More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2089 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2089  ABC transporter related protein  100 
 
 
504 aa  988    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558184  normal  0.156772 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4122  ABC transporter related protein  57.84 
 
 
510 aa  528  1e-148  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.885223  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1050  ABC transporter related  51.53 
 
 
510 aa  462  1e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.322688  normal  0.0473655 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2215  ABC transporter related protein  53.39 
 
 
501 aa  452  1.0000000000000001e-126  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2474  ABC transporter related  45.6 
 
 
513 aa  434  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0599981  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  44.11 
 
 
497 aa  434  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  44.58 
 
 
520 aa  422  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  47.88 
 
 
495 aa  421  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3644  ABC transporter related  46.95 
 
 
508 aa  420  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  44.02 
 
 
517 aa  417  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4656  ABC transporter related protein  47.79 
 
 
506 aa  416  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479751 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  44.79 
 
 
515 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3463  ABC transporter related  47.79 
 
 
516 aa  413  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.309481 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  44.6 
 
 
517 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3596  ABC transporter related  44.69 
 
 
509 aa  413  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.979323  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2301  ABC transporter related protein  50.41 
 
 
517 aa  412  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0991802 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  41.84 
 
 
494 aa  409  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3041  ABC transporter related  48.39 
 
 
500 aa  411  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  45.51 
 
 
516 aa  411  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3784  ABC transporter related  46.86 
 
 
506 aa  409  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  hitchhiker  0.00808443 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  47.35 
 
 
508 aa  406  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  45.1 
 
 
514 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  44.29 
 
 
513 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  45.1 
 
 
514 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1212  ABC transporter related  46.34 
 
 
511 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  46.59 
 
 
505 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  45.1 
 
 
514 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.68 
 
 
507 aa  407  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  43.23 
 
 
506 aa  405  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  43.68 
 
 
507 aa  404  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  43.48 
 
 
507 aa  404  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  44.04 
 
 
497 aa  403  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4723  ABC transporter related  46.76 
 
 
506 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.943494  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5684  ABC transporter related  45.67 
 
 
509 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.878529 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.29 
 
 
492 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0885  ABC sugar transporter, ATPase subunit  45.84 
 
 
506 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533742  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1035  ABC sugar transporter, ATPase subunit  46.48 
 
 
516 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.474314  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  47.65 
 
 
498 aa  402  9.999999999999999e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  46.23 
 
 
499 aa  401  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3706  ABC transporter related  44.11 
 
 
506 aa  400  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594267  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0813  ABC transporter related  41.63 
 
 
499 aa  400  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0813  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41.63 
 
 
499 aa  400  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  43.37 
 
 
506 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  45.09 
 
 
514 aa  400  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  39.6 
 
 
496 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3601  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.92 
 
 
508 aa  395  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611963  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0343  ABC transporter related  44.72 
 
 
497 aa  395  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  38.6 
 
 
504 aa  398  1e-109  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4200  ABC transporter related  46.36 
 
 
528 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  40.77 
 
 
503 aa  398  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0157  sugar ABC transporter ATP-binding protein  41.43 
 
 
499 aa  397  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000963677 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0226  ABC transporter related  44.6 
 
 
503 aa  393  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.973654  normal  0.104566 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4341  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  43.43 
 
 
544 aa  392  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1825  ABC transporter related  46.15 
 
 
505 aa  394  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0788496  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  41.84 
 
 
494 aa  393  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  43.15 
 
 
501 aa  392  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  43.64 
 
 
506 aa  394  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1760  ribose ABC transporter ATP-binding protein  41.97 
 
 
496 aa  392  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.185473  hitchhiker  0.0000761209 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  43.15 
 
 
524 aa  394  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0501  ABC transporter related  43.29 
 
 
511 aa  392  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548503 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  43.46 
 
 
523 aa  389  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  45.21 
 
 
508 aa  390  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  45.66 
 
 
512 aa  390  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  42.48 
 
 
513 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1612  ABC transporter related  41.77 
 
 
496 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  39.31 
 
 
492 aa  392  1e-107  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1508  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.77 
 
 
496 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.106354  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  42.07 
 
 
513 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0380  ABC transporter related  43.03 
 
 
544 aa  390  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1986  ABC transporter related  40.89 
 
 
501 aa  389  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.437257  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3699  ABC transporter related protein  43.4 
 
 
510 aa  390  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92688  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3235  ABC transporter related  41.75 
 
 
506 aa  386  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.365394  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  44.76 
 
 
519 aa  388  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1653  ABC transporter related  46.4 
 
 
519 aa  387  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0555167  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  45.56 
 
 
512 aa  387  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  42.28 
 
 
501 aa  382  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  42.28 
 
 
501 aa  383  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  43.55 
 
 
518 aa  384  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  42.28 
 
 
501 aa  382  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2246  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.17 
 
 
511 aa  383  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000548441 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3182  ABC transporter related  44.24 
 
 
518 aa  385  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.868778  normal  0.140125 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2904  ABC transporter related  40.7 
 
 
503 aa  384  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  42.28 
 
 
501 aa  382  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  44.02 
 
 
514 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  44.56 
 
 
512 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3548  ABC transporter related  45.34 
 
 
506 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650239  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  45.14 
 
 
513 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12280  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  46.58 
 
 
505 aa  382  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.171798  normal  0.428152 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  46.23 
 
 
504 aa  385  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4245  D-ribose transporter ATP binding protein  42.48 
 
 
501 aa  385  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0036959 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4819  ABC transporter related  45.34 
 
 
506 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0757413  normal  0.247948 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  44.56 
 
 
512 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4850  ABC transporter related  42.68 
 
 
503 aa  385  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616228  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  42.28 
 
 
501 aa  383  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.159229 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  42.28 
 
 
501 aa  383  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5464  ABC transporter related  45.34 
 
 
506 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.146779 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  42.02 
 
 
501 aa  382  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3073  ABC transporter related  43.18 
 
 
508 aa  382  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7809  ABC transporter related  41.44 
 
 
512 aa  381  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09550  ABC transporter related  40.53 
 
 
500 aa  381  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.58805  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>