More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0175 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0175  Pyridoxal phosphate-dependent transferase  100 
 
 
411 aa  793    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1021  Pyridoxal phosphate-dependent transferase  47.04 
 
 
407 aa  273  3e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0099  L-seryl-tRNA selenium transferase  43.96 
 
 
406 aa  247  3e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.789274  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5759  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  34.18 
 
 
398 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.646746  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5094  L-seryl-tRNA(ser) selenium transferase  34.68 
 
 
398 aa  188  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6666  L-seryl-tRNA selenium transferase  34 
 
 
398 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184749  normal  0.0169225 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2440  selenocysteine synthase (seryl-tRNASer selenium transferase)-like protein  30.56 
 
 
406 aa  188  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0244624  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0940  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  34.77 
 
 
400 aa  188  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2990  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  33.42 
 
 
398 aa  186  6e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.625674  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2704  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  36.57 
 
 
402 aa  184  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.249088  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6463  selenocysteine synthase (seryl-tRNASer selenium transferase)-like protein  31.93 
 
 
414 aa  181  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1144  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  33.58 
 
 
388 aa  168  1e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.46182  normal  0.521262 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3964  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  28.46 
 
 
407 aa  162  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.741974  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0481  selenocysteine synthase (seryl-tRNASer selenium transferase)-like protein  32.31 
 
 
511 aa  159  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.11487  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3968  L-seryl-tRNA(ser) selenium transferase protein  27.96 
 
 
406 aa  155  9e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.456181  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4098  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  31.63 
 
 
369 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3975  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  31.63 
 
 
369 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.133901  normal  0.976007 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3993  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  31.38 
 
 
369 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4161  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  31.12 
 
 
369 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.60373  normal  0.579159 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4375  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  30.97 
 
 
372 aa  144  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.417275 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4047  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  30.87 
 
 
369 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0548491 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0676  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  28.81 
 
 
365 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3866  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  28.81 
 
 
365 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.559786  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4847  hypothetical protein  31.02 
 
 
372 aa  133  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.601246  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4728  hypothetical protein  31.02 
 
 
372 aa  132  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3153  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  32.1 
 
 
373 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0918  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  30.75 
 
 
372 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0430  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  30.48 
 
 
372 aa  131  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3272  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  30.36 
 
 
369 aa  131  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4697  hypothetical protein  30.48 
 
 
372 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.547246 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4792  hypothetical protein  30.48 
 
 
372 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4826  hypothetical protein  30.48 
 
 
372 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0105  hypothetical protein  31.3 
 
 
348 aa  125  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4959  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  27.65 
 
 
367 aa  119  7e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4987  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  27.65 
 
 
367 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4579  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase; selenocysteine synthase  27.13 
 
 
367 aa  119  9e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5002  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  27.39 
 
 
367 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4739  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  27.65 
 
 
367 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5099  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  27.65 
 
 
367 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4598  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase; selenocysteine synthase  27.39 
 
 
367 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4974  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  26.61 
 
 
367 aa  116  6e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4688  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  27.13 
 
 
367 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0261  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  26.61 
 
 
367 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.262008  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4522  selenocysteine synthase  29.84 
 
 
478 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.843638  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4157  selenocysteine synthase  32.08 
 
 
478 aa  80.5  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.109282 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1162  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  25.89 
 
 
476 aa  78.2  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00103584 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0672  selenocysteine synthase  26.63 
 
 
462 aa  77.4  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0440  selenocysteine synthase  31.74 
 
 
491 aa  73.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1093  selenocysteine synthase  28.48 
 
 
473 aa  73.6  0.000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2504  selenocysteine synthase  28 
 
 
470 aa  73.2  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0196405  normal  0.0690834 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3265  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  32.47 
 
 
474 aa  73.2  0.000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.322866  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2477  selenocysteine synthase  26.64 
 
 
448 aa  72.4  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0873  selenocysteine synthase  28.34 
 
 
468 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3486  selenocysteine synthase  26.51 
 
 
484 aa  72  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0801308  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0441  selenocysteine synthase  30.86 
 
 
491 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2208  L-seryl-tRNA selenium transferase  31.08 
 
 
519 aa  72  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.223965 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2561  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  30.64 
 
 
470 aa  70.5  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3477  L-seryl-tRNA selenium transferase  26.33 
 
 
473 aa  70.5  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.213454  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6556  selenocysteine synthase  28.64 
 
 
476 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0759041  decreased coverage  0.00101657 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2867  selenocysteine synthase  27.15 
 
 
465 aa  70.1  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.861059  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1678.1  selenocysteine synthase  28.57 
 
 
480 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0726  selenocysteine synthase  28.57 
 
 
480 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1696  selenocysteine synthase  28.57 
 
 
480 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1903  selenocysteine synthase  28.57 
 
 
480 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2255  selenocysteine synthase  28.57 
 
 
480 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0575  selenocysteine synthase  28.57 
 
 
480 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.81182  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2392  selenocysteine synthase  28.97 
 
 
480 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.36039  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1311  selenocysteine synthase  28 
 
 
506 aa  69.3  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000207864 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3059  selenocysteine synthase  27.22 
 
 
483 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00615002  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1646  selenocysteine synthase  26.28 
 
 
471 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000318162  unclonable  0.000000000338513 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2186  selenocysteine synthase  26.14 
 
 
475 aa  68.2  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000130274  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0536  selenocysteine synthase  28.95 
 
 
475 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0482  selenocysteine synthase  26.36 
 
 
489 aa  67  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.112411  hitchhiker  0.001297 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0109  selenocysteine synthase  31.03 
 
 
476 aa  67  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0104  selenocysteine synthase  31.03 
 
 
476 aa  67  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0548  selenocysteine synthase  28.95 
 
 
475 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.147839 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1740  selenocysteine synthase  27.6 
 
 
475 aa  66.6  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.820555  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3879  selenocysteine synthase  28.57 
 
 
468 aa  66.6  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.797755 
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  27.47 
 
 
414 aa  65.9  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11492  cysteine desulfurase csd  28 
 
 
417 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0542664  normal  0.287952 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3796  selenocysteine synthase  28.85 
 
 
468 aa  65.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.245945  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0101  selenocysteine synthase  30.77 
 
 
473 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2736  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.03 
 
 
415 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  27.47 
 
 
414 aa  66.2  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0105  selenocysteine synthase  28.85 
 
 
473 aa  65.1  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2373  selenocysteine synthase  25.72 
 
 
462 aa  65.5  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2085  selenocysteine synthase  25.99 
 
 
462 aa  65.5  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0106  selenocysteine synthase  29.23 
 
 
476 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16160  cysteine desulfurase  30.34 
 
 
429 aa  64.3  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0106  selenocysteine synthase  30.77 
 
 
476 aa  64.3  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0108  selenocysteine synthase  30.54 
 
 
476 aa  63.9  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63540  selenocysteine synthase  28.71 
 
 
468 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.219869  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5527  selenocysteine synthase  27.84 
 
 
468 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0527  selenocysteine synthase  27.82 
 
 
475 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.817809 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0493  selenocysteine synthase  27.82 
 
 
475 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.568026 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2549  selenocysteine synthase  29.81 
 
 
476 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4162  selenocysteine synthase  28.29 
 
 
462 aa  62.8  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0819  selenocysteine synthase  28.62 
 
 
461 aa  61.2  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2706  selenocysteine synthase  28.99 
 
 
468 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.277049 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.81 
 
 
418 aa  60.8  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>