20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4041 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4041  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  436  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.485745  normal  0.10091 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1718  hypothetical protein  51.43 
 
 
231 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.517761  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2126  hypothetical protein  48.79 
 
 
240 aa  132  6e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229004  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1790  hypothetical protein  49.16 
 
 
240 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.581341 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4844  hypothetical protein  55.36 
 
 
305 aa  91.7  9e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.209251  normal  0.0867479 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2304  hypothetical protein  43.87 
 
 
356 aa  90.9  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00594097 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6565  hypothetical protein  32.03 
 
 
424 aa  85.5  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1686  hypothetical protein  35.37 
 
 
309 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112291  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0515  hypothetical protein  33.78 
 
 
418 aa  76.6  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.794076 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3683  hypothetical protein  35.51 
 
 
431 aa  75.5  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0212392  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3381  hypothetical protein  33.11 
 
 
419 aa  73.6  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4252  hypothetical protein  35.54 
 
 
398 aa  73.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0330883  normal  0.793995 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3925  hypothetical protein  31.73 
 
 
410 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00761065  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3484  hypothetical protein  32.57 
 
 
460 aa  67  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.449846 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1812  hypothetical protein  37.68 
 
 
426 aa  63.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2610  hypothetical protein  47.46 
 
 
360 aa  58.5  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1022  hypothetical protein  46.67 
 
 
252 aa  57  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.709191  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3083  hypothetical protein  28.57 
 
 
386 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2209  hypothetical protein  31.06 
 
 
394 aa  54.3  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3340  hypothetical protein  32.23 
 
 
388 aa  53.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0818449 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>