22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3340 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3340  hypothetical protein  100 
 
 		 388 aa  771    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3083  hypothetical protein  90.93 
 
 		 386 aa  647    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2610  hypothetical protein  42.78 
 
 		 360 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3531  hypothetical protein  43.58 
 
 		 240 aa  125  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131257  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4252  hypothetical protein  28.76 
 
 		 398 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0330883  normal  0.793995 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3381  hypothetical protein  26.19 
 
 		 419 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0515  hypothetical protein  26 
 
 		 418 aa  77.4  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.794076 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6565  hypothetical protein  30.08 
 
 		 424 aa  75.9  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3683  hypothetical protein  31.35 
 
 		 431 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0212392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3925  hypothetical protein  29.46 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00761065  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2209  hypothetical protein  29.56 
 
 		 394 aa  65.1  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1573  hypothetical protein  26.78 
 
 		 310 aa  59.3  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2304  hypothetical protein  41.27 
 
 		 356 aa  58.2  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00594097 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3484  hypothetical protein  44.26 
 
 		 460 aa  53.5  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.449846 
 
 
-
 
NC_004310  BR1595  hypothetical protein  27 
 
 		 311 aa  51.6  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0629024  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1812  hypothetical protein  26.28 
 
 		 426 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1790  hypothetical protein  40.98 
 
 		 240 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.581341 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1538  hypothetical protein  25.51 
 
 		 321 aa  50.1  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.820052  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3532  hypothetical protein  48.28 
 
 		 102 aa  45.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.108786  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2126  hypothetical protein  39.29 
 
 		 240 aa  44.7  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2809  chromosome segregation ATPase-like protein  20.09 
 
 		 2228 aa  43.5  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  19.82 
 
 		 1174 aa  43.1  0.009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>