21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2610 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2610  hypothetical protein  100 
 
 		 360 aa  697    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3340  hypothetical protein  42.78 
 
 		 388 aa  235  8e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3083  hypothetical protein  41.98 
 
 		 386 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3531  hypothetical protein  37.9 
 
 		 240 aa  91.7  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131257  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1595  hypothetical protein  27.84 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0629024  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1538  hypothetical protein  27.3 
 
 		 321 aa  76.6  0.0000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.820052  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1573  hypothetical protein  27.22 
 
 		 310 aa  75.9  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0515  hypothetical protein  28.08 
 
 		 418 aa  74.7  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.794076 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3381  hypothetical protein  27.95 
 
 		 419 aa  74.3  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3925  hypothetical protein  29.11 
 
 		 410 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00761065  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3683  hypothetical protein  26.05 
 
 		 431 aa  66.2  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0212392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2304  hypothetical protein  49.21 
 
 		 356 aa  63.9  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00594097 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6565  hypothetical protein  25.19 
 
 		 424 aa  63.2  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4252  hypothetical protein  22.6 
 
 		 398 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0330883  normal  0.793995 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3532  hypothetical protein  48.61 
 
 		 102 aa  61.6  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.108786  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3484  hypothetical protein  29.21 
 
 		 460 aa  58.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.449846 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1812  hypothetical protein  28.61 
 
 		 426 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1790  hypothetical protein  42.35 
 
 		 240 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.581341 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2167  hypothetical protein  32.33 
 
 		 247 aa  48.5  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.274445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2126  hypothetical protein  43.86 
 
 		 240 aa  44.3  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4844  hypothetical protein  45.16 
 
 		 305 aa  42.7  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.209251  normal  0.0867479 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>