27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0515 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0515  hypothetical protein  100 
 
 
418 aa  822    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.794076 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3381  hypothetical protein  76.08 
 
 
419 aa  610  1e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6565  hypothetical protein  56.64 
 
 
424 aa  434  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1812  hypothetical protein  56.97 
 
 
426 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3925  hypothetical protein  52.05 
 
 
410 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00761065  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3683  hypothetical protein  51.95 
 
 
431 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0212392  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4252  hypothetical protein  51.79 
 
 
398 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0330883  normal  0.793995 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3484  hypothetical protein  32.89 
 
 
460 aa  113  6e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.449846 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2209  hypothetical protein  33.52 
 
 
394 aa  89.4  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4844  hypothetical protein  43.64 
 
 
305 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.209251  normal  0.0867479 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3340  hypothetical protein  25.89 
 
 
388 aa  76.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3083  hypothetical protein  26.6 
 
 
386 aa  75.5  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2610  hypothetical protein  28.08 
 
 
360 aa  74.7  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2304  hypothetical protein  34.21 
 
 
356 aa  73.2  0.000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00594097 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1790  hypothetical protein  42.05 
 
 
240 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.581341 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1686  hypothetical protein  41.27 
 
 
309 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112291  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2126  hypothetical protein  42.17 
 
 
240 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229004  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1718  hypothetical protein  42.17 
 
 
231 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.517761  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1538  hypothetical protein  27.6 
 
 
321 aa  57.4  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.820052  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1595  hypothetical protein  27.03 
 
 
311 aa  56.6  0.0000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0629024  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1573  hypothetical protein  23.33 
 
 
310 aa  51.2  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1360  glycosyl transferase, group 1  22.35 
 
 
1991 aa  44.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.976549  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89715  predicted protein  23.72 
 
 
3060 aa  44.3  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.288694 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3505  Chromosome segregation ATPase-like protein  32.8 
 
 
1153 aa  43.9  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.293824  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2946  FkbM family methyltransferase  23.17 
 
 
786 aa  43.5  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50506  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2638  chromosome segregation protein SMC  22.53 
 
 
1308 aa  43.5  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1497  chromosome segregation ATPase-like protein  23.48 
 
 
1209 aa  43.5  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.440626 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>