20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3083 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3340  hypothetical protein  90.93 
 
 
388 aa  669    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3083  hypothetical protein  100 
 
 
386 aa  765    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2610  hypothetical protein  41.91 
 
 
360 aa  239  4e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3531  hypothetical protein  43.58 
 
 
240 aa  124  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131257  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3381  hypothetical protein  27.4 
 
 
419 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4252  hypothetical protein  28.42 
 
 
398 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0330883  normal  0.793995 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0515  hypothetical protein  26.63 
 
 
418 aa  77.8  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.794076 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6565  hypothetical protein  27.04 
 
 
424 aa  77.8  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3683  hypothetical protein  31.15 
 
 
431 aa  73.2  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0212392  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3925  hypothetical protein  28.68 
 
 
410 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00761065  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2209  hypothetical protein  29.56 
 
 
394 aa  58.9  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1573  hypothetical protein  26.22 
 
 
310 aa  58.9  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2304  hypothetical protein  41.27 
 
 
356 aa  58.5  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00594097 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3484  hypothetical protein  44.26 
 
 
460 aa  53.5  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.449846 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1812  hypothetical protein  27.05 
 
 
426 aa  53.1  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1790  hypothetical protein  40.98 
 
 
240 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.581341 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3532  hypothetical protein  41.33 
 
 
102 aa  45.8  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.108786  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2126  hypothetical protein  39.29 
 
 
240 aa  45.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229004  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1595  hypothetical protein  25.58 
 
 
311 aa  43.1  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0629024  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1538  hypothetical protein  44.83 
 
 
321 aa  42.7  0.01  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.820052  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>