More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1045 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1045  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 		 469 aa  936    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1439  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.74 
 
 		 469 aa  572  1.0000000000000001e-162  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1797  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.93 
 
 		 474 aa  533  1e-150  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1494  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.15 
 
 		 473 aa  492  9.999999999999999e-139  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0784  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.48 
 
 		 472 aa  488  1e-136  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1632  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.25 
 
 		 483 aa  487  1e-136  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.872525  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2155  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.71 
 
 		 465 aa  409  1e-113  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1972  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.92 
 
 		 474 aa  395  1e-109  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5752  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.58 
 
 		 466 aa  394  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3001  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.42 
 
 		 462 aa  389  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0472874  normal  0.642083 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12463  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.09 
 
 		 462 aa  388  1e-106  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.931129  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3995  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.32 
 
 		 465 aa  388  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0162306  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6263  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.52 
 
 		 468 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4676  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.23 
 
 		 462 aa  377  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1086  dihydrolipoyl dehydrogenase (dihydrolipoamide dehydrogenase)  43.27 
 
 		 464 aa  375  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.912162  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1614  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.83 
 
 		 464 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0956162 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2968  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.66 
 
 		 468 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462781  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5151  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.68 
 
 		 465 aa  375  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0369329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.71 
 
 		 464 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0478321  normal  0.511647 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.64 
 
 		 468 aa  370  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1096  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.86 
 
 		 464 aa  370  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1126  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.44 
 
 		 487 aa  365  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2063  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.65 
 
 		 487 aa  368  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1720  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.64 
 
 		 465 aa  367  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.160596  normal  0.364813 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0611  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.17 
 
 		 463 aa  366  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512717  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1878  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.2 
 
 		 466 aa  365  1e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.932595  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2913  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.8 
 
 		 479 aa  364  2e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00695223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1237  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.44 
 
 		 465 aa  364  2e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1084  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.23 
 
 		 539 aa  363  3e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1626  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.07 
 
 		 487 aa  363  3e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.139185  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0994  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.88 
 
 		 479 aa  363  4e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0279881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1508  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.58 
 
 		 480 aa  362  7.0000000000000005e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270354  normal  0.468663 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2790  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.46 
 
 		 479 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1608  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.47 
 
 		 481 aa  362  9e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.392675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6519  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.83 
 
 		 478 aa  361  1e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1365  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.91 
 
 		 465 aa  362  1e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0890108  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1811  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.74 
 
 		 465 aa  360  3e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.352769 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0537  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.02 
 
 		 486 aa  359  4e-98  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.206341  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3018  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.25 
 
 		 479 aa  360  4e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.340958 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.2 
 
 		 465 aa  358  1.9999999999999998e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1801  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.74 
 
 		 482 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.656654  decreased coverage  0.000698264 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3205  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.21 
 
 		 473 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169727  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.23 
 
 		 470 aa  356  3.9999999999999996e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.605056  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1813  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.99 
 
 		 477 aa  354  2e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0853723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2766  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.43 
 
 		 473 aa  354  2e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2493  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.64 
 
 		 472 aa  354  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1081  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.04 
 
 		 481 aa  353  4e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5901  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.68 
 
 		 478 aa  353  4e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2807  dihydrolipoamide dehydrogenase  41 
 
 		 473 aa  352  7e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.44 
 
 		 481 aa  352  1e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203101  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0435  hypothetical protein  43.08 
 
 		 478 aa  352  1e-95  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0273668 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5367  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.75 
 
 		 467 aa  348  1e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3815  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.14 
 
 		 468 aa  348  1e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.585527  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1689  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.89 
 
 		 462 aa  345  1e-93  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.08159 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0522  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.3 
 
 		 480 aa  345  1e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4459  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.56 
 
 		 473 aa  343  4e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.250901 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2479  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.04 
 
 		 467 aa  336  5e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0992  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.34 
 
 		 468 aa  335  9e-91  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.96 
 
 		 477 aa  335  9e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.92 
 
 		 467 aa  335  9e-91  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123763  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0325  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  39.74 
 
 		 457 aa  334  2e-90  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3594  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.11 
 
 		 492 aa  333  3e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0616  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.47 
 
 		 466 aa  333  5e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6148  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.69 
 
 		 461 aa  333  6e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0268459  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.48 
 
 		 465 aa  332  1e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.52 
 
 		 469 aa  331  1e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.850345  decreased coverage  0.00227015 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3894  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.09 
 
 		 471 aa  330  4e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.287099 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.83 
 
 		 470 aa  329  5.0000000000000004e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0631  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.13 
 
 		 466 aa  328  9e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0991753  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0644  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.13 
 
 		 466 aa  328  9e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.963668 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.35 
 
 		 473 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0624  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.91 
 
 		 466 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal  0.337004 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.08 
 
 		 463 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.96 
 
 		 470 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2832  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.8 
 
 		 463 aa  326  7e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11020  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.69 
 
 		 465 aa  326  7e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.874516 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0138  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.3 
 
 		 491 aa  325  1e-87  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2755  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.04 
 
 		 466 aa  325  1e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0982206  hitchhiker  0.000532855 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2779  dihydrolipoamide dehydrogenase E3 component of 3 enzyme complexes  38.6 
 
 		 463 aa  325  1e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.285583  normal  0.562583 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1178  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.27 
 
 		 468 aa  324  2e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000305556  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.27 
 
 		 468 aa  324  2e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00928669  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0683  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.27 
 
 		 468 aa  323  3e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2352  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.61 
 
 		 467 aa  323  3e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.357235  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.39 
 
 		 470 aa  322  7e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.39 
 
 		 470 aa  322  7e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.39 
 
 		 470 aa  322  7e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.39 
 
 		 470 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.39 
 
 		 470 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.39 
 
 		 470 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.39 
 
 		 470 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.39 
 
 		 470 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1665  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.11 
 
 		 491 aa  321  9.999999999999999e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.771016  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.39 
 
 		 470 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.96 
 
 		 470 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06120  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.56 
 
 		 464 aa  321  1.9999999999999998e-86  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.140424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.52 
 
 		 470 aa  318  1e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3003  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.16 
 
 		 471 aa  318  1e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3796  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.74 
 
 		 470 aa  317  3e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00896053  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2823  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.64 
 
 		 465 aa  316  6e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0853  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.27 
 
 		 465 aa  315  9e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50611  normal  0.0780472 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>