More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0566 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0566  dehydrogenase E1 component  100 
 
 
666 aa  1304    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0587  dehydrogenase E1 component  55.16 
 
 
680 aa  647    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3049  transketolase, central region  55.93 
 
 
617 aa  626  1e-178  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2596  dehydrogenase, E1 component  40.77 
 
 
669 aa  395  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.817741  hitchhiker  0.000871115 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3081  dehydrogenase, E1 component  38.67 
 
 
675 aa  378  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0845423  normal  0.132557 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1486  dehydrogenase E1 component  38.65 
 
 
657 aa  355  2e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.004553  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0808  dehydrogenase E1 component  34.98 
 
 
659 aa  351  2e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.222813  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3824  dehydrogenase E1 component  33.13 
 
 
659 aa  336  7e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.200241  normal  0.786023 
 
 
-
 
NC_002620  TC0618  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, alpha and beta subunit  34.98 
 
 
678 aa  333  5e-90  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0419  Transketolase central region  30.97 
 
 
791 aa  324  3e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0246116  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3183  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, alpha and beta fusion  31.91 
 
 
659 aa  323  5e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.954931 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2840  dehydrogenase, E1 component  32.33 
 
 
658 aa  323  5e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.479964  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10943  putative oxidoreductase  31.99 
 
 
668 aa  310  4e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.345452  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0991  dehydrogenase E1 component  34.88 
 
 
710 aa  310  6.999999999999999e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.892178  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2114  Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  34.64 
 
 
726 aa  300  5e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0490286  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2793  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  35.44 
 
 
702 aa  298  3e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4454  dehydrogenase, E1 component  34.75 
 
 
726 aa  294  4e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4204  transketolase central region  34.56 
 
 
694 aa  286  7e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.578732  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3319  Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  33.53 
 
 
724 aa  284  5.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0163319  hitchhiker  0.00280093 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2782  pyruvate dehydrogenase complex, E1 beta subunit  30.23 
 
 
727 aa  281  3e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.653166 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1571  dehydrogenase E1 component  33.29 
 
 
728 aa  280  4e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0032  acetoin dehydrogenase, alpha/beta subunit, putative  32.7 
 
 
729 aa  278  3e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3038  transketolase central region  45.89 
 
 
325 aa  278  3e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0094  Transketolase central region  45.03 
 
 
328 aa  276  1.0000000000000001e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0029  putative acetoin dehydrogenase, alpha/beta subunit  32.41 
 
 
729 aa  272  2e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0851607  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0091  Transketolase central region  45.31 
 
 
324 aa  271  2e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0582  dehydrogenase E1 component  33.33 
 
 
714 aa  271  2.9999999999999997e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173012  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2096  Transketolase central region  45.2 
 
 
327 aa  270  7e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1786  dehydrogenase, E1 component  31.36 
 
 
736 aa  270  8.999999999999999e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4116  transketolase central region  47.52 
 
 
332 aa  269  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0266  Transketolase central region  43.21 
 
 
327 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2304  Transketolase central region  43.21 
 
 
327 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0028  Transketolase central region  43.22 
 
 
327 aa  265  2e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3771  Transketolase central region  43.22 
 
 
327 aa  265  2e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2034  transketolase domain protein  46.27 
 
 
324 aa  265  3e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2104  Transketolase central region  46.27 
 
 
324 aa  265  3e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.216578  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0856  putative 2-oxo acid dehydrogenase beta subunit  46.5 
 
 
324 aa  264  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.389429  normal  0.709595 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05225  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, alpha and beta subunit  28.43 
 
 
688 aa  264  4e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.737912  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1826  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  45.65 
 
 
324 aa  263  8e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0535  pyruvate dehydrogenase E1 component subunit beta  45.51 
 
 
327 aa  263  1e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.289294  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2032  transketolase, central region  43.49 
 
 
320 aa  262  2e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4082  Transketolase central region  44.84 
 
 
335 aa  262  2e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2592  transketolase central region  43.38 
 
 
327 aa  261  2e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3242  Transketolase central region  46.06 
 
 
339 aa  261  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0939038  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1549  Transketolase domain protein  34.76 
 
 
709 aa  261  3e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1039  transketolase, central region  45 
 
 
324 aa  260  5.0000000000000005e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0489701  normal  0.0714055 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2416  transketolase, central region  44.41 
 
 
327 aa  258  2e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2229  transketolase, central region  48.71 
 
 
335 aa  258  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3767  Transketolase domain protein  45.2 
 
 
343 aa  257  4e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3062  transketolase central region  45.76 
 
 
327 aa  256  6e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0349  transketolase, central region  44.48 
 
 
330 aa  256  7e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0164413  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1604  transketolase, central region  33.86 
 
 
693 aa  256  1.0000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.167534  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3377  Transketolase central region  45.57 
 
 
326 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.442122  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2855  transketolase central region  44.14 
 
 
327 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.365672  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1616  Transketolase central region  44.1 
 
 
332 aa  254  3e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0824016 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0704  Transketolase central region  28.11 
 
 
823 aa  254  4.0000000000000004e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1973  Transketolase central region  42.28 
 
 
328 aa  254  5.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4462  pyruvate dehydrogenase subunit beta  39.94 
 
 
459 aa  253  6e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.150502 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4233  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit  43.52 
 
 
327 aa  253  7e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4066  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase subunit beta  43.52 
 
 
327 aa  253  7e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0625977  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3904  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit (2-oxoisovalerate dehydrogenase, beta subunit)  43.52 
 
 
327 aa  253  7e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.522905  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4181  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit  43.52 
 
 
327 aa  253  7e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000134341 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3913  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit (2-oxoisovalerate dehydrogenase, beta subunit)  43.52 
 
 
327 aa  253  7e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0083543  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4383  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase subunit beta  43.52 
 
 
327 aa  253  7e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0906911  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0753  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, beta subunit  41.72 
 
 
326 aa  253  7e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.102585  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4291  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit  43.52 
 
 
327 aa  253  7e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000939544  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6502  Transketolase central region  46.01 
 
 
332 aa  253  8.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.973138  normal  0.885428 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2827  transketolase central region  44.62 
 
 
337 aa  253  8.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2436  dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  44.89 
 
 
328 aa  253  9.000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287851  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1994  transketolase central region  44.72 
 
 
324 aa  253  1e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4386  Transketolase central region  45.69 
 
 
332 aa  252  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0650  pyruvate dehydrogenase E1 component beta subunit  41.72 
 
 
326 aa  253  1e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2251  Transketolase central region  42.28 
 
 
328 aa  252  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00217042  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3596  Transketolase central region  44.84 
 
 
342 aa  252  2e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0963  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit  43.52 
 
 
327 aa  251  2e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.897177  normal  0.0354317 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2062  Transketolase domain protein  42.38 
 
 
327 aa  251  3e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.258257  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4271  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase, beta subunit  43.21 
 
 
327 aa  251  4e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1092  transketolase, central region  44.58 
 
 
325 aa  251  4e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1120  transketolase, central region  44.58 
 
 
325 aa  251  4e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1109  transketolase, central region  44.58 
 
 
325 aa  251  4e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4002  transketolase central region  43.21 
 
 
327 aa  250  6e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.020695  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0456  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  42.4 
 
 
337 aa  249  8e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5215  Transketolase central region  44.62 
 
 
343 aa  249  8e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4110  transketolase domain-containing protein  31.18 
 
 
692 aa  249  8e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3108  transketolase, central region  43.12 
 
 
326 aa  249  9e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0525  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  42.4 
 
 
337 aa  249  2e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3123  transketolase domain-containing protein  28.91 
 
 
701 aa  248  2e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00523599 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2339  transketolase, central region  43.08 
 
 
340 aa  248  2e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0879  acetoin dehydrogenase, thymine PPi dependent, E1 component, beta subunit  44.05 
 
 
332 aa  248  3e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1467  hypothetical protein  42.9 
 
 
324 aa  247  4e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1516  hypothetical protein  42.59 
 
 
324 aa  247  4.9999999999999997e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2144  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  41.47 
 
 
341 aa  247  6e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.869205 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4758  transketolase, central region  43.99 
 
 
338 aa  246  9e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2364  Transketolase central region  39.32 
 
 
324 aa  246  9.999999999999999e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.177506  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1608  transketolase central region  40.43 
 
 
327 aa  246  9.999999999999999e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1575  transketolase, central region  40.43 
 
 
327 aa  246  9.999999999999999e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3552  transketolase central region  42.99 
 
 
337 aa  246  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1966  Transketolase central region  45.51 
 
 
326 aa  246  9.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.390541  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2680  pyruvate dehydrogenase E1 component  40.65 
 
 
326 aa  246  9.999999999999999e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0449  transketolase domain-containing protein  44.41 
 
 
325 aa  245  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.94075  normal  0.765018 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>