258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6288 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_6288  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  100 
 
 
153 aa  322  1e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00669161  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.79 
 
 
155 aa  155  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0272  alkylhydroperoxidase  45.1 
 
 
150 aa  147  4e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300614  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1215  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.05 
 
 
157 aa  145  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0498  alkylhydroperoxidase  42 
 
 
159 aa  134  6.0000000000000005e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  42.67 
 
 
162 aa  134  7.000000000000001e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3146  alkylhydroperoxidase  37.84 
 
 
157 aa  133  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2516  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.76 
 
 
159 aa  133  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612062  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2237  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.83 
 
 
151 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.887416  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  43.06 
 
 
153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.804329 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.76 
 
 
159 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6640  alkylhydroperoxidase  41.38 
 
 
159 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000966542  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  46.15 
 
 
158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2786  alkylhydroperoxidase  40 
 
 
159 aa  127  8.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4627  alkylhydroperoxidase  40 
 
 
159 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000476695 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0093  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.62 
 
 
159 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5258  alkylhydroperoxidase AhpD core  40 
 
 
159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5601  alkylhydroperoxidase  40 
 
 
159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.432022 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1327  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.07 
 
 
150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.284107  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  38 
 
 
163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3236  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.67 
 
 
163 aa  124  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.210156  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.93 
 
 
145 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  37.24 
 
 
145 aa  124  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2419  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.31 
 
 
159 aa  124  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.797852 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2344  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.93 
 
 
159 aa  124  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3323  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38 
 
 
163 aa  124  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.320145  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.45 
 
 
145 aa  124  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6812  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.72 
 
 
151 aa  124  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  37.41 
 
 
159 aa  124  7e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  37.41 
 
 
159 aa  124  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  42.25 
 
 
159 aa  123  8.000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  44.63 
 
 
145 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.24 
 
 
145 aa  123  9e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  43.8 
 
 
145 aa  123  9e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  44.63 
 
 
145 aa  123  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.63 
 
 
145 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  44.63 
 
 
145 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2747  alkylhydroperoxidase  43.66 
 
 
151 aa  123  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.201344  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5396  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.93 
 
 
159 aa  122  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.9 
 
 
153 aa  121  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  35.86 
 
 
145 aa  121  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  43.8 
 
 
145 aa  121  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.44 
 
 
152 aa  121  4e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1998  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.69 
 
 
159 aa  121  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  37.32 
 
 
154 aa  119  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  35.86 
 
 
145 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0199  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.03 
 
 
153 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149358  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3795  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.42 
 
 
146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154447  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  35.86 
 
 
149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5805  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.96 
 
 
152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0418506  normal  0.111709 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2370  alkylhydroperoxidase  39.16 
 
 
146 aa  118  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0155625  normal  0.106915 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5435  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.93 
 
 
159 aa  118  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  39.04 
 
 
145 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1807  alkylhydroperoxidase  47.86 
 
 
155 aa  117  6e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.468066 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.36 
 
 
145 aa  117  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0229  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.62 
 
 
153 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  35.17 
 
 
145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3201  alkylhydroperoxidase AhpD core  40 
 
 
146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601606  hitchhiker  0.00337027 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8901  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.43 
 
 
163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6705  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.34 
 
 
158 aa  115  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.625581  normal  0.389522 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3196  alkylhydroperoxidase  37.18 
 
 
167 aa  114  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.43 
 
 
155 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.04 
 
 
145 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  36.11 
 
 
145 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0996  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  42.48 
 
 
283 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.353647  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2011  alkylhydroperoxidase  42.15 
 
 
145 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2151  alkylhydroperoxidase  42.15 
 
 
145 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0187774 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1084  alkylhydroperoxidase  43.85 
 
 
143 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.359651 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1900  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  41.74 
 
 
150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.41 
 
 
145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3108  alkylhydroperoxidase  44.04 
 
 
159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  37.93 
 
 
145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1057  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  41.74 
 
 
150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0811  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  41.74 
 
 
150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1211  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  41.74 
 
 
150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501081  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1219  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  41.74 
 
 
150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1369  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  41.74 
 
 
150 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3822  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.86 
 
 
152 aa  112  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.176848  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0201  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40 
 
 
150 aa  112  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0791  alkylhydroperoxidase  37.41 
 
 
167 aa  111  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4773  alkylhydroperoxidase  44.54 
 
 
157 aa  110  6e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.792481  normal  0.557734 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5230  alkylhydroperoxidase  46.55 
 
 
150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6098  alkylhydroperoxidase  37.93 
 
 
149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3703  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  42.15 
 
 
154 aa  108  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56916  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3554  alkylhydroperoxidase  37.93 
 
 
151 aa  108  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.249618 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2269  alkylhydroperoxidase  44.07 
 
 
157 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608052  normal  0.394393 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6989  alkylhydroperoxidase  37.24 
 
 
151 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.793098  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3401  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.16 
 
 
154 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900617  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3376  alkylhydroperoxidase  37.4 
 
 
154 aa  106  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3916  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.57 
 
 
143 aa  106  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0761488 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3241  hypothetical protein  38.97 
 
 
144 aa  106  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.371033  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6133  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.55 
 
 
151 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8728  alkylhydroperoxidase  33.57 
 
 
152 aa  105  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0022  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.44 
 
 
156 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2794  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.57 
 
 
143 aa  105  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0548302 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1070  alkylhydroperoxidase  39.22 
 
 
153 aa  105  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6087  alkylhydroperoxidase  36.55 
 
 
151 aa  104  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782887  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6384  alkylhydroperoxidase  36.55 
 
 
151 aa  104  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.39128  normal  0.0625105 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0606  putative redox protein  42.37 
 
 
157 aa  104  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0027  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.86 
 
 
157 aa  104  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.456012 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>