More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1472 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1472  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
334 aa  667    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0018885  normal  0.965057 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3528  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.63 
 
 
327 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.047646  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.24 
 
 
326 aa  377  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.83 
 
 
327 aa  370  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3232  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.37 
 
 
343 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13505  dTDP-glucose-4,6-dehydratase  49.04 
 
 
364 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50 
 
 
323 aa  266  4e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2126  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.83 
 
 
325 aa  257  2e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.54 
 
 
289 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.950966 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0595  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.25 
 
 
297 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3111  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.01 
 
 
273 aa  177  3e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0181663 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3538  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.93 
 
 
297 aa  149  5e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.838406  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4287  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  35.67 
 
 
297 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.018546 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.1 
 
 
303 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.59 
 
 
282 aa  99  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.858296  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6347  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  30.61 
 
 
330 aa  92.4  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.33 
 
 
335 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0539  hypothetical protein  27.06 
 
 
328 aa  87  4e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2586  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.08 
 
 
334 aa  84  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000232422 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2418  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.63 
 
 
296 aa  84  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2654  UDP-glucose 4-epimerase  30.37 
 
 
329 aa  82.8  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.933262  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.64 
 
 
296 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1589  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.17 
 
 
313 aa  80.9  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000469702  normal  0.717874 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2645  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.4 
 
 
326 aa  80.1  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.42 
 
 
333 aa  80.1  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0894  NAD dependent epimerase/dehydratase family  30.29 
 
 
331 aa  79.3  0.00000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0368  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.61 
 
 
347 aa  79.3  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0497868  normal  0.291666 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1121  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  30.29 
 
 
330 aa  79.3  0.00000000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4115  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  33.17 
 
 
346 aa  79  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0560376  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2821  UDP-glucose 4-epimerase  34.68 
 
 
332 aa  79  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3861  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  34.17 
 
 
350 aa  78.6  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.646368 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.6 
 
 
300 aa  78.6  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.386325 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2121  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  34.17 
 
 
345 aa  79  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.147251  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.22 
 
 
315 aa  78.6  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.113189  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1066  UDP-glucose 4-epimerase  32.97 
 
 
335 aa  77.8  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0920176  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.97 
 
 
375 aa  78.6  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.688935  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0370  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.39 
 
 
326 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0420  UDP-glucose 4-epimerase  32.76 
 
 
328 aa  77.4  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2242  UDP-glucose 4-epimerase  37.08 
 
 
334 aa  77.4  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.558956  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0055  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.02 
 
 
349 aa  77.4  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.95 
 
 
320 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.974335  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0119  UDP-glucose 4-epimerase  28.83 
 
 
328 aa  77.4  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.500269  hitchhiker  0.00370533 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.88 
 
 
346 aa  77  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1509  UDP-glucose 4-epimerase  29.78 
 
 
326 aa  77  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0386563  normal  0.0493544 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1718  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.52 
 
 
373 aa  77  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192134  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1030  UDP-glucose 4-epimerase  32.97 
 
 
335 aa  77  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2149  UDP-glucose 4-epimerase  32.42 
 
 
335 aa  76.6  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.83 
 
 
334 aa  76.6  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.225556  normal  0.379661 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1583  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.85 
 
 
330 aa  76.6  0.0000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14111  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.17 
 
 
335 aa  76.6  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0611432  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.83 
 
 
310 aa  76.6  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1217  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  30.99 
 
 
308 aa  76.3  0.0000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22780  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  25.55 
 
 
318 aa  76.3  0.0000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0524  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.05 
 
 
332 aa  76.3  0.0000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.19 
 
 
317 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.22 
 
 
320 aa  75.9  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.04011 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1513  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  31.07 
 
 
323 aa  75.1  0.000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.51 
 
 
342 aa  75.1  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.538907  hitchhiker  0.000599316 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3289  UDP-glucose 4-epimerase  27.36 
 
 
330 aa  75.9  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06090  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  30.18 
 
 
330 aa  75.5  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262708  normal  0.550779 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0394  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  31.07 
 
 
323 aa  75.9  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.286083  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0652  UDP-galactose 4-epimerase  36.57 
 
 
328 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276662  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  33.71 
 
 
324 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  29.31 
 
 
328 aa  74.7  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2305  UDP-glucose 4-epimerase  36.78 
 
 
328 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.738706  normal  0.125833 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5888  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.39 
 
 
268 aa  74.3  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1183  UDP-glucose 4-epimerase  36 
 
 
351 aa  73.9  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.119771  normal  0.642661 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0867  UDP-galactose 4-epimerase  34.66 
 
 
329 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640943  normal  0.227397 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.84 
 
 
292 aa  73.9  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1920  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.88 
 
 
346 aa  73.2  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.892292  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.9 
 
 
309 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0956  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  35.11 
 
 
344 aa  73.2  0.000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.417373  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2048  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
304 aa  73.2  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0367  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.6 
 
 
340 aa  73.2  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134105  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2946  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.76 
 
 
346 aa  73.2  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0355882  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.2 
 
 
292 aa  72.8  0.000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060465  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0130  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
347 aa  72.8  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.116782  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.94 
 
 
298 aa  72.8  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0580  UDP-glucose 4-epimerase  35.63 
 
 
328 aa  72.8  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.127614  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0628  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.64 
 
 
334 aa  72.8  0.000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2509  UDP-glucose 4-epimerase  31.21 
 
 
329 aa  72  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4724  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  34.55 
 
 
330 aa  72.4  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3117  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.38 
 
 
326 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  27.16 
 
 
337 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.46 
 
 
343 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0337048 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2146  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  32.61 
 
 
308 aa  72  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.478357  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  29.72 
 
 
327 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0751  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.39 
 
 
323 aa  71.6  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.566643 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8193  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  35.11 
 
 
338 aa  71.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2799  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  34.74 
 
 
336 aa  71.6  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0141685  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.91 
 
 
406 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.52 
 
 
349 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.14 
 
 
312 aa  71.6  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2973  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.38 
 
 
326 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0279  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.74 
 
 
285 aa  71.6  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4859  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.12 
 
 
336 aa  71.6  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.417628  normal  0.311096 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.13 
 
 
309 aa  71.2  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000231351  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4078  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  31.66 
 
 
346 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29374  normal  0.0761668 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12401  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.75 
 
 
333 aa  71.2  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.509931  hitchhiker  0.00693738 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0070  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.65 
 
 
338 aa  71.6  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.214439  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>