More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0238 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0238  elongation factor Tu  100 
 
 		 397 aa  818    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000602877  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  76.75 
 
 		 400 aa  630  1e-179  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  75.06 
 
 		 396 aa  624  1e-178  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  76.57 
 
 		 395 aa  625  1e-178  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  75.63 
 
 		 397 aa  621  1e-177  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  75.63 
 
 		 397 aa  621  1e-177  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  74.31 
 
 		 396 aa  619  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20900  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  72.54 
 
 		 397 aa  618  1e-176  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.191388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0865  elongation factor Tu  74.5 
 
 		 400 aa  614  1e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000288327  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3669  elongation factor Tu  73.8 
 
 		 396 aa  614  1e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0318  elongation factor Tu  75.5 
 
 		 400 aa  617  1e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000823048  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3703  elongation factor Tu  73.8 
 
 		 396 aa  614  1e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  74.06 
 
 		 396 aa  616  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  74.06 
 
 		 396 aa  617  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1543  elongation factor Tu  74.31 
 
 		 396 aa  617  1e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0851  elongation factor Tu  74.5 
 
 		 400 aa  615  1e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000784672  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0420  elongation factor Tu  75.25 
 
 		 400 aa  614  1e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  73.8 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08650  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  74.31 
 
 		 400 aa  612  9.999999999999999e-175  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000915749  hitchhiker  0.000000299529 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  73.8 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  73.8 
 
 		 396 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  73.8 
 
 		 396 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  73.8 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  73.8 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2335  elongation factor Tu  74.19 
 
 		 400 aa  611  9.999999999999999e-175  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00040826  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2350  elongation factor Tu  74.19 
 
 		 400 aa  611  9.999999999999999e-175  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00292725  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1048  elongation factor Tu  73.23 
 
 		 394 aa  613  9.999999999999999e-175  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000767064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  74.31 
 
 		 396 aa  610  1e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2462  elongation factor Tu  74.25 
 
 		 400 aa  608  1e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0594726 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  74.31 
 
 		 396 aa  610  1e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0309  translation elongation factor Tu  73.3 
 
 		 396 aa  605  9.999999999999999e-173  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000161177  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2648  elongation factor Tu  73.12 
 
 		 397 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.428976  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4509  translation elongation factor Tu  73.8 
 
 		 397 aa  607  9.999999999999999e-173  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.936276  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5122  translation elongation factor Tu  72.04 
 
 		 397 aa  605  9.999999999999999e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.821409 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0199  elongation factor Tu  74.19 
 
 		 400 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000189275  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2788  translation elongation factor Tu  73.12 
 
 		 397 aa  601  1.0000000000000001e-171  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2722  elongation factor Tu  72.8 
 
 		 396 aa  603  1.0000000000000001e-171  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0752612  normal  0.841998 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2964  elongation factor Tu  73.23 
 
 		 396 aa  603  1.0000000000000001e-171  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.155343  normal  0.97702 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2326  elongation factor Tu  71.79 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000632593  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2338  elongation factor Tu  71.79 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000797106  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0105  elongation factor Tu  76.32 
 
 		 395 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2734  elongation factor Tu  72.8 
 
 		 396 aa  603  1.0000000000000001e-171  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102462 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0321  translation elongation factor Tu  73.05 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000705932  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0284  elongation factor Tu  73.68 
 
 		 400 aa  601  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00091062  hitchhiker  0.00368673 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0213  elongation factor Tu  74.19 
 
 		 400 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00624803  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3922  elongation factor Tu  70.96 
 
 		 397 aa  602  1.0000000000000001e-171  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2326  elongation factor Tu  72.54 
 
 		 396 aa  600  1e-170  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000151481  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0754  elongation factor Tu  72.29 
 
 		 396 aa  598  1e-170  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150197  normal  0.0210812 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2171  translation elongation factor Tu  71.79 
 
 		 396 aa  599  1e-170  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  0.373473 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2338  elongation factor Tu  72.54 
 
 		 396 aa  600  1e-170  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0567224  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1355  elongation factor Tu  72.47 
 
 		 396 aa  600  1e-170  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358693  normal  0.0503589 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0109  elongation factor Tu  76.07 
 
 		 395 aa  598  1e-170  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000245051  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0270  elongation factor Tu  73.68 
 
 		 400 aa  600  1e-170  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000107043  normal  0.0107333 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0495  elongation factor Tu  73.23 
 
 		 394 aa  599  1e-170  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03960  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  71.28 
 
 		 397 aa  598  1e-170  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0742  elongation factor Tu  72.29 
 
 		 396 aa  598  1e-170  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2183  translation elongation factor Tu  71.79 
 
 		 396 aa  599  1e-170  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.557033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  73.05 
 
 		 394 aa  599  1e-170  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  73.05 
 
 		 394 aa  599  1e-170  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  73.05 
 
 		 394 aa  598  1e-170  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  73.05 
 
 		 394 aa  598  1e-170  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0304  elongation factor Tu  72.11 
 
 		 397 aa  599  1e-170  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273769 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0102  elongation factor Tu  74.75 
 
 		 395 aa  595  1e-169  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000129876  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2776  translation elongation factor Tu  72.8 
 
 		 397 aa  595  1e-169  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105082  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2536  elongation factor Tu  72.8 
 
 		 391 aa  595  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148431  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  72.04 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  72.04 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3321  elongation factor Tu  72.29 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2855  elongation factor Tu  72.54 
 
 		 396 aa  594  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.29734 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3646  elongation factor Tu  72.29 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000015318  hitchhiker  0.0000000000310582 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2549  elongation factor Tu  72.8 
 
 		 391 aa  595  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.812394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3659  elongation factor Tu  72.29 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000150336  hitchhiker  0.00000130036 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1892  elongation factor Tu  72.47 
 
 		 396 aa  597  1e-169  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1906  elongation factor Tu  72.47 
 
 		 396 aa  597  1e-169  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00245882  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2842  elongation factor Tu  72.54 
 
 		 396 aa  594  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0284377  normal  0.173199 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2974  elongation factor Tu  72.04 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.741149 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3824  elongation factor Tu  71.79 
 
 		 396 aa  591  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3171  elongation factor Tu  71.79 
 
 		 396 aa  591  1e-168  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000406645  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3647  elongation factor Tu  71.03 
 
 		 396 aa  593  1e-168  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0229  elongation factor Tu  73.3 
 
 		 394 aa  592  1e-168  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3186  elongation factor Tu  71.79 
 
 		 396 aa  591  1e-168  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000468547  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0201  elongation factor Tu  71.03 
 
 		 396 aa  593  1e-168  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.590081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3070  elongation factor Tu  71.79 
 
 		 396 aa  591  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000360276  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3084  elongation factor Tu  71.79 
 
 		 396 aa  591  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000577807  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1584  elongation factor Tu  73.8 
 
 		 396 aa  593  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1947  elongation factor Tu  73.8 
 
 		 396 aa  593  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3476  elongation factor Tu  71.79 
 
 		 396 aa  591  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000712008  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3599  elongation factor Tu  71.28 
 
 		 396 aa  593  1e-168  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0100711  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3797  elongation factor Tu  71.03 
 
 		 396 aa  592  1e-168  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000312567  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1922  elongation factor Tu  71.79 
 
 		 396 aa  591  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000951262  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0254  elongation factor Tu  71.28 
 
 		 396 aa  593  1e-168  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.0000000130058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4449  elongation factor Tu  71.28 
 
 		 396 aa  593  1e-168  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000257017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0299  elongation factor Tu  72.04 
 
 		 396 aa  593  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000130927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0312  elongation factor Tu  72.04 
 
 		 396 aa  593  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000663244  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1906  elongation factor Tu  71.79 
 
 		 396 aa  591  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000303162  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0265  elongation factor Tu  72.04 
 
 		 396 aa  593  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0194583  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08830  elongation factor Tu  73.37 
 
 		 397 aa  591  1e-168  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0517061  normal  0.0282238 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0333  elongation factor Tu  72.04 
 
 		 396 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000426715  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0346  elongation factor Tu  72.04 
 
 		 396 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0260269  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1325  elongation factor Tu  70.32 
 
 		 399 aa  592  1e-168  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000100394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>