19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2209 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2209  hypothetical protein  100 
 
 
394 aa  754    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3381  hypothetical protein  28.74 
 
 
419 aa  120  6e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0515  hypothetical protein  30.19 
 
 
418 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.794076 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3925  hypothetical protein  31.27 
 
 
410 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00761065  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3683  hypothetical protein  29.6 
 
 
431 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0212392  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6565  hypothetical protein  28.07 
 
 
424 aa  110  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4252  hypothetical protein  28.33 
 
 
398 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0330883  normal  0.793995 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3340  hypothetical protein  29.82 
 
 
388 aa  95.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1812  hypothetical protein  27.82 
 
 
426 aa  93.6  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2610  hypothetical protein  30.2 
 
 
360 aa  89.4  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1573  hypothetical protein  28.97 
 
 
310 aa  88.6  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3083  hypothetical protein  28.47 
 
 
386 aa  80.5  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_004310  BR1595  hypothetical protein  31.84 
 
 
311 aa  71.6  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0629024  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3484  hypothetical protein  27.68 
 
 
460 aa  70.1  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.449846 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1538  hypothetical protein  31.43 
 
 
321 aa  69.3  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.820052  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2304  hypothetical protein  32.41 
 
 
356 aa  65.1  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00594097 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1790  hypothetical protein  46.25 
 
 
240 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.581341 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2126  hypothetical protein  45.33 
 
 
240 aa  46.2  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229004  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2167  hypothetical protein  26.29 
 
 
247 aa  42.7  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.274445  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>