24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4252 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4252  hypothetical protein  100 
 
 		 398 aa  771    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0330883  normal  0.793995 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3925  hypothetical protein  66.67 
 
 		 410 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00761065  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3683  hypothetical protein  62.3 
 
 		 431 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0212392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6565  hypothetical protein  63.59 
 
 		 424 aa  481  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3381  hypothetical protein  59.38 
 
 		 419 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1812  hypothetical protein  62.09 
 
 		 426 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0515  hypothetical protein  51.79 
 
 		 418 aa  398  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.794076 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3484  hypothetical protein  33.04 
 
 		 460 aa  100  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.449846 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2209  hypothetical protein  33.88 
 
 		 394 aa  95.5  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3340  hypothetical protein  28.27 
 
 		 388 aa  88.6  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3083  hypothetical protein  28.72 
 
 		 386 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2304  hypothetical protein  33.33 
 
 		 356 aa  82.4  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00594097 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4844  hypothetical protein  39.09 
 
 		 305 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.209251  normal  0.0867479 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1790  hypothetical protein  40.45 
 
 		 240 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.581341 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1538  hypothetical protein  29.16 
 
 		 321 aa  64.7  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.820052  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1573  hypothetical protein  23.98 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1595  hypothetical protein  29.11 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0629024  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2610  hypothetical protein  25.13 
 
 		 360 aa  63.2  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2126  hypothetical protein  40.48 
 
 		 240 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1718  hypothetical protein  40.48 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.517761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1686  hypothetical protein  37.9 
 
 		 309 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112291  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4041  hypothetical protein  36.3 
 
 		 237 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.485745  normal  0.10091 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2167  hypothetical protein  27.49 
 
 		 247 aa  48.5  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.274445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1948  putative vesicular transport factor Uso1p  26.79 
 
 		 751 aa  44.7  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0175647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>