192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3649 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3649  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  100 
 
 		 311 aa  645    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00196269  normal  0.251982 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2015  GCN5-related N-acetyltransferase  36.21 
 
 		 306 aa  227  2e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2408  MarR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 305 aa  167  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944596 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2336  MarR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 309 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3019  MarR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 316 aa  165  6.9999999999999995e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2753  MarR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 299 aa  162  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0669 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4525  MarR family transcriptional regulator  31.83 
 
 		 315 aa  159  5e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4364  MarR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 308 aa  155  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.258723  normal  0.018546 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1078  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 307 aa  155  9e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2224  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  31.48 
 
 		 320 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0559  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  31 
 
 		 308 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2109  MarR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 314 aa  152  8.999999999999999e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67396  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6358  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  30.16 
 
 		 326 aa  151  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1080  GCN5-related N-acetyltransferase  30.52 
 
 		 309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.48831  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1223  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  30.49 
 
 		 312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2134  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  27.85 
 
 		 322 aa  145  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4157  MarR family transcriptional regulator  29 
 
 		 308 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.963186 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2652  GCN5-related N-acetyltransferase  42.07 
 
 		 166 aa  137  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.499326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1052  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  30.07 
 
 		 304 aa  137  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0668577  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3717  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  27.12 
 
 		 310 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.554507  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  28.29 
 
 		 305 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690582  normal  0.688792 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3457  MarR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 310 aa  135  7.000000000000001e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.965318  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2507  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  28.82 
 
 		 305 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0291  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 307 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0779  transcriptional regulator  28.06 
 
 		 318 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.119696  normal  0.0560901 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5167  MarR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0893639  normal  0.0785126 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2874  hypothetical protein  28.21 
 
 		 313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5800  Peptidyl-dipeptidase Dcp  35.67 
 
 		 848 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.882586 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6586  MarR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 326 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107316  normal  0.0388033 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2189  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  28.47 
 
 		 325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5740  MarR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6104  MarR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6026  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 325 aa  109  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4043  MarR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 326 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7562  MarR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 326 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.774028 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0978  MarR family transcriptional regulator  24.09 
 
 		 310 aa  100  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.154037  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4630  MarR family transcriptional regulator  26.41 
 
 		 321 aa  100  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4501  MarR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 336 aa  99.8  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6607  MarR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 329 aa  96.3  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5296  MarR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 337 aa  92.8  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2651  transcriptional regulator, MarR family  35.25 
 
 		 143 aa  90.1  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.512568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2471  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 321 aa  90.1  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.536093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0752  acetyltransferase  29.87 
 
 		 161 aa  88.6  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2409  GCN5-related N-acetyltransferase  29.87 
 
 		 161 aa  88.6  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.999952 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0210  GCN5-related N-acetyltransferase  30.6 
 
 		 162 aa  84.7  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.312763 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2115  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  25.17 
 
 		 317 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0427  GCN5-related N-acetyltransferase  29.53 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.036557 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2004  transcriptional regulator  29.08 
 
 		 142 aa  79  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.112591  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4388  GCN5-related N-acetyltransferase  25.16 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5083  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  25.86 
 
 		 294 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.569191  normal  0.0231786 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1214  hypothetical protein  23.79 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1220  hypothetical protein  23.79 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2501  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  24.82 
 
 		 289 aa  65.1  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0971  MarR family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20380  acetyltransferase  32.65 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104795  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2529  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  25.68 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1745  MarR family transcriptional regulator  22.34 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.550965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0546  amino acid adenylation domain-containing protein  33.03 
 
 		 2151 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0858  MarR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 320 aa  58.9  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  22.76 
 
 		 340 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.67 
 
 		 156 aa  55.5  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2718  transcriptional regulator  23.43 
 
 		 290 aa  55.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1383  acyltransferase-like protein  30.82 
 
 		 170 aa  55.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0569267  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0441  acetyltransferase, gnat family  24.83 
 
 		 167 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2210  GCN5-related N-acetyltransferase  31.43 
 
 		 178 aa  53.9  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.236842  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4819  acetyltransferase, gnat family  24.83 
 
 		 163 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.866921  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3197  streptothricin acetyltransferase, putative  30.63 
 
 		 184 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.288156  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4797  acetyltransferase, gnat family  23.08 
 
 		 163 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3203  putative streptothricin acetyltransferase  30.56 
 
 		 185 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0737  MarR family transcriptional regulator  22.59 
 
 		 322 aa  53.1  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09031  transcriptional regulator, MarR family protein  26.51 
 
 		 151 aa  52.8  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.151689  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4514  GCN5-related N-acetyltransferase  26.21 
 
 		 163 aa  53.1  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3801  GCN5-related N-acetyltransferase  24.81 
 
 		 172 aa  52.4  0.000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.54281  decreased coverage  0.000138892 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4824  acetyltransferase  24.83 
 
 		 163 aa  52  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2961  streptothricin acetyltransferase  30.63 
 
 		 184 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00591325  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2948  streptothricin acetyltransferase  30.77 
 
 		 185 aa  52.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000131684  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3185  streptothricin acetyltransferase  30.63 
 
 		 184 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.95857  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4589  GCN5-related N-acetyltransferase  31.11 
 
 		 167 aa  52  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0963  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.94 
 
 		 157 aa  52  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3192  putative streptothricin acetyltransferase  30.63 
 
 		 184 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2424  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.94 
 
 		 148 aa  51.6  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0639  GCN5-related N-acetyltransferase  30.61 
 
 		 163 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.387035 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0611  acetyltransferase  25.93 
 
 		 155 aa  50.4  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2134  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.76 
 
 		 148 aa  50.8  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12708  putative acetyltransferase  31.58 
 
 		 163 aa  50.4  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2775  putative acetyltransferase  24.68 
 
 		 312 aa  49.7  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5056  GCN5-related N-acetyltransferase  30.17 
 
 		 161 aa  49.7  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274553  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2069  putative streptothricin acetyltransferase  28.83 
 
 		 185 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2478  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 		 167 aa  49.7  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.263988  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0578  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 		 157 aa  48.9  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1841  GCN5-related N-acetyltransferase  29.17 
 
 		 157 aa  48.9  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.156651  normal  0.303536 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1547  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 		 164 aa  48.5  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.560238 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3179  putative streptothricin acetyltransferase  27.93 
 
 		 186 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3240  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 164 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3701  GCN5-related N-acetyltransferase  24.49 
 
 		 167 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2624  MarR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 166 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000470188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4529  MarR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 166 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000513075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5915  GCN5-related N-acetyltransferase  27.59 
 
 		 162 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1094  GCN5-related N-acetyltransferase  33.77 
 
 		 153 aa  47.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1466  hypothetical protein  27.63 
 
 		 94 aa  47.8  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>