e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01964  hypothetical protein  32.16 
 
 
450 aa  176  6e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1614  putative chaperone  31.93 
 
 
449 aa  176  8e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001588  putative heat shock protein YegD  29.49 
 
 
450 aa  176  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1134  chaperone protein  33.1 
 
 
418 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.234862  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1572  putative chaperone  32.16 
 
 
450 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0283269  normal  0.675861 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2210  putative chaperone  32.16 
 
 
450 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0991  putative chaperone  32.16 
 
 
450 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.232925 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1588  putative chaperone  32.16 
 
 
450 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2362  putative chaperone  32.16 
 
 
450 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2309  putative chaperone  31.88 
 
 
450 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0566859  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2353  putative chaperone  31.88 
 
 
450 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1163  putative chaperone  31.94 
 
 
450 aa  173  5e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2360  putative chaperone  31.88 
 
 
450 aa  173  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.690731 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6322  hypothetical protein  34.05 
 
 
428 aa  172  7.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1787  putative chaperone  30.87 
 
 
461 aa  172  9e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.572185  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0391  HSP70 family protein  29.81 
 
 
424 aa  172  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.859558  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3007  putative chaperone  32.16 
 
 
450 aa  172  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.559883 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2683  putative chaperone  31.28 
 
 
450 aa  171  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2253  putative chaperone  31.66 
 
 
450 aa  172  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0376  HSP70 family protein  29.79 
 
 
438 aa  171  3e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>