More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4214 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4214  Succinate--CoA ligase (ADP-forming)  100 
 
 
403 aa  813    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.281874 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3930  succinyl-CoA synthetase subunit beta  35.43 
 
 
379 aa  206  5e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4569  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.66 
 
 
378 aa  201  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0102197  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3203  succinyl-CoA synthetase subunit beta  34.51 
 
 
379 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2207  succinyl-CoA synthetase subunit beta  34 
 
 
381 aa  200  3.9999999999999996e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.499624 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1367  succinyl-CoA synthetase subunit beta  35.34 
 
 
378 aa  198  1.0000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.913427 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2062  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  33.33 
 
 
384 aa  197  3e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2178  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  36 
 
 
387 aa  195  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.84529  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1026  succinyl-CoA synthetase subunit beta  32.67 
 
 
382 aa  193  4e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000227763  unclonable  8.1657e-23 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0289  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  32.66 
 
 
382 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2500  succinyl-CoA synthetase subunit beta  32.85 
 
 
388 aa  189  5e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.680576  normal  0.0920336 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2086  succinyl-CoA synthetase subunit beta  35.09 
 
 
382 aa  189  5.999999999999999e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0060  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  35.14 
 
 
393 aa  187  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000156365 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1529  succinyl-CoA synthetase subunit beta  31.42 
 
 
382 aa  187  2e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.36808  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1375  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  29.53 
 
 
384 aa  187  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1099  succinyl-CoA synthetase subunit beta  29.8 
 
 
386 aa  187  3e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.367484  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1865  succinyl-CoA synthetase subunit beta  31.92 
 
 
387 aa  186  5e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0610709 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1463  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.16 
 
 
379 aa  186  6e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10969  succinyl-CoA synthetase subunit beta  34.08 
 
 
387 aa  186  7e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.333695 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0438  succinyl-CoA synthetase subunit beta  34 
 
 
381 aa  186  8e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.179512  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4870  succinyl-CoA synthetase subunit beta  31.67 
 
 
387 aa  186  8e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.324541 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2396  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  31.16 
 
 
375 aa  185  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000351393  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1801  succinyl-CoA synthetase subunit beta  32.36 
 
 
389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.198712  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3878  succinyl-CoA synthetase subunit beta  30.77 
 
 
386 aa  184  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000279608  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3687  succinyl-CoA synthetase subunit beta  30.77 
 
 
386 aa  184  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000356944  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3577  succinyl-CoA synthetase subunit beta  30.77 
 
 
386 aa  184  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000022371  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3595  succinyl-CoA synthetase subunit beta  30.77 
 
 
386 aa  184  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000384481  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3883  succinyl-CoA synthetase subunit beta  30.77 
 
 
386 aa  184  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000224565  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3974  succinyl-CoA synthetase subunit beta  30.77 
 
 
386 aa  184  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000205327  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4221  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  34.66 
 
 
396 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.687915  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2577  succinyl-CoA synthetase subunit beta  34.29 
 
 
410 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4707  succinyl-CoA synthetase subunit beta  32.59 
 
 
387 aa  183  6e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4327  succinyl-CoA synthetase subunit beta  32.59 
 
 
387 aa  183  6e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4413  succinyl-CoA synthetase subunit beta  32.59 
 
 
387 aa  183  6e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0284627  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0737  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  30.62 
 
 
385 aa  182  8.000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3686  succinyl-CoA synthetase subunit beta  31.95 
 
 
388 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3934  succinyl-CoA synthetase subunit beta  30.52 
 
 
386 aa  182  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000073061  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2488  succinyl-CoA synthetase subunit beta  30.52 
 
 
386 aa  182  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000281864  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2202  succinyl-CoA synthase, beta subunit  31.22 
 
 
388 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00971799  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2012  succinyl-CoA synthetase subunit beta  31.22 
 
 
388 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1309  succinyl-CoA synthetase subunit beta  30.52 
 
 
386 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000115042  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0397  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  32.84 
 
 
417 aa  181  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.254112  normal  0.0232854 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0646  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.33 
 
 
388 aa  181  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.017874  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3089  Succinate--CoA ligase (ADP-forming)  33.42 
 
 
425 aa  181  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000498843  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1276  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  32.58 
 
 
383 aa  181  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.295759  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43950  succinyl-CoA synthetase subunit beta  31.71 
 
 
388 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0993593  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5543  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  32.03 
 
 
384 aa  181  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.59554 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0651  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.33 
 
 
388 aa  180  4e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.889445  normal  0.431206 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1992  succinyl-CoA synthetase subunit beta  29.56 
 
 
386 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1341  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  32.84 
 
 
387 aa  179  7e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.171512  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0653  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.59 
 
 
388 aa  179  8e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3659  succinyl-CoA synthetase subunit beta  30.02 
 
 
386 aa  178  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0043  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  31.51 
 
 
360 aa  178  1e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4207  Succinate--CoA ligase (ADP-forming)  36.46 
 
 
384 aa  178  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.184517  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1657  succinyl-CoA synthetase subunit beta  31.91 
 
 
382 aa  178  2e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.231909 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1617  succinyl-CoA synthetase subunit beta  31.39 
 
 
388 aa  178  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.133966  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5976  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.33 
 
 
388 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04879  succinyl-CoA synthetase subunit beta  30.34 
 
 
389 aa  178  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.640254  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1267  Succinate--CoA ligase (ADP-forming)  31.31 
 
 
423 aa  177  2e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4186  succinyl-CoA synthetase subunit beta  31.46 
 
 
388 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.146804  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0674  succinyl-CoA synthetase subunit beta  32.36 
 
 
389 aa  177  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1265  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.33 
 
 
400 aa  177  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0200943  normal  0.595801 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3509  succinyl-CoA synthetase subunit beta  31.46 
 
 
388 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.019231  normal  0.863924 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1668  succinyl-CoA synthetase subunit beta  31.46 
 
 
388 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.11525  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3757  succinyl-CoA synthetase subunit beta  31.71 
 
 
388 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2696  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.33 
 
 
388 aa  177  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04270  succinyl-CoA synthetase subunit beta  31.92 
 
 
389 aa  177  4e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2570  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.33 
 
 
388 aa  177  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0813  succinyl-CoA synthetase subunit beta  32.56 
 
 
388 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0275  succinyl-CoA synthetase subunit beta  32.56 
 
 
388 aa  176  6e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0975  succinyl-CoA synthetase subunit beta  32.56 
 
 
388 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0014  succinyl-CoA synthetase subunit beta  32.56 
 
 
388 aa  176  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0817  succinyl-CoA synthetase subunit beta  32.56 
 
 
388 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.357003  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2401  succinyl-CoA synthetase subunit beta  32.56 
 
 
388 aa  176  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2675  succinyl-CoA synthetase subunit beta  32.56 
 
 
388 aa  176  6e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01877  succinyl-CoA synthetase subunit beta  32.03 
 
 
388 aa  176  8e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.527866  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2038  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.33 
 
 
388 aa  176  8e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2678  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.33 
 
 
388 aa  176  8e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.406945  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2649  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.33 
 
 
388 aa  176  8e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2250  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  31.63 
 
 
388 aa  175  9.999999999999999e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.655045 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2714  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.82 
 
 
382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0773834 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3311  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  31.42 
 
 
387 aa  175  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3164  succinyl-CoA synthetase subunit beta  30.83 
 
 
389 aa  175  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.768074  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1943  succinyl-CoA synthetase subunit beta  31.03 
 
 
392 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2912  succinyl-CoA synthetase subunit beta  30.49 
 
 
388 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2037  succinyl-CoA synthetase subunit beta  28.99 
 
 
387 aa  174  2.9999999999999996e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.325125  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2797  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  30.07 
 
 
388 aa  174  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.646018  normal  0.685585 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0319  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  31.91 
 
 
382 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1220  succinyl-CoA synthetase subunit beta  32.77 
 
 
409 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0607  succinyl-CoA synthetase subunit beta  30.17 
 
 
390 aa  173  5e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.409556  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3292  succinyl-CoA synthetase subunit beta  32.3 
 
 
389 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.251012  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2117  succinyl-CoA synthetase subunit beta  29.72 
 
 
387 aa  172  7.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1238  succinyl-CoA synthetase subunit beta  30.73 
 
 
388 aa  172  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.988188  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1146  succinyl-CoA synthetase subunit beta  31.73 
 
 
388 aa  172  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1088  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.24 
 
 
385 aa  172  1e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.226622 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4424  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  32.98 
 
 
387 aa  172  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.780368  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4117  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  33.08 
 
 
395 aa  171  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2966  succinyl-CoA synthetase subunit beta  31.64 
 
 
388 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1386  succinyl-CoA synthetase subunit beta  31.64 
 
 
388 aa  171  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.900778  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1747  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  30.39 
 
 
388 aa  171  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.655584  normal  0.0712805 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>