24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3925 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3925  hypothetical protein  100 
 
 		 410 aa  786    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00761065  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3683  hypothetical protein  80.14 
 
 		 431 aa  619  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0212392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1812  hypothetical protein  69.2 
 
 		 426 aa  511  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6565  hypothetical protein  63.86 
 
 		 424 aa  503  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4252  hypothetical protein  66.67 
 
 		 398 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0330883  normal  0.793995 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3381  hypothetical protein  57.21 
 
 		 419 aa  432  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0515  hypothetical protein  53.35 
 
 		 418 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.794076 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2209  hypothetical protein  29.22 
 
 		 394 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3484  hypothetical protein  38.43 
 
 		 460 aa  112  8.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.449846 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2304  hypothetical protein  35.68 
 
 		 356 aa  89  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00594097 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4844  hypothetical protein  41.82 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.209251  normal  0.0867479 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3340  hypothetical protein  29.72 
 
 		 388 aa  73.2  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1573  hypothetical protein  28.21 
 
 		 310 aa  71.2  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3083  hypothetical protein  26.7 
 
 		 386 aa  71.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2610  hypothetical protein  29.27 
 
 		 360 aa  67.8  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1790  hypothetical protein  41.57 
 
 		 240 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.581341 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2126  hypothetical protein  41.67 
 
 		 240 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229004  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1595  hypothetical protein  31.4 
 
 		 311 aa  59.3  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0629024  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1538  hypothetical protein  31.82 
 
 		 321 aa  58.5  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.820052  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1718  hypothetical protein  41.67 
 
 		 231 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.517761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1686  hypothetical protein  50.7 
 
 		 309 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112291  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2167  hypothetical protein  29.41 
 
 		 247 aa  49.7  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.274445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4041  hypothetical protein  34.81 
 
 		 237 aa  45.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.485745  normal  0.10091 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1360  glycosyl transferase, group 1  24.08 
 
 		 1991 aa  44.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.976549  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>