10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2167 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2167  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  475  1e-133  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.274445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3381  hypothetical protein  28.65 
 
 		 419 aa  51.6  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3683  hypothetical protein  28.07 
 
 		 431 aa  49.3  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0212392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3925  hypothetical protein  29.41 
 
 		 410 aa  48.9  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00761065  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2610  hypothetical protein  32.33 
 
 		 360 aa  48.5  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6565  hypothetical protein  33.87 
 
 		 424 aa  48.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2304  hypothetical protein  53.85 
 
 		 356 aa  45.4  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00594097 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3484  hypothetical protein  40.35 
 
 		 460 aa  44.3  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.449846 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4252  hypothetical protein  27.49 
 
 		 398 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0330883  normal  0.793995 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2209  hypothetical protein  26.29 
 
 		 394 aa  42.7  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>