22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1686 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1686  hypothetical protein  100 
 
 		 309 aa  568  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112291  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4844  hypothetical protein  82.35 
 
 		 305 aa  397  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.209251  normal  0.0867479 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1790  hypothetical protein  48.5 
 
 		 240 aa  100  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.581341 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6565  hypothetical protein  34.48 
 
 		 424 aa  94.7  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2126  hypothetical protein  47.53 
 
 		 240 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3381  hypothetical protein  33.45 
 
 		 419 aa  90.9  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0515  hypothetical protein  41.27 
 
 		 418 aa  90.1  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.794076 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1718  hypothetical protein  46.75 
 
 		 231 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.517761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3683  hypothetical protein  40.91 
 
 		 431 aa  85.9  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0212392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4252  hypothetical protein  37.3 
 
 		 398 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0330883  normal  0.793995 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3925  hypothetical protein  40 
 
 		 410 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00761065  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2304  hypothetical protein  41.29 
 
 		 356 aa  78.2  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00594097 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3484  hypothetical protein  50.67 
 
 		 460 aa  73.2  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.449846 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1812  hypothetical protein  40.91 
 
 		 426 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4041  hypothetical protein  54.9 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.485745  normal  0.10091 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2209  hypothetical protein  46.67 
 
 		 394 aa  58.9  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2610  hypothetical protein  32 
 
 		 360 aa  55.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1022  hypothetical protein  53.54 
 
 		 252 aa  53.5  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.709191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3083  hypothetical protein  37.7 
 
 		 386 aa  49.3  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1573  hypothetical protein  43.55 
 
 		 310 aa  48.5  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3340  hypothetical protein  37.7 
 
 		 388 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_004310  BR1595  hypothetical protein  35.97 
 
 		 311 aa  42.7  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0629024  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>