More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3585 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3585  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 340 aa  687    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000546261  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  33.84 
 
 		 333 aa  181  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  34.14 
 
 		 341 aa  175  8e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  34.23 
 
 		 339 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2711  alanine racemase  32.93 
 
 		 342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000872573  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4116  maltose operon transcriptional repressor  30.54 
 
 		 340 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271073  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3767  maltose operon transcriptional repressor  30.54 
 
 		 343 aa  157  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1123  maltose operon transcriptional repressor  30.54 
 
 		 343 aa  157  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  30.38 
 
 		 337 aa  156  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3838  LacI family transcription regulator  30.24 
 
 		 343 aa  155  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4061  maltose operon transcriptional repressor  29.94 
 
 		 343 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3919  maltose operon transcriptional repressor  29.94 
 
 		 343 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3751  maltose operon transcriptional repressor  29.94 
 
 		 343 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4134  maltose operon transcriptional repressor  29.94 
 
 		 340 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4226  maltose operon transcriptional repressor  29.94 
 
 		 343 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4028  maltose operon transcriptional repressor  29.94 
 
 		 343 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2870  transcriptional regulator, LacI family  27.25 
 
 		 342 aa  150  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0420  LacI family transcription regulator  32.59 
 
 		 330 aa  150  4e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.130171  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2204  transcriptional regulator, LacI family  32.05 
 
 		 337 aa  149  6e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0416  LacI family transcription regulator  32.91 
 
 		 330 aa  145  7.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1812  LacI family transcription regulator  29 
 
 		 331 aa  145  1e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000564911  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1846  LacI family transcription regulator  29.34 
 
 		 324 aa  142  6e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2575  transcriptional regulator, LacI family  29.31 
 
 		 340 aa  142  7e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000166441  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16200  transcriptional regulator, LacI family  29.12 
 
 		 336 aa  142  7e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00346268  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3654  LacI family transcription regulator  29.06 
 
 		 354 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  28.4 
 
 		 338 aa  142  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0438  alanine racemase  31.14 
 
 		 338 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000864233  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  29.34 
 
 		 338 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0938  LacI family transcription regulator  27.08 
 
 		 340 aa  139  6e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0104625  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.18 
 
 		 339 aa  138  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2691  LacI family transcription regulator  28.49 
 
 		 335 aa  137  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3304  LacI family transcription regulator  27.55 
 
 		 335 aa  137  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1895  LacI family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 339 aa  136  4e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.371942 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  29.33 
 
 		 332 aa  135  7.000000000000001e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00429  transcriptional repressor, LacI family protein  29.03 
 
 		 334 aa  136  7.000000000000001e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  28.31 
 
 		 386 aa  135  8e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.44 
 
 		 337 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0550  LacI family transcription regulator  29.08 
 
 		 336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  27.08 
 
 		 340 aa  134  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1296  catabolite control protein A  28.66 
 
 		 329 aa  132  6.999999999999999e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.48685  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.5 
 
 		 336 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  27.44 
 
 		 329 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0477  transcriptional regulator, LacI family  29.31 
 
 		 352 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2841  transcriptional regulator, LacI family  27.66 
 
 		 345 aa  130  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.595775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1481  transcriptional regulator, LacI family  27.3 
 
 		 342 aa  130  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0506  LacI family transcription regulator  28.7 
 
 		 332 aa  130  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.549777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0389  LacI family transcription regulator  28.14 
 
 		 335 aa  130  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  24.92 
 
 		 337 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.71 
 
 		 330 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1732  transcriptional regulator, LacI family  25.93 
 
 		 340 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521835  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0416  LacI family transcription regulator  29.85 
 
 		 349 aa  128  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.339437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  29.08 
 
 		 332 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7709  LacI family transcription regulator  26.85 
 
 		 337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.78 
 
 		 336 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0838  LacI family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 331 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620074  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1521  transcriptional regulator, LacI family  29.88 
 
 		 342 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000124724  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0768  LacI family transcription regulator  27.16 
 
 		 332 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0915061  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0325  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.23 
 
 		 335 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02195  transcription regulator transcription regulator protein  27.83 
 
 		 355 aa  127  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.479594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2837  transcriptional regulator, LacI family  30.79 
 
 		 344 aa  127  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.672578  normal  0.365252 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1510  LacI family transcription regulator  28.91 
 
 		 348 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3049  transcriptional regulator, LacI family  30.63 
 
 		 336 aa  126  5e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.490257  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  30.59 
 
 		 342 aa  126  6e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1286  putative DNA-binding sucrose operon transcriptional repressor transcription regulator protein  27.62 
 
 		 344 aa  126  7e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.597152 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  26.79 
 
 		 339 aa  125  7e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4918  transcriptional regulator, LacI family  26.96 
 
 		 346 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3841  transcriptional regulator, LacI family  26.96 
 
 		 346 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.455211 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1791  catabolite control protein A  26.81 
 
 		 329 aa  125  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.42313  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1789  transcriptional regulator, LacI family  29.65 
 
 		 343 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1826  catabolite control protein A  26.81 
 
 		 329 aa  125  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000092301  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  27.41 
 
 		 326 aa  125  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  30.34 
 
 		 333 aa  125  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0291  alanine racemase  26.87 
 
 		 367 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.397925  normal  0.910588 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0299  transcriptional regulator protein  24.93 
 
 		 365 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27690  transcriptional regulator  27.53 
 
 		 361 aa  124  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3216  LacI family transcription regulator  29.91 
 
 		 348 aa  124  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0663  transcriptional regulator, LacI family  28.66 
 
 		 338 aa  124  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3665  LacI family transcription regulator  27.94 
 
 		 343 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.34 
 
 		 333 aa  124  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  28.99 
 
 		 337 aa  124  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 342 aa  124  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1561  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.47 
 
 		 348 aa  124  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.63047 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1926  transcriptional regulator, LacI family  28.93 
 
 		 344 aa  123  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0436  catabolite control protein A  26.76 
 
 		 346 aa  123  4e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000109706  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0673  transcriptional regulator, LacI family  25.83 
 
 		 382 aa  123  4e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.208846  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0415  LacI family transcription regulator  28.78 
 
 		 335 aa  123  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.280412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2788  transcriptional regulator, LacI family  26.07 
 
 		 339 aa  123  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3245  transcriptional regulator, LacI family  27.47 
 
 		 344 aa  123  5e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0631  ribose operon repressor  29.64 
 
 		 323 aa  123  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0664  ribose operon repressor  29.64 
 
 		 323 aa  123  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.566043  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  28.24 
 
 		 332 aa  123  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  27.68 
 
 		 336 aa  123  5e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2155  transcriptional regulator, LacI family  28.49 
 
 		 338 aa  122  7e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0809  transcriptional regulator, LacI family  26.39 
 
 		 344 aa  122  7e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.119427 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0721  ribose operon repressor  29.64 
 
 		 323 aa  122  7e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.40772e-23 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3984  LacI family transcription regulator  25.37 
 
 		 339 aa  122  7e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.125023  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0732  ribose operon repressor  29.64 
 
 		 323 aa  122  8e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5512  transcriptional regulator, LacI family  29.13 
 
 		 340 aa  122  9e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0234887 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4642  ribose operon repressor  29.64 
 
 		 323 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.317022  unclonable  5.22733e-26 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  28.87 
 
 		 341 aa  122  9.999999999999999e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>