64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2809 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2809  chromosome segregation ATPase-like protein  100 
 
 
2228 aa  4004    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1389  hypothetical protein  23.73 
 
 
898 aa  114  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3522  hemagluttinin domain-containing protein  29.86 
 
 
1487 aa  100  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0140  PKD domain containing protein  24.25 
 
 
1362 aa  86.3  0.000000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0860  hypothetical protein  15.72 
 
 
752 aa  86.3  0.000000000000007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.294575  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2389  hypothetical protein  25.67 
 
 
357 aa  77  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1776  surface-exposed protein  20.29 
 
 
1766 aa  66.2  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.885924  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1343  chromosome segregation ATPases-like  22.99 
 
 
321 aa  63.9  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1075  chromosome segregation ATPase-like protein  16.96 
 
 
1206 aa  62.4  0.00000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1337  hypothetical protein  18.58 
 
 
335 aa  61.6  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.629526 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0863  S-layer domain protein  21.2 
 
 
694 aa  60.5  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000121904  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1831  chromosome segregation protein SMC  19.55 
 
 
1147 aa  59.3  0.0000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  23.27 
 
 
1190 aa  58.5  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3505  Chromosome segregation ATPase-like protein  20.45 
 
 
1153 aa  58.5  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.293824  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4392  BRCT domain protein  15.47 
 
 
783 aa  57  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.100979 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3196  hypothetical protein  19.15 
 
 
209 aa  57  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0047  S-layer domain-containing protein  19.71 
 
 
468 aa  57  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498121  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1177  coiled-coil protein  19.21 
 
 
243 aa  56.2  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1614  Chromosome segregation ATPase-like protein  19.38 
 
 
1235 aa  55.1  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1387  hypothetical protein  28.93 
 
 
310 aa  54.7  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10080  chromosome segregation protein SMC  19.68 
 
 
1174 aa  54.3  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.503151  hitchhiker  0.00000182837 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1084  hypothetical protein  24.29 
 
 
196 aa  53.9  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00445822  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33608  predicted protein  15.37 
 
 
656 aa  53.1  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.145963  normal  0.0588293 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1219  hypothetical protein  20 
 
 
567 aa  53.1  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000368049 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  19.13 
 
 
1169 aa  53.1  0.00006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  19.23 
 
 
1169 aa  52.8  0.00008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7171  hemagluttinin/autotransporter adhesin  22.47 
 
 
1451 aa  52.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1360  glycosyl transferase, group 1  18.93 
 
 
1991 aa  52  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.976549  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1770  3D domain-containing protein  23.95 
 
 
526 aa  50.4  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.103231  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1630  hypothetical protein  13.43 
 
 
1246 aa  50.4  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0499126 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0463  putative membrane-anchored cell surface protein  25.51 
 
 
1616 aa  50.1  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.590511  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0715  S-layer domain-containing protein  16.57 
 
 
1036 aa  50.1  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4193  phage infection protein  10.39 
 
 
1114 aa  49.7  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0810  YadA-like C-terminal region protein  32.22 
 
 
459 aa  49.7  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1599  YadA-like C-terminal region protein  32.22 
 
 
459 aa  49.7  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1891  hypothetical protein  13.39 
 
 
915 aa  49.7  0.0006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0646  YadA-like C-terminal region protein  32.22 
 
 
459 aa  49.7  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0378174  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1168  surface-exposed protein  19.55 
 
 
1705 aa  49.7  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2988  hemolysin-type calcium-binding region  21.14 
 
 
4519 aa  49.3  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0549  hypothetical protein  14.51 
 
 
767 aa  49.3  0.0009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5048  hemagluttinin domain-containing protein  27.27 
 
 
2814 aa  48.9  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0368  peptidase M23  16.37 
 
 
554 aa  48.5  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000678995  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0350  peptidase M23B  16.37 
 
 
546 aa  48.5  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000961485  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1392  2 domain protein  20.49 
 
 
252 aa  48.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5223  hemagluttinin domain-containing protein  27.27 
 
 
2778 aa  48.9  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.224013 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3144  hemagluttinin motif-containing protein  27.27 
 
 
2728 aa  48.9  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1426  hypothetical protein  20.49 
 
 
252 aa  48.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.387775  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3340  hypothetical protein  18.72 
 
 
388 aa  48.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3590  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) domain-like  22.37 
 
 
740 aa  47.8  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1846  hypothetical protein  27.52 
 
 
278 aa  47.8  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0150  Apolipoprotein A1/A4/E  16.96 
 
 
7659 aa  48.1  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1516  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  20.29 
 
 
1211 aa  48.1  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.96 
 
 
632 aa  47.8  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1497  chromosome segregation ATPase-like protein  16.36 
 
 
1209 aa  47.8  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.440626 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0441  outer membrane protein, haemagluttinin-like  27.06 
 
 
2866 aa  47  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192445  normal  0.347106 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3269  low complexity protein, contains internal repeats QQVlQQDVAQLQAG  18 
 
 
198 aa  46.6  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5644  putative cell wall endopeptidase, NlpC/P60 family  18.5 
 
 
476 aa  46.6  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000146181  decreased coverage  1.76624e-19 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6584  YadA domain-containing protein  27.38 
 
 
898 aa  46.2  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1402  electron transport complex protein RnfC  18.36 
 
 
944 aa  46.2  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.860812 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  18.31 
 
 
1301 aa  46.2  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1694  triple helix repeat-containing collagen  41.1 
 
 
1148 aa  46.2  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3381  hypothetical protein  20.41 
 
 
233 aa  46.2  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1143  hypothetical protein  21.87 
 
 
553 aa  46.2  0.008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000416489  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2048  putative outer membrane protein  28.68 
 
 
322 aa  46.2  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>