More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2073 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2073  amidohydrolase  100 
 
 		 393 aa  806    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  46.1 
 
 		 390 aa  353  2e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  44.47 
 
 		 390 aa  347  3e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3175  amidohydrolase  39.95 
 
 		 394 aa  318  1e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0256  peptidase M20D, amidohydrolase  41.49 
 
 		 408 aa  314  1.9999999999999998e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3340  amidohydrolase  38.42 
 
 		 394 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4224  amidohydrolase  42.52 
 
 		 391 aa  309  4e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000104143  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  38.76 
 
 		 403 aa  306  3e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  38.76 
 
 		 403 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  40.05 
 
 		 405 aa  305  7e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4597  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  39.84 
 
 		 391 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00088705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0022  amidohydrolase  45.24 
 
 		 380 aa  303  3.0000000000000004e-81  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2218  peptidase M20D, amidohydrolase  38.82 
 
 		 405 aa  302  7.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0740  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  39.58 
 
 		 391 aa  300  2e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0340749  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1415  amidohydrolase family protein  37.56 
 
 		 398 aa  300  2e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486637  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1225  amidohydrolase family protein  38.05 
 
 		 398 aa  300  3e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0413476  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0616  aminoacylase (N-acyl-L-amino acid amidohydrolase)  38.79 
 
 		 391 aa  297  3e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00306425  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0621  amidohydrolase  38.52 
 
 		 391 aa  296  5e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0208  peptidase M20D, amidohydrolase  38.5 
 
 		 397 aa  296  5e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0834  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  38.52 
 
 		 391 aa  295  7e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0775  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase, degenerate  38.26 
 
 		 391 aa  295  9e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0672  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  38.26 
 
 		 391 aa  294  2e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0706  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  38.26 
 
 		 391 aa  294  2e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0594  amidohydrolase  39.79 
 
 		 391 aa  293  3e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3918  aminoacylase  40.63 
 
 		 389 aa  293  4e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1012  amidohydrolase  38.44 
 
 		 400 aa  293  4e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1358  carboxypeptidase  36.83 
 
 		 459 aa  293  5e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1843  amidohydrolase  37.47 
 
 		 405 aa  292  6e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1490  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  40.63 
 
 		 389 aa  292  7e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1532  aminoacylase  39.84 
 
 		 389 aa  291  1e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1324  amidohydrolase  37.76 
 
 		 410 aa  291  1e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0545  amidohydrolase  39.34 
 
 		 400 aa  291  1e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.502241  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0613  amidohydrolase  36.46 
 
 		 400 aa  290  3e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1426  aminoacylase  39.84 
 
 		 389 aa  290  3e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4369  amidohydrolase  37.85 
 
 		 405 aa  290  4e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0616  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase (aminoacylase)  37.99 
 
 		 391 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1263  aminoacylase (N-acyl-L-amino acid amidohydrolase)  39.84 
 
 		 389 aa  288  8e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.804068  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1289  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  39.84 
 
 		 389 aa  288  1e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1392  n-acyl-l-amino acid amidohydrolase  39.84 
 
 		 389 aa  288  1e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1296  amidohydrolase  39.69 
 
 		 392 aa  288  1e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.224852  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1261  aminoacylase (N-acyl-L-amino acid amidohydrolase)  39.84 
 
 		 389 aa  287  2e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1463  aminoacylase  39.84 
 
 		 389 aa  287  2e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2791  amidohydrolase  37.63 
 
 		 390 aa  288  2e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0760  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  38.26 
 
 		 391 aa  288  2e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000492942 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1044  amidohydrolase  37.24 
 
 		 408 aa  286  5e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210114  unclonable  0.00000194036 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1020  peptidase M20D, amidohydrolase  36.57 
 
 		 407 aa  286  5e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0205344 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  40 
 
 		 396 aa  285  8e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0982  amidohydrolase  36.69 
 
 		 404 aa  285  9e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1222  amidohydrolase  37.11 
 
 		 393 aa  285  1.0000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115214  normal  0.142567 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2758  amidohydrolase  40.64 
 
 		 393 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00285471  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2667  peptidase M20D, amidohydrolase  38.42 
 
 		 404 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0570  amidohydrolase  39.43 
 
 		 392 aa  284  2.0000000000000002e-75  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  39.69 
 
 		 388 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0259  amidohydrolase  37.75 
 
 		 435 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0605709 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  37.96 
 
 		 388 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1764  amidohydrolase  38.36 
 
 		 389 aa  283  4.0000000000000003e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3690  amidohydrolase  36.76 
 
 		 400 aa  283  5.000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.824469 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0169  amidohydrolase  35.88 
 
 		 411 aa  282  7.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358542  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2708  amidohydrolase  35.31 
 
 		 415 aa  282  8.000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0130  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  40.25 
 
 		 401 aa  282  8.000000000000001e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0750166  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7287  amidohydrolase  38.82 
 
 		 391 aa  281  1e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1059  peptidase M20D, amidohydrolase  37.15 
 
 		 392 aa  281  2e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996259  decreased coverage  0.0000027158 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0017  amidohydrolase  37.69 
 
 		 394 aa  281  2e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1988  amidohydrolase  37.73 
 
 		 399 aa  280  3e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000688604  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1205  amidohydrolase  36.76 
 
 		 398 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.811982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1178  amidohydrolase  36.76 
 
 		 398 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0634  amidohydrolase  37.18 
 
 		 387 aa  280  4e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1491  amidohydrolase  35.73 
 
 		 396 aa  279  5e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2224  amidohydrolase  39.19 
 
 		 396 aa  279  8e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.355102  normal  0.809475 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1094  amidohydrolase  38.24 
 
 		 394 aa  278  9e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  37.89 
 
 		 402 aa  278  1e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1591  amidohydrolase  37.34 
 
 		 389 aa  278  1e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.653364 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  38.2 
 
 		 389 aa  277  2e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1597  amidohydrolase  36.06 
 
 		 399 aa  277  2e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0486539 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  40.1 
 
 		 396 aa  277  3e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  36.76 
 
 		 388 aa  276  6e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0678  amidohydrolase  35.64 
 
 		 394 aa  275  7e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.000000231632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0877  amidohydrolase  37.73 
 
 		 387 aa  275  9e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  39.84 
 
 		 396 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1330  amidohydrolase  35.79 
 
 		 407 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  38.23 
 
 		 391 aa  275  1.0000000000000001e-72  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0180  peptidase M20D, amidohydrolase  36.39 
 
 		 393 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0302  amidohydrolase  38.12 
 
 		 437 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  37.6 
 
 		 397 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1729  peptidase M20D, amidohydrolase  38.11 
 
 		 390 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0022862 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4687  amidohydrolase  36.5 
 
 		 395 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2091  amidohydrolase  36.25 
 
 		 395 aa  273  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000150957 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  40.27 
 
 		 388 aa  273  3e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0004  amidohydrolase  36.25 
 
 		 399 aa  273  4.0000000000000004e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.209653  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  37.86 
 
 		 397 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0207  amidohydrolase  35.57 
 
 		 480 aa  273  5.000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  36.43 
 
 		 388 aa  272  7e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  36.34 
 
 		 389 aa  272  7e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  38.12 
 
 		 397 aa  272  7e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1065  carboxypeptidase  36.29 
 
 		 396 aa  272  8.000000000000001e-72  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.094231  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3816  carboxypeptidase  38.44 
 
 		 465 aa  272  9e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0708  carboxypeptidase  36.55 
 
 		 396 aa  271  1e-71  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3743  carboxypeptidase  38.44 
 
 		 465 aa  271  1e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  38.54 
 
 		 396 aa  271  2e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  37.5 
 
 		 387 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>