26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6565 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6565  hypothetical protein  100 
 
 		 424 aa  823    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1812  hypothetical protein  68.21 
 
 		 426 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3925  hypothetical protein  62.11 
 
 		 410 aa  501  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00761065  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3683  hypothetical protein  64.37 
 
 		 431 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0212392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3381  hypothetical protein  63.76 
 
 		 419 aa  495  1e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4252  hypothetical protein  62.88 
 
 		 398 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0330883  normal  0.793995 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0515  hypothetical protein  57.21 
 
 		 418 aa  442  1e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.794076 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3484  hypothetical protein  36.68 
 
 		 460 aa  109  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.449846 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2209  hypothetical protein  33.51 
 
 		 394 aa  95.5  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2304  hypothetical protein  31.68 
 
 		 356 aa  86.7  7e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00594097 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3340  hypothetical protein  27.41 
 
 		 388 aa  77.4  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3083  hypothetical protein  26.49 
 
 		 386 aa  77  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1790  hypothetical protein  46.07 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.581341 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4844  hypothetical protein  41.82 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.209251  normal  0.0867479 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2126  hypothetical protein  46.43 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1718  hypothetical protein  46.43 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.517761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2610  hypothetical protein  25.19 
 
 		 360 aa  63.5  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1573  hypothetical protein  27.94 
 
 		 310 aa  62  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1686  hypothetical protein  42.73 
 
 		 309 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112291  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1538  hypothetical protein  32.1 
 
 		 321 aa  55.1  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.820052  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1595  hypothetical protein  32.1 
 
 		 311 aa  55.8  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0629024  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89715  predicted protein  23.57 
 
 		 3060 aa  50.1  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.288694 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2167  hypothetical protein  34.3 
 
 		 247 aa  48.5  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.274445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4041  hypothetical protein  37.04 
 
 		 237 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.485745  normal  0.10091 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_18871  predicted protein  25.65 
 
 		 1682 aa  45.1  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00445245  hitchhiker  0.0000013419 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1234  large adhesin  32 
 
 		 4526 aa  44.3  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>