More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3546 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3546  ABC transporter related  100 
 
 		 247 aa  496  1e-139  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0053  ABC transporter related  58.92 
 
 		 244 aa  304  7e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4465  ABC transporter related  55.65 
 
 		 649 aa  289  3e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2046  ABC transporter related  51.87 
 
 		 605 aa  266  2.9999999999999995e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.985083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0816  ABC transporter related  52.26 
 
 		 254 aa  259  2e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.067607  normal  0.131733 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1406  ABC transporter related  50.22 
 
 		 254 aa  245  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.383526  normal  0.305676 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4048  ABC transporter-like  50 
 
 		 438 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192199  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2313  ABC transporter related  43.6 
 
 		 450 aa  229  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0239499 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3694  ABC transporter related  50.71 
 
 		 429 aa  227  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0651  ABC polysaccharide efflux pump, ATPase subunit  45.83 
 
 		 472 aa  223  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.601465  normal  0.274396 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2515  ABC transporter related  43.67 
 
 		 424 aa  223  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3813  ABC transporter related  47.44 
 
 		 711 aa  223  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.396147  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4318  ABC transporter related  44.4 
 
 		 456 aa  222  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.976448 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3117  ABC transporter related  44.86 
 
 		 436 aa  222  4e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3643  ABC transporter related  43.15 
 
 		 443 aa  222  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000162695  decreased coverage  0.0000834131 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2770  ABC transporter related  49.34 
 
 		 418 aa  221  7e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.906203 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2107  ABC transporter related  50.24 
 
 		 437 aa  221  9.999999999999999e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3088  ABC transporter related  53.27 
 
 		 428 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204093  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0886  ABC transporter related  42.62 
 
 		 493 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4204  ABC transporter related  46.06 
 
 		 424 aa  219  5e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.257703 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4904  ABC transporter-like protein protein  52.22 
 
 		 418 aa  218  5e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4003  ABC transporter related  42.63 
 
 		 457 aa  218  5e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.584674  normal  0.718876 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1647  ABC transporter related  46.06 
 
 		 422 aa  219  5e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2571  ABC transporter related protein  46.05 
 
 		 419 aa  216  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00120547  normal  0.533864 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0858  ABC transporter related  41.91 
 
 		 407 aa  216  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.166623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4136  ABC transporter related  43.09 
 
 		 468 aa  216  4e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000582944 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2358  ABC transporter related  44.18 
 
 		 421 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2802  ABC transporter related protein  52 
 
 		 439 aa  215  7e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2398  ABC transporter related  43.85 
 
 		 488 aa  214  8e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1550  ABC transporter related  46.22 
 
 		 242 aa  214  9e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1228  ABC transporter, ATPase subunit  42.32 
 
 		 416 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2461  ABC transporter, ATPase subunit  42.74 
 
 		 254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00443651  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1398  ABC transporter-related protein  42.74 
 
 		 254 aa  212  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00437719  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1494  ABC transporter related  42.74 
 
 		 254 aa  212  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0356774  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0717  ABC transporter related  42.51 
 
 		 464 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1505  ABC transporter, ATP-binding protein  46.32 
 
 		 422 aa  211  5.999999999999999e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334414  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2757  ABC transporter related  42.21 
 
 		 408 aa  211  5.999999999999999e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  41.63 
 
 		 870 aa  211  7e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2759  ABC transporter related  46.05 
 
 		 428 aa  211  7e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.237153  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1760  ABC transporter related  43.87 
 
 		 415 aa  211  7.999999999999999e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.959569 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3133  ABC transporter related  45.89 
 
 		 423 aa  211  7.999999999999999e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2267  O-antigen export system ATP-binding protein RfbB  48.53 
 
 		 246 aa  211  9e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3883  ABC transporter related  44.5 
 
 		 435 aa  210  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2409  ABC transporter related protein  45.37 
 
 		 415 aa  210  1e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0028  ABC transporter related  48.51 
 
 		 472 aa  211  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2772  ABC transporter related  48.06 
 
 		 419 aa  211  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357847  normal  0.420365 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1244  ATPase  44.55 
 
 		 432 aa  210  2e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000485389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2174  ABC transporter related  40.93 
 
 		 420 aa  209  2e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.108509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3925  ABC transporter related  43.15 
 
 		 449 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.466767 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0625  carbohydrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  45.66 
 
 		 417 aa  209  3e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1075  O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.15 
 
 		 454 aa  209  3e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.164394  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2549  efflux ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.82 
 
 		 415 aa  209  4e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.935109  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1033  ABC transporter related  43.31 
 
 		 427 aa  209  4e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2372  ABC transporter related protein  45.37 
 
 		 411 aa  208  5e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041258 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0371  putative ABC-2 type transport system ATP-binding protein  42.98 
 
 		 410 aa  209  5e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0191  ABC transporter-related protein  41.32 
 
 		 250 aa  208  6e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.903738  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2895  ATPase  47.76 
 
 		 369 aa  208  7e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0955  ABC transporter-related protein  48.08 
 
 		 594 aa  208  7e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1747  ABC transporter related  42.74 
 
 		 400 aa  207  2e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2537  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component  44.54 
 
 		 261 aa  206  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.481808  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3355  ABC transporter related  50.26 
 
 		 429 aa  206  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0293  ABC transporter related  50.25 
 
 		 397 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0293  ABC transporter related  50.25 
 
 		 397 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1102  ABC transporter related  41.47 
 
 		 431 aa  206  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1362  ABC transporter related  43.04 
 
 		 472 aa  206  3e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0452028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3931  ABC transporter related  40.64 
 
 		 446 aa  206  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1314  ABC transporter related  41.25 
 
 		 424 aa  206  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.471926  normal  0.0317706 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3032  ABC transporter related  41.25 
 
 		 478 aa  206  3e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1862  ABC transporter related  48.47 
 
 		 247 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1888  ABC transporter related  48.47 
 
 		 247 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0421  ABC transporter related  41.63 
 
 		 424 aa  205  4e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0545  ABC transporter related  46.63 
 
 		 816 aa  206  4e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.4863 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4620  ABC transporter related  48.76 
 
 		 411 aa  204  7e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.065306 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1557  ABC transporter related  49.25 
 
 		 422 aa  204  7e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5771  ABC transporter related  50.25 
 
 		 429 aa  204  9e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5200  ABC transporter-like protein protein  50.51 
 
 		 243 aa  204  1e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0414197  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2702  ABC transporter related  44.02 
 
 		 427 aa  204  1e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0066609 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0731  ABC transporter, ATPase subunit  40.59 
 
 		 270 aa  204  1e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.461504  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3976  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, ATPase subunit  45.59 
 
 		 435 aa  204  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4590  ABC transporter related  40.82 
 
 		 416 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.10294  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0267  ABC transporter, ATP-binding protein  45.04 
 
 		 393 aa  204  1e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0258  teichoic acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.04 
 
 		 393 aa  204  1e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5891  ABC transporter related  43.21 
 
 		 418 aa  204  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0673  ABC transporter related  39.41 
 
 		 412 aa  203  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00619068  hitchhiker  0.000755206 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0264  ABC transporter, ATP-binding protein  44.73 
 
 		 390 aa  203  2e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3196  ABC transporter related  41.77 
 
 		 433 aa  203  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4203  ABC transporter related  39.2 
 
 		 429 aa  203  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0650  ABC transporter related  39.67 
 
 		 409 aa  202  3e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0564  ABC transporter related  40.68 
 
 		 406 aa  202  3e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0255  teichoic acid translocation ATP-binding protein  44.3 
 
 		 390 aa  202  3e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0939  ABC transporter related  41.06 
 
 		 254 aa  202  4e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00388911 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1725  ABC transporter related  49.48 
 
 		 420 aa  202  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.047923 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4145  ABC transporter-related protein  40.42 
 
 		 429 aa  202  4e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179677 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1434  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  42.92 
 
 		 400 aa  202  5e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.74682  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0319  ABC transporter related  40 
 
 		 455 aa  202  6e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.746089  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07245  ABC transporter, ATP-binding protein  49.75 
 
 		 433 aa  201  9e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0814  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzt  49.74 
 
 		 474 aa  200  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1675  ABC transporter related  51.35 
 
 		 420 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4190  ABC transporter related  41.56 
 
 		 246 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3798  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, ATPase subunit  41.3 
 
 		 448 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>