60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3440 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3440  V-type ATPase, D subunit  100 
 
 		 212 aa  431  1e-120  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19380  V-type ATP synthase subunit D  49.76 
 
 		 208 aa  190  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0524  V-type ATPase, D subunit  41.67 
 
 		 208 aa  160  1e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.913161  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1100  V-type ATPase, D subunit  40.51 
 
 		 206 aa  160  2e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1009  V-type ATPase, D subunit  32.52 
 
 		 212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0067  V-type ATP synthase subunit D  31.25 
 
 		 212 aa  98.6  7e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0300  V-type ATP synthase subunit D  32.32 
 
 		 214 aa  97.8  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1613  V-type ATP synthase subunit D  32.04 
 
 		 214 aa  97.4  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0547  V-type ATP synthase subunit D  32.04 
 
 		 211 aa  95.5  5e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0369  V-type ATP synthase subunit D  32.66 
 
 		 214 aa  93.6  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1137  V-type ATPase, D subunit  29.74 
 
 		 216 aa  93.6  2e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00018509  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2081  H+-transporting two-sector ATPase, D subunit  31.28 
 
 		 205 aa  91.7  7e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.805056  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2343  V-type ATP synthase subunit D  29.95 
 
 		 209 aa  86.3  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.563261 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1441  V-type ATP synthase subunit D  27.09 
 
 		 225 aa  86.3  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0338173  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1245  V-type ATP synthase subunit D  31.07 
 
 		 206 aa  86.3  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2675  V-type ATP synthase subunit D  28.57 
 
 		 213 aa  85.1  8e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0384  V-type ATP synthase subunit D  29.06 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1607  V-type ATP synthase subunit D  27.46 
 
 		 232 aa  83.2  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1286  V-type ATP synthase subunit D  26.21 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2045  V-type ATPase, D subunit  28.57 
 
 		 222 aa  81.6  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1689  V-type ATPase, D subunit  28.14 
 
 		 209 aa  81.3  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.366516 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1684  V-type ATP synthase subunit D  31.19 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0283  V-type ATP synthase subunit D  25.63 
 
 		 228 aa  80.1  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.155382 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1224  V-type ATP synthase subunit D  28.5 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.486034 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1185  V-type ATP synthase subunit D  27.92 
 
 		 209 aa  78.2  0.00000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00722603  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1919  V-type ATP synthase subunit D  25.89 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.487465  normal  0.936893 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1757  V-type ATPase, D subunit  27.88 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2362  V-type ATP synthase subunit D  27.92 
 
 		 209 aa  75.1  0.0000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1366  V-type ATPase, D subunit  25.63 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.190164  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1632  V-type ATPase, D subunit  28.71 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2269  V-type ATP synthase subunit D  25.87 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1455  V-type ATPase, D subunit  27.59 
 
 		 223 aa  72  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.206362  normal  0.242301 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1607  V-type ATP synthase subunit D  26.34 
 
 		 214 aa  72  0.000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0230905  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1888  V-type ATP synthase subunit D  26.34 
 
 		 214 aa  72  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3358  V-type ATPase, D subunit  26 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0963  V-type ATPase D subunit  27.4 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.611183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0289  V-type ATP synthase subunit D  28.43 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3070  V-type ATP synthase subunit D  27.64 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0258  V-type ATPase, D subunit  24.62 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1248  V-type ATPase, D subunit  24.14 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.188247  normal  0.274152 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2562  V-type ATPase, D subunit  28.11 
 
 		 215 aa  64.7  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.930332 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0591  V-type ATPase, D subunit  24 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2761  V-type ATPase, D subunit  27.13 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.329458  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2666  V-type ATPase, D subunit  27.13 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_51058  predicted protein  23.35 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1204  V-type ATPase, D subunit  27.13 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00302283  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0860  V-type ATPase, D subunit  25.4 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1768  V-type ATPase, D subunit  23.53 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00590  vacuolar ATP synthase subunit d, putative  25.12 
 
 		 258 aa  53.9  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2766  V-type ATPase, D subunit  22.73 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1050  V-type ATPase, D subunit  24.37 
 
 		 199 aa  52.4  0.000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0806928 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88668  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  26.34 
 
 		 269 aa  51.6  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.877378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0016  V-type ATPase, D subunit  25.37 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.304681 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80851  vacuolar ATPase V1 domain subunit D  22.17 
 
 		 264 aa  48.9  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0020  V-type ATPase, D subunit  23.08 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0210  V-type ATPase, D subunit  24.09 
 
 		 209 aa  48.1  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1499  V-type ATPase, D subunit  22.22 
 
 		 201 aa  44.7  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6347  hypothetical protein  29.83 
 
 		 319 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.884307  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0425  V-type ATPase, D subunit  25.25 
 
 		 207 aa  43.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73120  hypothetical protein  29.28 
 
 		 319 aa  42.4  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>