More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3181 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3181  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 292 aa  610  1e-173  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2323  transcriptional regulator, AraC family  69.31 
 
 		 289 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.614848  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3264  transcriptional regulator, AraC family  42.38 
 
 		 287 aa  236  2e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0223  transcriptional activator, AraC family  43.69 
 
 		 281 aa  236  4e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178737 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5265  transcriptional regulator, AraC family  43 
 
 		 281 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3846  transcriptional regulator, AraC family  41 
 
 		 287 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0205  transcriptional activator, AraC family  43 
 
 		 281 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000524418 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0990  AraC family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 281 aa  230  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2678  transcriptional regulator, AraC family  41.06 
 
 		 284 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4986  AraC family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 290 aa  210  3e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4582  AraC family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 290 aa  209  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.763033  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4957  transcriptional regulator, AraC family  39.53 
 
 		 290 aa  209  3e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4973  transcriptional regulator, AraC family  37.46 
 
 		 290 aa  209  6e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4947  transcriptional regulator, AraC family  38.13 
 
 		 290 aa  208  9e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0278  transcriptional regulator, AraC family  37.12 
 
 		 290 aa  207  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2759  AraC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 292 aa  207  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4672  AraC family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 290 aa  206  5e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4724  AraC family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 290 aa  205  9e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440387  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5086  AraC family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 290 aa  205  9e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4566  AraC family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 290 aa  204  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3174  AraC family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 280 aa  202  6e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.626893  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2556  AraC family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 290 aa  199  6e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000235949  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2210  transcriptional regulator, AraC family  36.39 
 
 		 291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3564  transcriptional regulator, AraC family  37.79 
 
 		 285 aa  196  5.000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1922  transcriptional regulator, AraC family  36.58 
 
 		 291 aa  188  8e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.890213  normal  0.89853 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3138  AraC family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 281 aa  177  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0011  transcriptional regulator, AraC family  33.77 
 
 		 285 aa  177  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871788  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3142  AraC family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 301 aa  176  5e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1802  transcriptional regulator, AraC family  33.22 
 
 		 286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2780  transcriptional regulator, AraC family  34.49 
 
 		 285 aa  159  4e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0531003  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2251  transcriptional regulator, AraC family  33 
 
 		 287 aa  159  5e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2107  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 313 aa  159  6e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.342925  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1266  AraC family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 300 aa  150  3e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.23796  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1127  transcriptional regulator, AraC family  31.29 
 
 		 288 aa  145  6e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1790  transcriptional regulator, AraC family  32.12 
 
 		 282 aa  142  4e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.191731  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0137  AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 315 aa  135  9e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.10009 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0329  transcription activator effector binding protein  28.09 
 
 		 288 aa  134  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0236652  normal  0.0105288 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2127  transcription activator effector binding protein  29.97 
 
 		 290 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3344  helix-turn-helix domain-containing protein  33.67 
 
 		 232 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.388455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1798  transcriptional regulator, AraC family  40.57 
 
 		 200 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0674  AraC family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 265 aa  127  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0424  transcriptional regulator, AraC family  30.61 
 
 		 281 aa  126  3e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1784  AraC family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000275244  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 300 aa  122  8e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  27.54 
 
 		 300 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  27.3 
 
 		 300 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 300 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1036  AraC family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1013  AraC family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.126228  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1194  transcriptional regulator, AraC family  27.63 
 
 		 300 aa  116  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1271  transcriptional regulator, AraC family  27.21 
 
 		 300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0086  transcriptional regulator, AraC family  25.77 
 
 		 313 aa  96.3  6e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.353006  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1353  transcription activator effector binding  33.53 
 
 		 160 aa  93.2  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.266351  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6275  AraC family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 279 aa  92  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0076  transcription activator, effector binding  25.61 
 
 		 288 aa  90.1  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1472  AraC family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 294 aa  89  8e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.102681  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2797  transcription activator effector binding  26.81 
 
 		 279 aa  89  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.338998 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1069  AraC family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 293 aa  88.6  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.689445  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1952  AraC family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 271 aa  88.6  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0598764  normal  0.641899 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0853  transcriptional regulator, AraC family  27.67 
 
 		 284 aa  87.4  3e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06300  methylphosphotriester-DNA alkyltransferase  26.22 
 
 		 302 aa  87  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0186  transcriptional regulator, AraC family  38.62 
 
 		 452 aa  86.7  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0165  AraC family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 298 aa  86.3  6e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3356  transcription activator, effector binding  25.17 
 
 		 288 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3431  transcription activator, effector binding  25.17 
 
 		 288 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3425  transcription activator, effector binding  25.17 
 
 		 288 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3983  transcriptional regulator, AraC family  30.54 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3564  AraC family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 279 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.236142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1594  transcription activator effector binding  30.11 
 
 		 297 aa  82.8  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.630007  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1563  transcription activator, effector binding  30.11 
 
 		 297 aa  82.8  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1217  transcription activator, effector binding  26.04 
 
 		 288 aa  82  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2173  AraC family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 289 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.671765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1774  AraC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 289 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.524324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3526  transcription activator, effector binding  25 
 
 		 288 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0216  transcriptional regulator, AraC family  28.02 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3715  transcriptional regulator, AraC family  23.75 
 
 		 279 aa  80.9  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.424878 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1224  AraC family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 288 aa  80.1  0.00000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0494811  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3161  AraC family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 277 aa  80.1  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3088  AraC family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.530109  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0179  AraC family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 299 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0147136  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0211  transcriptional regulator, AraC family  27.88 
 
 		 299 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3503  transcription activator, effector binding  25.42 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00111619  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0192  AraC family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 299 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0191  AraC family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 299 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3086  transcriptional regulator, AraC family  25.42 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.164604  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06471  hypothetical protein  24.25 
 
 		 289 aa  79.3  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1474  transcriptional regulator, AraC family  24.64 
 
 		 286 aa  79.3  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0910  HTH-type transcription regulator, AraC-family  22.3 
 
 		 298 aa  78.6  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.576456  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3417  transcriptional regulator, AraC family  23.51 
 
 		 279 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.27768  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0182  AraC family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 299 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3953  AraC family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 287 aa  79  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0509927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2938  AraC family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 279 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000611  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  22.87 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0208776  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0693  transposon Tn10 TetD protein  35.35 
 
 		 113 aa  76.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.808673  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2843  AraC family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.538425  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3482  AraC family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 140 aa  76.6  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3069  transcriptional regulator, AraC family  25.75 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3057  AraC family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.118978  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>