More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1134 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1134  ABC transporter related  100 
 
 
600 aa  1209    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.912379  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3782  ABC transporter related  37.12 
 
 
676 aa  392  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253912  normal  0.646389 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0325  ABC transporter, transmembrane region  38.84 
 
 
746 aa  390  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.771448 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4581  ABC transporter related  37.8 
 
 
613 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1118  ABC transporter, transmembrane region  37.08 
 
 
606 aa  372  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1128  ABC transporter related protein  40.14 
 
 
613 aa  369  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1949  ABC transporter related  40.87 
 
 
600 aa  360  3e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867267  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2900  ABC transporter-like protein protein  37.8 
 
 
749 aa  359  9e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0999643  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3308  ABC transporter related  35.78 
 
 
587 aa  351  2e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.461096 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3122  ABC transporter-like protein protein  36.47 
 
 
609 aa  349  1e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4682  ABC transporter related  35.84 
 
 
597 aa  323  5e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.582137  normal  0.306509 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0347  ABC transporter related  35.34 
 
 
647 aa  322  1.9999999999999998e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.836066 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1482  ATPase  34.04 
 
 
632 aa  313  5.999999999999999e-84  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.412364  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1803  ATPase  36.08 
 
 
649 aa  311  2e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00610246 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0382  ABC transporter related  34.04 
 
 
641 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.588151  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0394  ABC transporter related  32.12 
 
 
610 aa  306  7e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.156666 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0353  ABC transporter related  34.74 
 
 
639 aa  306  7e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0387  ABC transporter-related protein  34.29 
 
 
634 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.112413  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  36.14 
 
 
586 aa  301  2e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0387  lipid A ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.58 
 
 
586 aa  298  2e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1245  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.21 
 
 
587 aa  295  1e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6513  ABC transporter related protein  34.08 
 
 
613 aa  295  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330093  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  35.36 
 
 
617 aa  292  1e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1783  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  34.23 
 
 
588 aa  291  2e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  34.27 
 
 
580 aa  290  4e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1782  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  34.23 
 
 
588 aa  290  7e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  35.78 
 
 
572 aa  289  9e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0235  ABC transporter related protein  34.67 
 
 
577 aa  289  1e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.72 
 
 
586 aa  289  1e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.66 
 
 
586 aa  288  2e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0351  hypothetical protein  34.13 
 
 
611 aa  286  5e-76  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.378963 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1064  ABC transporter, transmembrane region  34.59 
 
 
602 aa  286  5e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.415501  normal  0.35627 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3017  ABC transporter, transmembrane region  34.72 
 
 
602 aa  286  5e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.11 
 
 
600 aa  287  5e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  32.95 
 
 
556 aa  286  5.999999999999999e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  32.28 
 
 
582 aa  286  9e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  35.46 
 
 
586 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0610  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.12 
 
 
587 aa  286  1.0000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.66 
 
 
585 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11248  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
566 aa  286  1.0000000000000001e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.46 
 
 
586 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0985  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  34.3 
 
 
596 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.426098  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.46 
 
 
586 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  35.46 
 
 
586 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.46 
 
 
586 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1596  ABC transporter related  35.78 
 
 
600 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0640452  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3593  ABC transporter related  33.91 
 
 
624 aa  284  3.0000000000000004e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0413499  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  35.79 
 
 
586 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  34.62 
 
 
598 aa  284  4.0000000000000003e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.26 
 
 
586 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0506  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  31.14 
 
 
612 aa  284  4.0000000000000003e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.740474 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2397  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.76 
 
 
574 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.894313  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0971  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.88 
 
 
594 aa  283  8.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2002  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.57 
 
 
574 aa  282  1e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393049  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  35.26 
 
 
586 aa  282  1e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1357  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  34.43 
 
 
575 aa  282  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0328  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.43 
 
 
575 aa  282  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  32.2 
 
 
581 aa  282  1e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0823  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.43 
 
 
596 aa  282  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0152  ABC transporter related  30.51 
 
 
613 aa  282  1e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.273872  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1198  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  34.43 
 
 
575 aa  282  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1045  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.43 
 
 
596 aa  282  1e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.378722  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2200  ABC transporter ATP-binding protein  32.95 
 
 
592 aa  281  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1912  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.43 
 
 
574 aa  282  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0734969  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1207  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  34.43 
 
 
574 aa  282  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  35.24 
 
 
601 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1426  ABC transporter related  35.42 
 
 
600 aa  281  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.484971 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4514  ABC transporter related  36.08 
 
 
600 aa  281  3e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.350646  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0735  lipid transporter ATP-binding/permease protein  33.91 
 
 
582 aa  280  4e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1630  ABC transporter related  31.03 
 
 
608 aa  280  5e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1305  ABC transporter related  32.6 
 
 
598 aa  280  5e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  35.63 
 
 
601 aa  280  5e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  33.65 
 
 
579 aa  279  9e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1331  ABC transporter related  34.9 
 
 
609 aa  279  9e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.134992  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5675  ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.72 
 
 
601 aa  279  9e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.400511  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0988  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.9 
 
 
591 aa  279  1e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1050  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.9 
 
 
609 aa  279  1e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.718087  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0272  ABC transporter related  34.99 
 
 
634 aa  279  1e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  40.71 
 
 
601 aa  277  3e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0115  ABC transporter related  31.75 
 
 
609 aa  277  3e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1960  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  32.95 
 
 
602 aa  277  3e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.281863  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2330  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.33 
 
 
593 aa  278  3e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.273025 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1608  ABC transporter related  34.54 
 
 
600 aa  278  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.645383  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1695  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  33.33 
 
 
623 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.733558  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1021  lipid transporter ATP-binding/permease protein  32.78 
 
 
582 aa  278  3e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.2758  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2307  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.33 
 
 
583 aa  278  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1143  ABC transporter related  33.33 
 
 
565 aa  278  3e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.4551 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  34.5 
 
 
572 aa  277  4e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.98 
 
 
578 aa  277  5e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4067  ABC transporter related  35.42 
 
 
596 aa  276  5e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00142757  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  31.39 
 
 
597 aa  277  5e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  34.42 
 
 
579 aa  276  7e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  35.88 
 
 
582 aa  276  7e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  34.77 
 
 
591 aa  276  8e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.04 
 
 
589 aa  276  8e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4432  ABC transporter related  34.17 
 
 
601 aa  276  9e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  33.97 
 
 
597 aa  276  1.0000000000000001e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5649  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  32.95 
 
 
583 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  32.3 
 
 
618 aa  276  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0990  lipid transporter ATP-binding/permease protein  32.95 
 
 
582 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.796284  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>