233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1486 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1486  selenide, water dikinase  100 
 
 		 340 aa  693    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1661  selenide, water dikinase  53.73 
 
 		 342 aa  363  3e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4589  selenide, water dikinase  53.69 
 
 		 340 aa  362  5.0000000000000005e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2374  selenide, water dikinase  50.88 
 
 		 343 aa  343  2.9999999999999997e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2086  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  50.58 
 
 		 343 aa  341  1e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0368  selenide, water dikinase  50.3 
 
 		 337 aa  329  3e-89  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1707  selenide, water dikinase  48.96 
 
 		 348 aa  324  1e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134481  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0304  selenide, water dikinase  49.85 
 
 		 347 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.480411  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3076  selenide, water dikinase  50.95 
 
 		 347 aa  305  8.000000000000001e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000815299 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2461  selenide, water dikinase (selenocysteine-containing)  48.95 
 
 		 354 aa  297  2e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000145839  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3401  selenide, water dikinase  54.33 
 
 		 317 aa  296  4e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0323823 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1625  selenophosphate synthase  47.11 
 
 		 328 aa  291  8e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000489254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0252  selenide, water dikinase  47.76 
 
 		 352 aa  291  9e-78  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0491527 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3249  selenide, water dikinase  47.59 
 
 		 316 aa  279  4e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0099  selenophosphate synthase  45.43 
 
 		 320 aa  279  4e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.574229 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1535  selenide, water dikinase  46.13 
 
 		 328 aa  278  8e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000657698  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1241  selenide, water dikinase  49.65 
 
 		 309 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0884  selenide, water dikinase  45.15 
 
 		 344 aa  273  3e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000463593 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0830  selenophosphate synthase  43.56 
 
 		 325 aa  269  5e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0811  selenide, water dikinase  45.43 
 
 		 344 aa  267  2e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2542  selenophosphate synthase  44.9 
 
 		 315 aa  267  2e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000270867  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11290  selenium donor protein  48.95 
 
 		 321 aa  267  2e-70  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.327064 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0844  selenide, water dikinase  43.98 
 
 		 358 aa  266  2.9999999999999995e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000873496  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2907  selenophosphate synthase  43.86 
 
 		 343 aa  266  4e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.547007  normal  0.430139 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1228  selenide, water dikinase  44.95 
 
 		 327 aa  263  2e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2053  selenide, water dikinase  42.22 
 
 		 343 aa  261  1e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0822  selenide, water dikinase  43.21 
 
 		 326 aa  261  2e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.771892  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1116  selenophosphate synthase  45.37 
 
 		 323 aa  258  9e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.418125  normal  0.456278 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1684  selenide, water dikinase  47.57 
 
 		 351 aa  258  1e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.815145 
 
 
-
 
NC_002950  PG1753  selenide, water dikinase  42.51 
 
 		 348 aa  257  2e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1736  selenide, water dikinase  44.31 
 
 		 351 aa  257  2e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.298189  normal  0.96466 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0450  selenide, water dikinase  44.84 
 
 		 354 aa  256  3e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2761  selenide, water dikinase  41.44 
 
 		 346 aa  256  3e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.124113  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3526  selenide, water dikinase  43.56 
 
 		 343 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3460  selenide, water dikinase  42.77 
 
 		 343 aa  252  5.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3445  selenide, water dikinase  41.16 
 
 		 351 aa  252  8.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1677  selenide, water dikinase  42.39 
 
 		 340 aa  251  1e-65  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.309519  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3509  selenide, water dikinase  41.46 
 
 		 355 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.502042  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3427  selenide, water dikinase  43 
 
 		 316 aa  247  3e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1987  selenide, water dikinase  47.92 
 
 		 319 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1496  selenide, water dikinase  43.55 
 
 		 308 aa  242  7.999999999999999e-63  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.258981  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0607  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  43.58 
 
 		 345 aa  241  1e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25360  selenium donor protein  42.32 
 
 		 314 aa  241  1e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.592311 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3849  selenide, water dikinase  43.27 
 
 		 317 aa  240  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2036  selenide, water dikinase  42.43 
 
 		 318 aa  238  1e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0154042  hitchhiker  0.000215589 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1925  selenophosphate synthase  43.63 
 
 		 349 aa  238  1e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3363  selenophosphate synthase  42.86 
 
 		 314 aa  237  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2198  selenophosphate synthetase  42.77 
 
 		 389 aa  236  4e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1505  selenophosphate synthetase  43.09 
 
 		 360 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.252621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2860  selenide, water dikinase  40.66 
 
 		 350 aa  233  5e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3367  selenophosphate synthetase  40.48 
 
 		 357 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0287  selenophosphate synthetase  40.18 
 
 		 357 aa  231  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0107  selenide, water dikinase  41.43 
 
 		 350 aa  231  2e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.317143 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16910  selenophosphate synthase  38.66 
 
 		 333 aa  231  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.254595  normal  0.381057 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0175  selenophosphate synthetase  40.68 
 
 		 352 aa  230  2e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0170  selenophosphate synthetase  40.68 
 
 		 352 aa  231  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0263017 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2243  selenophosphate synthetase  41.16 
 
 		 346 aa  230  3e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.466152  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2746  selenide, water dikinase  44.24 
 
 		 321 aa  230  3e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201658  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0176  selenophosphate synthetase  40.37 
 
 		 352 aa  230  3e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.984786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0689  selenide, water dikinase  40.37 
 
 		 328 aa  229  4e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00779233  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0196  selenophosphate synthetase  41.45 
 
 		 352 aa  229  5e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6563  selenophosphate synthetase  40.94 
 
 		 358 aa  229  7e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207959  hitchhiker  0.00495665 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4708  selenophosphate synthetase  41.64 
 
 		 357 aa  229  7e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.262495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4912  selenophosphate synthetase  41.01 
 
 		 354 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.462232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3008  selenophosphate synthetase  41.01 
 
 		 357 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5358  selenophosphate synthetase  41.01 
 
 		 357 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5238  selenophosphate synthetase  41.64 
 
 		 354 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4182  selenophosphate synthetase  40.87 
 
 		 352 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0955566  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4341  selenophosphate synthetase  37.61 
 
 		 346 aa  227  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00762353  hitchhiker  0.000113499 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3481  selenide, water dikinase  43.95 
 
 		 671 aa  228  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.409241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0177  selenophosphate synthetase  41.18 
 
 		 352 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.248798 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0228  selenophosphate synthetase  38.21 
 
 		 347 aa  227  2e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0643475  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4080  selenophosphate synthetase  41.18 
 
 		 352 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0362  selenide, water dikinase (possible start at 335663)  44.08 
 
 		 320 aa  228  2e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0173  selenophosphate synthetase  41.18 
 
 		 352 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1061  selenophosphate synthase  45.59 
 
 		 291 aa  226  3e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.309297  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2723  selenophosphate synthetase  40.74 
 
 		 347 aa  226  4e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.280916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3330  selenide, water dikinase  42.55 
 
 		 348 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.456858 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1345  selenide, water dikinase  40.12 
 
 		 354 aa  226  6e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0606  selenide, water dikinase  38.95 
 
 		 353 aa  224  2e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4627  selenophosphate synthetase  40.53 
 
 		 353 aa  224  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173949  normal  0.0779363 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0135  selenophosphate synthetase  38.76 
 
 		 347 aa  224  2e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.397327 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3267  selenide, water dikinase  40.62 
 
 		 359 aa  223  3e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2116  selenophosphate synthetase  41.16 
 
 		 389 aa  223  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113835  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1754  selenophosphate synthetase  41.32 
 
 		 357 aa  223  4.9999999999999996e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207511  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5690  selenide, water dikinase  37.76 
 
 		 343 aa  222  8e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2135  selenophosphate synthetase  40.89 
 
 		 356 aa  222  8e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1473  selenophosphate synthetase  40.89 
 
 		 354 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0190  selenophosphate synthetase  40.73 
 
 		 352 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0742475 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3479  selenophosphate synthase  40.38 
 
 		 356 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.160372  normal  0.547237 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2802  selenide, water dikinase  40.38 
 
 		 356 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.543452  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0819  selenophosphate synthetase  40.89 
 
 		 354 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.765639  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0503  selenophosphate synthetase  40.58 
 
 		 356 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1832  selenophosphate synthetase  40.97 
 
 		 421 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0405  selenophosphate synthetase  40.58 
 
 		 385 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4713  selenophosphate synthetase  39.12 
 
 		 351 aa  219  7e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.31309  normal  0.849821 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2089  selenophosphate synthetase  39.05 
 
 		 348 aa  218  7.999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330943  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3543  selenophosphate synthetase  42.28 
 
 		 352 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1980  selenophosphate synthetase  39.05 
 
 		 348 aa  218  7.999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196401  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3860  selenophosphate synthase  39.62 
 
 		 357 aa  218  8.999999999999998e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>