More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2575 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2575  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 604 aa  1251    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.260702  normal  0.580332 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2519  alpha amylase  51.53 
 
 		 582 aa  562  1.0000000000000001e-159  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.252753 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3924  oligo-1,6-glucosidase  48.31 
 
 		 558 aa  559  1e-158  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.12031  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3756  oligo-1,6-glucosidase  48.31 
 
 		 558 aa  559  1e-158  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000260004  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3772  oligo-1,6-glucosidase  48.31 
 
 		 558 aa  560  1e-158  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.719962  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4231  oligo-1,6-glucosidase  48.31 
 
 		 558 aa  559  1e-158  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24722  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4140  oligo-1,6-glucosidase  48.4 
 
 		 558 aa  561  1e-158  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000871956  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2716  alpha amylase catalytic region  49.11 
 
 		 559 aa  560  1e-158  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0292835  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4034  oligo-1,6-glucosidase  48.31 
 
 		 558 aa  559  1e-158  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4066  oligo-1,6-glucosidase  48.04 
 
 		 558 aa  557  1e-157  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.828435  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3843  alpha amylase catalytic region  48.57 
 
 		 558 aa  557  1e-157  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00167819  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22530  alpha amylase catalytic region  49.11 
 
 		 562 aa  557  1e-157  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1118  oligo-1,6-glucosidase  48.47 
 
 		 558 aa  558  1e-157  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00264328  normal  0.397885 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0526  alpha amylase catalytic region  48.92 
 
 		 562 aa  552  1e-156  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4121  oligo-1,6-glucosidase  47.5 
 
 		 558 aa  551  1e-155  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00158128  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08330  sucrose isomerase  47.59 
 
 		 600 aa  535  1e-151  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3323  alpha amylase catalytic region  49.82 
 
 		 570 aa  537  1e-151  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0165  alpha amylase catalytic region  48.21 
 
 		 557 aa  536  1e-151  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000167663  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09460  alpha amylase catalytic region  47.6 
 
 		 563 aa  525  1e-148  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0188478  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0601  alpha amylase catalytic region  46.68 
 
 		 554 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1406  alpha amylase catalytic region  45.5 
 
 		 555 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1595  alpha-D-1,4-glucosidase  44.64 
 
 		 549 aa  496  1e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1564  alpha-D-1,4-glucosidase  44.64 
 
 		 549 aa  496  1e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3625  alpha amylase catalytic region  44.76 
 
 		 571 aa  492  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2521  alpha amylase catalytic region  42.35 
 
 		 556 aa  489  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0357  glycosyl hydrolase family protein  44.78 
 
 		 554 aa  491  1e-137  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000071861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0347  alpha-glucosidase  44.78 
 
 		 554 aa  491  1e-137  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225343  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0343  alpha-glucosidase  44.78 
 
 		 554 aa  489  1e-137  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000029424  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0371  glycosyl hydrolase family protein  44.78 
 
 		 554 aa  491  1e-137  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000236448  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4926  alpha amylase catalytic region  43.85 
 
 		 578 aa  491  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0413  glycosyl hydrolase family protein  44.78 
 
 		 554 aa  491  1e-137  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000830485 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1621  alpha,alpha-phosphotrehalase  43.95 
 
 		 563 aa  491  1e-137  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2381  alpha-D-1,4-glucosidase  43.55 
 
 		 568 aa  491  1e-137  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0481  glycosyl hydrolase family protein  44.42 
 
 		 554 aa  487  1e-136  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000250656  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0354  alpha amylase catalytic region  43.71 
 
 		 554 aa  487  1e-136  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4891  glycosyl hydrolase family protein  44.62 
 
 		 554 aa  486  1e-136  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000186881  normal  0.167059 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0303  alpha amylase catalytic region  46.01 
 
 		 557 aa  485  1e-136  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0427  glycosyl hydrolase family protein  44.62 
 
 		 554 aa  486  1e-136  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000114694  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0470  glycosyl hydrolase family protein  44.42 
 
 		 554 aa  488  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0421  putative oligo-1,6-glucosidase  43.53 
 
 		 554 aa  486  1e-136  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.591118  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0352  alpha amylase catalytic region  43.83 
 
 		 554 aa  484  1e-135  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00857994  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0417  oligo-1,6-glucosidase  43.17 
 
 		 554 aa  483  1e-135  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1070  alpha-glucosidase  44.49 
 
 		 551 aa  480  1e-134  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.297332  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2342  alpha amylase catalytic region  44.34 
 
 		 538 aa  481  1e-134  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2932  alpha amylase catalytic region  44.72 
 
 		 557 aa  479  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1154  alpha amylase catalytic region  44.55 
 
 		 577 aa  477  1e-133  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.144841  decreased coverage  0.0000326761 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2553  alpha,alpha-phosphotrehalase  42.83 
 
 		 563 aa  476  1e-133  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0899  trehalose-6-phosphate hydrolase  43.16 
 
 		 560 aa  478  1e-133  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0897  trehalose-6-phosphate hydrolase  42.75 
 
 		 556 aa  474  1e-132  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.175919  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0913  alpha amylase, catalytic region  44.49 
 
 		 622 aa  467  9.999999999999999e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2048  alpha amylase catalytic region  41.73 
 
 		 572 aa  462  1e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.105277  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0051  alpha amylase catalytic region  43.08 
 
 		 590 aa  459  9.999999999999999e-129  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.237414 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3009  alpha amylase catalytic region  43.56 
 
 		 555 aa  460  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0083  alpha amylase, catalytic region  41.2 
 
 		 560 aa  456  1e-127  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0810365  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2383  dextran glucosidase  41.59 
 
 		 566 aa  456  1e-127  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0052  alpha amylase catalytic region  42.17 
 
 		 577 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0040  glucosidase  42.5 
 
 		 556 aa  452  1.0000000000000001e-126  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0518  trehalose-6-phosphate hydrolase  40.85 
 
 		 560 aa  453  1.0000000000000001e-126  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000559563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0433  trehalose-6-phosphate hydrolase  44.69 
 
 		 562 aa  451  1e-125  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000180763  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0545  alpha,alpha-phosphotrehalase  40.79 
 
 		 553 aa  450  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01206  hypothetical protein  42.16 
 
 		 561 aa  448  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1851  trehalose-6-phosphate hydrolase  43.81 
 
 		 531 aa  443  1e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0543  alpha,alpha-phosphotrehalase (trehalose-6-phosphate hydrolase)  40.79 
 
 		 553 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004234  trehalose-6-phosphate hydrolase  41.59 
 
 		 561 aa  440  9.999999999999999e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0161937  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4669  alpha,alpha-phosphotrehalase  40.5 
 
 		 553 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.2503e-20 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2908  trehalose-6-phosphate hydrolase  41.35 
 
 		 562 aa  439  9.999999999999999e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.812493  normal  0.508935 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0700  trehalose-6-phosphate hydrolase  40.61 
 
 		 553 aa  437  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0599  trehalose-6-phosphate hydrolase  40.61 
 
 		 553 aa  437  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0543  alpha,alpha-phosphotrehalase (trehalose-6-phosphate hydrolase)  40.61 
 
 		 553 aa  437  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0668  alpha,alpha-phosphotrehalase  40.68 
 
 		 553 aa  437  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0632  trehalose-6-phosphate hydrolase  40.61 
 
 		 553 aa  437  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0761  alpha,alpha-phosphotrehalase  40.32 
 
 		 553 aa  439  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0222  trehalose-6-phosphate hydrolase  43.13 
 
 		 538 aa  436  1e-121  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000721173  hitchhiker  0.00000000000157233 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0687  alpha,alpha-phosphotrehalase  40.79 
 
 		 553 aa  438  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0828  trehalose-6-phosphate hydrolase  42.4 
 
 		 556 aa  438  1e-121  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0959378  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0528  trehalose-6-phosphate hydrolase  39.64 
 
 		 554 aa  435  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.664084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0496  alpha,alpha-phosphotrehalase  41.97 
 
 		 546 aa  434  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4886  alpha amylase catalytic region  41.25 
 
 		 571 aa  435  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0509  alpha,alpha-phosphotrehalase  41.97 
 
 		 546 aa  434  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1497  glycosidase  43.62 
 
 		 606 aa  434  1e-120  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.990687  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0523  trehalose-6-phosphate hydrolase  41.18 
 
 		 560 aa  433  1e-120  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1506  trehalose-6-phosphate hydrolase  40.83 
 
 		 561 aa  429  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0542  alpha,alpha-phosphotrehalase  41.52 
 
 		 555 aa  430  1e-119  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.764323  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0243  alpha amylase catalytic region  45.26 
 
 		 536 aa  431  1e-119  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04843  Putative alpha-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B3N7]  41.87 
 
 		 591 aa  427  1e-118  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.145231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2260  alpha amylase catalytic region  40.67 
 
 		 552 aa  426  1e-118  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0144984  normal  0.633948 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1924  glucan 1,6-alpha-glucosidase  41.65 
 
 		 535 aa  425  1e-117  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29292  alpha-D-glucosidase (maltase) ( alpha-amylase) (MALT) (MAZS)  39.02 
 
 		 573 aa  422  1e-117  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.370606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1378  alpha amylase catalytic region  42.02 
 
 		 553 aa  424  1e-117  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000100533  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1934  alpha amylase catalytic region  42.14 
 
 		 643 aa  420  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62666  alpha-glucosidase maltase  39.72 
 
 		 572 aa  419  1e-116  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.97685  normal  0.170022 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31510  glycosidase  41.11 
 
 		 596 aa  422  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.382371  normal  0.756128 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2758  trehalose-6-phosphate hydrolase  39.78 
 
 		 563 aa  420  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0578  trehalose-6-phosphate hydrolase  41.22 
 
 		 556 aa  417  9.999999999999999e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2341  alpha amylase catalytic region  39.16 
 
 		 554 aa  412  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42120  alpha-glucosidase maltase  38.78 
 
 		 572 aa  411  1e-113  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.217758  normal  0.25099 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1332  alpha amylase, catalytic domain protein  41.65 
 
 		 639 aa  411  1e-113  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.86601 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4855  trehalose-6-phosphate hydrolase  38.2 
 
 		 550 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0911834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4736  trehalose-6-phosphate hydrolase  38.02 
 
 		 550 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4800  trehalose-6-phosphate hydrolase  38.2 
 
 		 550 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.235757  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>