More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4950 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  46.21 
 
 
759 aa  653    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  47.34 
 
 
753 aa  659    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6890  copper-translocating P-type ATPase  66.62 
 
 
754 aa  1010    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  46.86 
 
 
831 aa  644    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  46.21 
 
 
759 aa  653    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  46.79 
 
 
750 aa  647    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3058  copper-translocating P-type ATPase  63.09 
 
 
740 aa  957    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  48.44 
 
 
743 aa  652    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2052  copper-translocating P-type ATPase  46.81 
 
 
837 aa  648    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02596e-23 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00260  putative copper transport-related membrane protein  60.85 
 
 
741 aa  894    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.348825  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1499  cation-transporting ATPase; copper-exporting ATPase  60.54 
 
 
804 aa  873    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.037718  normal  0.0386539 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2925  heavy metal translocating P-type ATPase  63.78 
 
 
767 aa  927    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6644  copper-translocating P-type ATPase  66.67 
 
 
753 aa  1014    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.935468  normal  0.257295 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  46.89 
 
 
814 aa  643    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  46.89 
 
 
752 aa  637    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  47.06 
 
 
786 aa  664    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3106  copper-translocating P-type ATPase  61.26 
 
 
742 aa  895    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.138352  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4950  copper-translocating P-type ATPase  100 
 
 
748 aa  1525    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.113213 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  47.38 
 
 
797 aa  629  1e-179  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  46.42 
 
 
815 aa  625  1e-178  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4416  copper-translocating P-type ATPase  47.49 
 
 
759 aa  627  1e-178  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  45.63 
 
 
836 aa  624  1e-177  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0243  heavy metal translocating P-type ATPase  46.24 
 
 
833 aa  620  1e-176  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1570  heavy metal translocating P-type ATPase  46.34 
 
 
747 aa  617  1e-175  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.706467  normal  0.910265 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  44.72 
 
 
837 aa  612  9.999999999999999e-175  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_824  cation transport ATPase  44.24 
 
 
828 aa  607  9.999999999999999e-173  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0953  copper-translocating P-type ATPase  43.9 
 
 
828 aa  598  1e-170  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  43.26 
 
 
885 aa  601  1e-170  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  44.44 
 
 
802 aa  595  1e-169  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  44.44 
 
 
802 aa  595  1e-169  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  45.43 
 
 
798 aa  597  1e-169  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0837  heavy metal translocating P-type ATPase  43.63 
 
 
828 aa  592  1e-168  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  43.25 
 
 
889 aa  592  1e-168  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1307  copper-translocating P-type ATPase  44.86 
 
 
758 aa  592  1e-168  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  44.19 
 
 
794 aa  592  1e-167  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  44.87 
 
 
805 aa  591  1e-167  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2091  copper-translocating P-type ATPase  43.55 
 
 
750 aa  589  1e-167  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  42.86 
 
 
889 aa  591  1e-167  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1546  cation transport ATPase  44.2 
 
 
742 aa  591  1e-167  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1397  hypothetical protein  46.88 
 
 
735 aa  588  1e-166  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  47.17 
 
 
803 aa  586  1e-166  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11723  heavy-metal transporting P-type ATPase  45.33 
 
 
835 aa  588  1e-166  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0439709  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3653  heavy metal translocating P-type ATPase  44.11 
 
 
805 aa  588  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1596  hypothetical protein  46.65 
 
 
735 aa  585  1.0000000000000001e-165  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  44.35 
 
 
797 aa  585  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0191  heavy metal translocating P-type ATPase  45.71 
 
 
837 aa  585  1.0000000000000001e-165  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.562672  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0657  copper-translocating P-type ATPase  46.66 
 
 
724 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.737443  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  43.22 
 
 
837 aa  583  1.0000000000000001e-165  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1807  cation transporter E1-E2 family ATPase  45.76 
 
 
915 aa  582  1.0000000000000001e-165  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0477  copper-exporting ATPase  44.1 
 
 
742 aa  580  1e-164  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0879  heavy metal translocating P-type ATPase  44.32 
 
 
762 aa  580  1e-164  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.573666  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  45.33 
 
 
839 aa  579  1e-164  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  44.42 
 
 
818 aa  581  1e-164  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0801  heavy metal translocating P-type ATPase  48.22 
 
 
823 aa  580  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  43.37 
 
 
826 aa  580  1e-164  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1690  copper-translocating P-type ATPase  44.24 
 
 
740 aa  582  1e-164  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11368  heavy-metal transporting P-type ATPase  44.51 
 
 
824 aa  580  1e-164  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1533  heavy metal translocating P-type ATPase  48.29 
 
 
724 aa  576  1.0000000000000001e-163  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  45.67 
 
 
806 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  45.99 
 
 
817 aa  578  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00395  Cation transport ATPase  43.71 
 
 
747 aa  573  1.0000000000000001e-162  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0177  heavy metal translocating P-type ATPase  47.75 
 
 
755 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.963495  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2356  hypothetical protein  46.1 
 
 
736 aa  575  1.0000000000000001e-162  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4394  heavy metal translocating P-type ATPase  46.6 
 
 
715 aa  575  1.0000000000000001e-162  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.880078  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0270  copper-translocating P-type ATPase  44.52 
 
 
748 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3074  heavy metal translocating P-type ATPase  46.87 
 
 
845 aa  574  1.0000000000000001e-162  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004188  copper-translocating P-type ATPase  43.61 
 
 
909 aa  573  1.0000000000000001e-162  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  43.58 
 
 
849 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0512645 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0987  heavy metal translocating P-type ATPase  42.24 
 
 
839 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000433891  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3584  copper-translocating P-type ATPase  43.55 
 
 
805 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  45.84 
 
 
821 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0056  copper-transporting P-type ATPase  47.89 
 
 
804 aa  571  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9859  copper-translocating P-type ATPase  47.38 
 
 
737 aa  570  1e-161  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  44.87 
 
 
805 aa  569  1e-161  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  44.87 
 
 
805 aa  570  1e-161  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  44.87 
 
 
805 aa  570  1e-161  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  44.87 
 
 
805 aa  569  1e-161  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4630  copper-translocating P-type ATPase  47.15 
 
 
801 aa  571  1e-161  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3006  copper-translocating P-type ATPase  42.66 
 
 
850 aa  568  1e-161  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.40662  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00355  Cation transport ATPase  42.7 
 
 
782 aa  572  1e-161  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2153  heavy metal translocating P-type ATPase  47.11 
 
 
724 aa  570  1e-161  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00626662  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3818  copper-translocating P-type ATPase  44.77 
 
 
747 aa  567  1e-160  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.585028  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  43.22 
 
 
796 aa  567  1e-160  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  44.79 
 
 
798 aa  566  1e-160  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  44.87 
 
 
805 aa  567  1e-160  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  42.78 
 
 
954 aa  567  1e-160  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  46.7 
 
 
795 aa  567  1e-160  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3496  copper-translocating P-type ATPase  44 
 
 
805 aa  568  1e-160  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  42.8 
 
 
942 aa  568  1e-160  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4380  copper-translocating P-type ATPase  47.15 
 
 
818 aa  568  1e-160  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0802  copper-transporting P-type ATPase  44.11 
 
 
902 aa  566  1e-160  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  44.87 
 
 
805 aa  566  1e-160  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  42.91 
 
 
827 aa  567  1e-160  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2532  heavy metal translocating P-type ATPase  44.8 
 
 
762 aa  566  1e-160  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0349499  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1381  copper-translocating P-type ATPase  43.41 
 
 
844 aa  567  1e-160  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  44.79 
 
 
798 aa  566  1e-160  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1994  heavy metal translocating P-type ATPase  42.73 
 
 
857 aa  562  1.0000000000000001e-159  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000675494  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1072  heavy metal translocating P-type ATPase  47.81 
 
 
755 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  43.36 
 
 
838 aa  562  1.0000000000000001e-159  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0212  copper-translocating P-type ATPase  44.78 
 
 
746 aa  565  1.0000000000000001e-159  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>