22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2304 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2304  hypothetical protein  100 
 
 		 356 aa  672    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00594097 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3925  hypothetical protein  34.5 
 
 		 410 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00761065  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3683  hypothetical protein  31.85 
 
 		 431 aa  97.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0212392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6565  hypothetical protein  32.97 
 
 		 424 aa  96.3  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4252  hypothetical protein  33.51 
 
 		 398 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0330883  normal  0.793995 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3381  hypothetical protein  30.41 
 
 		 419 aa  83.2  0.000000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0515  hypothetical protein  28.89 
 
 		 418 aa  80.9  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.794076 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1812  hypothetical protein  30.37 
 
 		 426 aa  73.9  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1790  hypothetical protein  52.27 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.581341 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3484  hypothetical protein  50 
 
 		 460 aa  72  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.449846 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2126  hypothetical protein  51.81 
 
 		 240 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2209  hypothetical protein  31.76 
 
 		 394 aa  65.5  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1718  hypothetical protein  50.6 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.517761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2610  hypothetical protein  49.21 
 
 		 360 aa  63.9  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4844  hypothetical protein  50 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.209251  normal  0.0867479 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3083  hypothetical protein  41.27 
 
 		 386 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3340  hypothetical protein  30.66 
 
 		 388 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4041  hypothetical protein  43.36 
 
 		 237 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.485745  normal  0.10091 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1686  hypothetical protein  51.43 
 
 		 309 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112291  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1022  hypothetical protein  52.69 
 
 		 252 aa  48.9  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.709191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2167  hypothetical protein  53.85 
 
 		 247 aa  45.4  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.274445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1573  hypothetical protein  37.1 
 
 		 310 aa  45.8  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>