241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0869 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0869  degV family protein  100 
 
 
287 aa  594  1e-169  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3343  degV family protein  54.67 
 
 
289 aa  329  3e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000215363  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0030  degV family protein  43.6 
 
 
291 aa  262  4.999999999999999e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1556  degV family protein  44.86 
 
 
292 aa  256  2e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0165981 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10840  degV family protein  45.55 
 
 
291 aa  251  1e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00470044  unclonable  0.00000000186001 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0030  degV family protein  43.6 
 
 
291 aa  248  1e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0716  degV family protein  45.32 
 
 
287 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1542  degV family protein  42.45 
 
 
287 aa  218  7e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3275  degV family protein  39.72 
 
 
292 aa  216  2.9999999999999998e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000632597  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1951  degV family protein  39.43 
 
 
286 aa  206  4e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33596  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1558  DegV family protein  38.78 
 
 
295 aa  204  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06330  degV family protein  36.52 
 
 
293 aa  203  2e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.139961 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2258  degV family protein  38.41 
 
 
293 aa  203  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0884307  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2359  degV family protein  39.29 
 
 
286 aa  202  5e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823292  normal  0.669443 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2677  degV family protein  38.71 
 
 
286 aa  199  6e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000367338  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2876  degV family protein  37.99 
 
 
286 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000561682 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2679  degV family protein  37.99 
 
 
286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.776437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2629  DegV family protein  37.99 
 
 
286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2872  degV family protein  37.99 
 
 
286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.428011  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2918  degV family protein  38.35 
 
 
286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2886  degV family protein  37.99 
 
 
286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2906  degV family protein  37.99 
 
 
286 aa  195  6e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00204393  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2602  DegV family protein  38.35 
 
 
286 aa  194  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00489344  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0606  DegV family protein  38.44 
 
 
295 aa  192  5e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1061  degV family protein  38.23 
 
 
294 aa  192  7e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0946944  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0124  hypothetical protein  37.02 
 
 
286 aa  182  6e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1743  degV family protein  33.21 
 
 
281 aa  177  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0123277 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0211  DegV family protein  35.79 
 
 
286 aa  175  7e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.187112  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2064  hypothetical protein  34.97 
 
 
289 aa  172  3.9999999999999995e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0791292  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2746  degV family protein  34.64 
 
 
281 aa  168  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000295116  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1740  degV family protein  34.75 
 
 
280 aa  166  4e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04370  degV family protein  33.09 
 
 
285 aa  166  4e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14080  degV family protein  33.45 
 
 
290 aa  160  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464693  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1121  degV family protein  33.68 
 
 
294 aa  158  1e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2132  degV family protein  32.37 
 
 
280 aa  153  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1056  degV family protein  31.74 
 
 
297 aa  152  8.999999999999999e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.162419  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  31.9 
 
 
279 aa  151  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1901  hypothetical protein  35 
 
 
281 aa  150  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16140  hypothetical protein  32.51 
 
 
308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000224707 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09150  hypothetical protein  31.34 
 
 
309 aa  147  3e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000277277  normal  0.476622 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1150  degV family protein  33.92 
 
 
309 aa  145  5e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.444716  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09160  degV family protein  35.31 
 
 
311 aa  146  5e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.356982  normal  0.378413 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  29.86 
 
 
282 aa  144  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17990  degV family protein  33.1 
 
 
285 aa  137  3.0000000000000003e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.980655  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0982  degV family protein  33.68 
 
 
342 aa  134  9.999999999999999e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1648  degV family protein  29.47 
 
 
280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000062676  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10110  degV family protein  30.07 
 
 
299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000366641  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3096  degV family protein  29.12 
 
 
287 aa  132  5e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  1.30761e-16 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1310  degV family protein  28.57 
 
 
292 aa  132  6.999999999999999e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0851  degV family protein  28.17 
 
 
303 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.427219  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2031  DegV family protein  28.77 
 
 
280 aa  130  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2029  DegV family protein  28.77 
 
 
280 aa  130  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367646  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2357  degV family protein  28.77 
 
 
287 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2272  degV family protein  28.77 
 
 
287 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27553e-41 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2276  degV family protein  28.77 
 
 
280 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000585321  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2228  degV family protein  28.77 
 
 
280 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000426041  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14660  degV family protein  30.63 
 
 
282 aa  129  8.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000206082  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2091  degV family protein  28.92 
 
 
282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0091257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2246  degV family protein  28.92 
 
 
282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152108  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0915  degV family protein  30.22 
 
 
285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0196903  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0363  degV family protein  31.82 
 
 
277 aa  127  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3733  degV family protein  32.62 
 
 
280 aa  126  5e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3042  degV family protein  31.8 
 
 
281 aa  126  5e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00021741  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1265  degV family protein  28.62 
 
 
281 aa  125  8.000000000000001e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2385  degV family protein  31.05 
 
 
285 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000544389  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3239  degV family protein  31.45 
 
 
281 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1107  degV family protein  30.99 
 
 
282 aa  124  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3318  degV family protein  32.87 
 
 
282 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1050  hypothetical protein  27.96 
 
 
283 aa  123  3e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4990  degV family protein  32.49 
 
 
280 aa  122  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1032  degV family protein  28.87 
 
 
284 aa  122  6e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.185654  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0785  degV family protein  27.6 
 
 
283 aa  122  6e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1076  degV family protein  29.29 
 
 
280 aa  122  7e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313955  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5642  degV family protein  32.13 
 
 
280 aa  122  8e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00000000000040368 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1587  degV family protein  28.17 
 
 
280 aa  122  8e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000247514  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5316  degV family protein  32.13 
 
 
280 aa  122  8e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0416  DegV family protein  31.11 
 
 
288 aa  122  9.999999999999999e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2070  degV family protein  28.42 
 
 
280 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00374337  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1048  DegV  29.29 
 
 
280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.925497  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1001  DegV family protein  29.33 
 
 
282 aa  120  3e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.794121  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4890  degV family protein  32.13 
 
 
280 aa  120  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1226  degV family protein  27.82 
 
 
637 aa  120  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185593  normal  0.745824 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5045  degV family protein  32.13 
 
 
280 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4875  degV family protein  32.13 
 
 
280 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5430  degV family protein  32.13 
 
 
280 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5304  degV family protein  32.13 
 
 
280 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_903  DegV  30.47 
 
 
285 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00149031  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5362  degV family protein  32.13 
 
 
280 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2314  degV family protein  28.62 
 
 
312 aa  119  6e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00036475  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5286  degV family protein  32.13 
 
 
280 aa  119  7e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358242 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3344  DegV family protein  31.33 
 
 
277 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000036416  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0442  DegV family protein  30.71 
 
 
291 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.416835  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1201  degV family protein  31.23 
 
 
280 aa  118  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1698  degV family protein  32.24 
 
 
287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1514  hypothetical protein  28.47 
 
 
279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1485  hypothetical protein  28.47 
 
 
279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.417725  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2832  degV family protein  29.54 
 
 
281 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1047  DegV  29.6 
 
 
279 aa  116  3e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3519  degV family protein  29.29 
 
 
281 aa  117  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.945793  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2518  degV family protein  29.58 
 
 
281 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>