20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3484 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3484  hypothetical protein  100 
 
 		 460 aa  876    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.449846 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0515  hypothetical protein  29.83 
 
 		 418 aa  120  6e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.794076 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3925  hypothetical protein  34.3 
 
 		 410 aa  117  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00761065  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3381  hypothetical protein  29 
 
 		 419 aa  117  6e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6565  hypothetical protein  32.13 
 
 		 424 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3683  hypothetical protein  31.08 
 
 		 431 aa  113  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0212392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4252  hypothetical protein  30.27 
 
 		 398 aa  96.7  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0330883  normal  0.793995 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1812  hypothetical protein  30.12 
 
 		 426 aa  94  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2304  hypothetical protein  50 
 
 		 356 aa  72  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00594097 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2209  hypothetical protein  27.68 
 
 		 394 aa  69.7  0.00000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1790  hypothetical protein  40 
 
 		 240 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.581341 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2126  hypothetical protein  50.72 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4844  hypothetical protein  50.67 
 
 		 305 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.209251  normal  0.0867479 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2610  hypothetical protein  29.21 
 
 		 360 aa  57.8  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3340  hypothetical protein  25.99 
 
 		 388 aa  57.4  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1686  hypothetical protein  54.41 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112291  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1718  hypothetical protein  37.74 
 
 		 231 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.517761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3083  hypothetical protein  44.26 
 
 		 386 aa  53.9  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2167  hypothetical protein  44.44 
 
 		 247 aa  45.1  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.274445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1573  hypothetical protein  37.1 
 
 		 310 aa  44.3  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>