18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1595 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1595  hypothetical protein  100 
 
 
311 aa  613  9.999999999999999e-175  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0629024  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1538  hypothetical protein  99.04 
 
 
321 aa  606  9.999999999999999e-173  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.820052  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1573  hypothetical protein  74.92 
 
 
310 aa  418  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2610  hypothetical protein  27.84 
 
 
360 aa  97.1  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3683  hypothetical protein  30.17 
 
 
431 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0212392  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3381  hypothetical protein  28.12 
 
 
419 aa  80.9  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3925  hypothetical protein  31.4 
 
 
410 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00761065  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2209  hypothetical protein  31.33 
 
 
394 aa  77  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4252  hypothetical protein  27.3 
 
 
398 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0330883  normal  0.793995 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3340  hypothetical protein  26.17 
 
 
388 aa  73.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0515  hypothetical protein  26.96 
 
 
418 aa  71.6  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.794076 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6565  hypothetical protein  30.27 
 
 
424 aa  70.9  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1812  hypothetical protein  33.87 
 
 
426 aa  63.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3484  hypothetical protein  29.06 
 
 
460 aa  59.3  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.449846 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3083  hypothetical protein  28.84 
 
 
386 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2304  hypothetical protein  37.68 
 
 
356 aa  51.6  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00594097 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1790  hypothetical protein  42.03 
 
 
240 aa  45.8  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.581341 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4844  hypothetical protein  33.33 
 
 
305 aa  42.7  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.209251  normal  0.0867479 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>