More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3416 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3416  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 		 486 aa  1001    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1926  phospholipase D/transphosphatidylase  25.78 
 
 		 582 aa  142  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1886  cardiolipin synthase  26.73 
 
 		 510 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.115754  hitchhiker  0.00782832 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2081  putative phospholipase D  25.3 
 
 		 510 aa  125  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0473  phospholipase-D family protein  24.94 
 
 		 516 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1456  phospholipase D/transphosphatidylase  23.99 
 
 		 522 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3039  phopholipase D domain-containing protein  24.24 
 
 		 510 aa  115  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1039  putative phospholipase D  25.37 
 
 		 558 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2113  phospholipase D protein, putative  25.3 
 
 		 522 aa  114  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2100  phospholipase D/transphosphatidylase  24.67 
 
 		 506 aa  114  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2946  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.37 
 
 		 557 aa  114  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.378913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2125  phospholipase D/transphosphatidylase  24.69 
 
 		 516 aa  113  9e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3384  cardiolipin synthetase, putative  24.47 
 
 		 525 aa  111  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2900  phospholipase D/transphosphatidylase  26.85 
 
 		 507 aa  111  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0104537 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2202  phopholipase D-family protein  25.68 
 
 		 508 aa  111  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.908196 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2395  phospholipase D/transphosphatidylase  25.96 
 
 		 516 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.138129  normal  0.528036 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000670  cardiolipin synthetase  23.46 
 
 		 505 aa  110  8.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5759  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.69 
 
 		 519 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3210  putative phospholipase D protein  25.86 
 
 		 529 aa  108  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.824664 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2014  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.17 
 
 		 551 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.384488  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2154  putative phospholipase D precursor  24.82 
 
 		 517 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.230523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3791  phospholipase D/transphosphatidylase  22.91 
 
 		 516 aa  108  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.102545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2103  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.69 
 
 		 517 aa  107  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0796  phospholipase D/transphosphatidylase  24.03 
 
 		 562 aa  107  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829142  normal  0.0553202 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0194  phospholipase D/transphosphatidylase  26.21 
 
 		 518 aa  107  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.316787  hitchhiker  0.000208167 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0547  phospholipase D/transphosphatidylase  23.55 
 
 		 549 aa  107  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.954131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2752  phospholipase D/transphosphatidylase  23.5 
 
 		 540 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0467  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.15 
 
 		 534 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2777  phospholipase D/transphosphatidylase  24.51 
 
 		 540 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.326922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2139  phospholipase D/transphosphatidylase  23.5 
 
 		 540 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5328  phospholipase D/transphosphatidylase  25.37 
 
 		 517 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0620748 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4980  phospholipase D/transphosphatidylase  25.12 
 
 		 538 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5186  phospholipase D/transphosphatidylase  25.85 
 
 		 517 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0217001 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6079  phospholipase D/transphosphatidylase  25.66 
 
 		 541 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5276  phospholipase D/transphosphatidylase  25.85 
 
 		 517 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5588  putative phospholipase D/transphosphatidylase  23.7 
 
 		 534 aa  104  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.5459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0078  phospholipase D/transphosphatidylase  23.52 
 
 		 502 aa  103  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0603365 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3640  phospholipase D/transphosphatidylase  23.9 
 
 		 516 aa  103  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2668  phospholipase D/transphosphatidylase  25 
 
 		 540 aa  103  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4479  phospholipase D/transphosphatidylase  23.9 
 
 		 516 aa  103  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2801  phospholipase D/transphosphatidylase  24.89 
 
 		 540 aa  103  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4172  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.5 
 
 		 564 aa  103  8e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.900175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4284  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.5 
 
 		 564 aa  103  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.730338 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3887  phospholipase D/transphosphatidylase  23.9 
 
 		 560 aa  103  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40611  normal  0.548496 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1371  phospholipase D/transphosphatidylase  24.53 
 
 		 540 aa  103  9e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130503 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0493  phospholipase D, putative  22.97 
 
 		 553 aa  103  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2346  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.87 
 
 		 524 aa  102  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2702  phospholipase D family protein  23.84 
 
 		 550 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1436  phospholipase D/transphosphatidylase  24.53 
 
 		 540 aa  101  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0951062 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1424  phospholipase D/transphosphatidylase  23.88 
 
 		 544 aa  100  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.105 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2203  phospholipase D/transphosphatidylase  23.41 
 
 		 516 aa  101  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1771  phospholipase D/transphosphatidylase  24.21 
 
 		 515 aa  100  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2558  phospholipase D family protein  23.79 
 
 		 550 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.140702  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0208  putative phospholipase D  23.79 
 
 		 550 aa  100  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1383  putative phospholipase D  23.79 
 
 		 550 aa  100  6e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0978  phospholipase D, putative  24.7 
 
 		 595 aa  100  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.899552  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1580  putative phospholipase D  23.79 
 
 		 550 aa  100  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0239  putative phospholipase D  23.79 
 
 		 550 aa  100  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2951  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.11 
 
 		 529 aa  100  8e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0851513 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0663  phospholipase D/transphosphatidylase  24.02 
 
 		 535 aa  99.8  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000324106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3993  phospholipase D/transphosphatidylase  24.16 
 
 		 517 aa  98.2  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.927932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5532  phospholipase D/transphosphatidylase  25.54 
 
 		 522 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3742  putative phospholipase D protein  22.03 
 
 		 548 aa  97.4  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.135454 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4230  phospholipase D/transphosphatidylase  22.32 
 
 		 575 aa  97.4  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3283  phospholipase D/transphosphatidylase  23.4 
 
 		 505 aa  96.3  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1121  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.2 
 
 		 535 aa  95.5  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0229  phospholipase D/transphosphatidylase  23.01 
 
 		 526 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0032  phospholipase D/transphosphatidylase  24.39 
 
 		 516 aa  95.5  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00522964  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3191  phospholipase D/transphosphatidylase  21.21 
 
 		 576 aa  94.7  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269008  normal  0.521574 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0142  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.82 
 
 		 527 aa  95.1  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.150882  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0845  phospholipase D/transphosphatidylase  23.47 
 
 		 517 aa  94.7  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1811  phospholipase D/transphosphatidylase  22.91 
 
 		 532 aa  94.4  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52997  normal  0.0386663 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0095  phospholipase D family protein  22.53 
 
 		 542 aa  94  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0340  phospholipase D/transphosphatidylase  22.52 
 
 		 519 aa  94  6e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.22272  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5034  phospholipase D/transphosphatidylase  23.63 
 
 		 543 aa  92.8  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.258367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1146  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.81 
 
 		 520 aa  92.8  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000126804  hitchhiker  4.1949e-17 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1462  phospholipase D/transphosphatidylase  23.72 
 
 		 514 aa  92.4  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2055  phospholipase D/transphosphatidylase  23.03 
 
 		 515 aa  92  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0614113  normal  0.204663 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2333  phospholipase D/transphosphatidylase  22.76 
 
 		 514 aa  91.3  4e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.271927 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1562  phospholipase D/transphosphatidylase  22.78 
 
 		 495 aa  90.5  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0457673  normal  0.481198 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4772  phospholipase D/Transphosphatidylase  21.22 
 
 		 583 aa  90.5  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0101  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.32 
 
 		 683 aa  89.7  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0642638  normal  0.0241528 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5665  cardiolipin synthetase  25.76 
 
 		 479 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549714  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1167  phopholipase D  24.24 
 
 		 476 aa  87.4  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.383725  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1732  phospholipase D/transphosphatidylase  22.89 
 
 		 543 aa  87.4  5e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.229068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2285  phopholipase D  24.24 
 
 		 476 aa  87.4  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1166  phopholipase D  24.24 
 
 		 476 aa  87  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.130412  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2085  phopholipase D  24.24 
 
 		 473 aa  87  6e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.169577  normal  0.374109 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01043  predicted hydrolase  24.24 
 
 		 473 aa  87  7e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.951902  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01050  hypothetical protein  24.24 
 
 		 473 aa  87  7e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.795141  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2599  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.24 
 
 		 493 aa  86.7  9e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0536182  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2033  cardiolipin synthetase  25.13 
 
 		 484 aa  86.7  9e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0028874  hitchhiker  0.0000142083 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0421  phospholipase D/Transphosphatidylase  21.81 
 
 		 514 aa  86.3  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0412  phospholipase D/transphosphatidylase  21.52 
 
 		 560 aa  86.3  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127464  hitchhiker  0.00000145574 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1426  phopholipase D  23.99 
 
 		 473 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.33637  normal  0.352917 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2553  phospholipase D/transphosphatidylase  23.99 
 
 		 476 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.424547  normal  0.39142 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70110  putative cardiolipin synthase  23.4 
 
 		 529 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0692  cardiolipin synthase  24.36 
 
 		 532 aa  85.1  0.000000000000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.176026  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0078  phospholipase D/transphosphatidylase  22.8 
 
 		 462 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003804  cardiolipin synthetase  23.85 
 
 		 484 aa  84  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>