254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1149 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1149  Ribosomal protein L25/L23  100 
 
 		 95 aa  192  1e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000523481  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05725  50S ribosomal protein L23  64.58 
 
 		 96 aa  118  3e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.261745  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0395  50S ribosomal protein L23  58.33 
 
 		 96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1936  50S ribosomal protein L23  47.42 
 
 		 97 aa  82.4  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3160  50S ribosomal protein L23  47.92 
 
 		 95 aa  82  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0195  50S ribosomal protein L23  43.75 
 
 		 95 aa  76.3  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.323191 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1617  Ribosomal protein L25/L23  45.74 
 
 		 99 aa  71.6  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0844  Ribosomal protein L25/L23  39.18 
 
 		 100 aa  72  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0182  50S ribosomal protein L23  43.48 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000184382  normal  0.668364 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0604  Ribosomal protein L25/L23  43.75 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2227  50S ribosomal protein L23  43.48 
 
 		 103 aa  70.5  0.000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000627291  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0291  50S ribosomal protein L23  42.39 
 
 		 103 aa  69.3  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0196  LSU ribosomal protein L23P  44.21 
 
 		 93 aa  67  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00208833  normal  0.0650448 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0267  50S ribosomal protein L23  41.94 
 
 		 99 aa  65.5  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000129072  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1709  50S ribosomal protein L23  44.09 
 
 		 98 aa  64.7  0.0000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.182173  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1849  50S ribosomal protein L23  39.13 
 
 		 103 aa  64.7  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.310449  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0964  Ribosomal protein L25/L23  41.49 
 
 		 93 aa  63.2  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000679303  hitchhiker  0.000000000153425 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2062  50S ribosomal protein L23  40.22 
 
 		 109 aa  63.5  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000372125  normal  0.225776 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2421  50S ribosomal protein L23  39.13 
 
 		 103 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00215934  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2294  50S ribosomal protein L23  39.13 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0336822  normal  0.0105282 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl125  50S ribosomal protein L23  41.49 
 
 		 94 aa  61.6  0.000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000058644  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0869  50S ribosomal protein L23  42.42 
 
 		 97 aa  61.6  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000185087  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0257  ribosomal protein L23  43.01 
 
 		 98 aa  61.6  0.000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10000  LSU ribosomal protein L23P  41.94 
 
 		 95 aa  62  0.000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00605072  hitchhiker  0.00000000356611 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0682  50S ribosomal protein L23  42.39 
 
 		 94 aa  60.5  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.633867  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1829  50S ribosomal protein L23  39.13 
 
 		 91 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.132177  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0694  50S ribosomal protein L23  40.43 
 
 		 94 aa  58.9  0.00000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4345  Ribosomal protein L25/L23  36.84 
 
 		 95 aa  57.4  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000178584  normal  0.183841 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1069  50S ribosomal protein L23  38.04 
 
 		 94 aa  57  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000947106  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1187  Ribosomal protein L25/L23  49.4 
 
 		 104 aa  57  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.102596 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2316  50S ribosomal protein L23  36.96 
 
 		 91 aa  57  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000264247  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2275  50S ribosomal protein L23  36.96 
 
 		 91 aa  57  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000227953  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0589  Ribosomal protein L25/L23  41.3 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.185358  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0629  Ribosomal protein L25/L23  40.86 
 
 		 100 aa  56.6  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1743  50S ribosomal protein L23  36.46 
 
 		 96 aa  57  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745247  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1342  Ribosomal protein L25/L23  38.3 
 
 		 98 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16220  LSU ribosomal protein L23P  39.78 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.491689  decreased coverage  0.0000000109599 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  40.23 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4274  50S ribosomal protein L23  44.44 
 
 		 98 aa  55.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000576147  unclonable  0.00000000000382148 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0061  50S ribosomal protein L23  40.22 
 
 		 101 aa  55.5  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000105028  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1088  50S ribosomal protein L23  37.23 
 
 		 100 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0289  50S ribosomal protein L23  42.7 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0312226  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1182  Ribosomal protein L25/L23  39.78 
 
 		 98 aa  55.1  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000210962  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0564  Ribosomal protein L25/L23  34.41 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1348  50S ribosomal protein L23  38.04 
 
 		 94 aa  54.7  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4313  ribosomal protein L25/L23  43.02 
 
 		 100 aa  53.9  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689927  hitchhiker  0.00977905 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0690  Ribosomal protein L25/L23  38.71 
 
 		 103 aa  54.3  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.417493 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2712  50S ribosomal protein L23  35.11 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2397  50S ribosomal protein L23  35.11 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00942315  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3921  ribosomal protein L25/L23  43.02 
 
 		 100 aa  53.5  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17631  50S ribosomal protein L23  45.88 
 
 		 100 aa  53.5  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2370  ribosomal protein L23  40.23 
 
 		 97 aa  53.5  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.408487  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23790  LSU ribosomal protein L23P  37.63 
 
 		 100 aa  52.8  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1648  50S ribosomal protein L23  44.71 
 
 		 100 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4319  Ribosomal protein L25/L23  37.63 
 
 		 99 aa  53.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2772  50S ribosomal protein L23  34.04 
 
 		 96 aa  52.8  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0118683  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0983  Ribosomal protein L25/L23  36.84 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.285455  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17381  50S ribosomal protein L23  44.71 
 
 		 100 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0456  50S ribosomal protein L23  39.78 
 
 		 99 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0420406  unclonable  0.000000164588 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0628  ribosomal protein L23  38.71 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000267442  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0486  50S ribosomal protein L23  39.78 
 
 		 99 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00438289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4546  50S ribosomal protein L23  38.71 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.215144  normal  0.061023 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2644  50S ribosomal protein L23  38.71 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.302905  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4917  50S ribosomal protein L23  36.46 
 
 		 98 aa  52  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0776922  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0489  50S ribosomal protein L23  39.78 
 
 		 99 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000000019112  normal  0.107844 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5077  50S ribosomal protein L23  38.71 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000053863  normal  0.27163 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1572  Ribosomal protein L25/L23  42.27 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000483803  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3022  50S ribosomal protein L23  39.53 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395888  hitchhiker  0.00706162 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06270  50S ribosomal protein L23  41.94 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219554  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3141  Ribosomal protein L25/L23  38.71 
 
 		 103 aa  52.8  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.457141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4747  50S ribosomal protein L23  39.78 
 
 		 99 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000334762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1307  50S ribosomal protein L23  39.78 
 
 		 100 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.433832  normal  0.153426 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0933  Ribosomal protein L25/L23  38.55 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17140  50S ribosomal protein L23  35.87 
 
 		 101 aa  52  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.538328  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0955  ribosomal protein L25/L23  39.77 
 
 		 101 aa  52  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000594054  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2331  50S ribosomal protein L23  40.91 
 
 		 95 aa  51.6  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000250147  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17471  50S ribosomal protein L23  43.53 
 
 		 100 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.576191  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0839  50S ribosomal protein L23  37.63 
 
 		 99 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225205  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0248  50S ribosomal protein L23  42.11 
 
 		 98 aa  51.2  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.529844  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2709  Ribosomal protein L25/L23  34.44 
 
 		 95 aa  51.2  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000605336  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  37.11 
 
 		 95 aa  51.2  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08870  50S ribosomal protein L23  37.63 
 
 		 99 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.679116  hitchhiker  0.00894178 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2657  Ribosomal protein L25/L23  36.56 
 
 		 100 aa  51.2  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3177  50S ribosomal protein L23  38.04 
 
 		 104 aa  50.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000279852  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29720  LSU ribosomal protein L23P  36.96 
 
 		 101 aa  50.8  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3315  50S ribosomal protein L23  38.04 
 
 		 104 aa  50.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0435  50S ribosomal protein L23  35.42 
 
 		 100 aa  50.8  0.000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00486251  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0278  50S ribosomal protein L23  43.16 
 
 		 98 aa  50.8  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0499  50S ribosomal protein L23  34.44 
 
 		 97 aa  50.8  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.173851  hitchhiker  0.00000000336824 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20850  LSU ribosomal protein L23P  35.87 
 
 		 107 aa  50.4  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3903  50S ribosomal protein L23  40.22 
 
 		 101 aa  50.4  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3433  Ribosomal protein L25/L23  40.43 
 
 		 103 aa  50.8  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0329  50S ribosomal protein L23  34.44 
 
 		 97 aa  50.8  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3295  50S ribosomal protein L23  38.04 
 
 		 104 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.00000000040814  hitchhiker  0.0000223362 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16761  50S ribosomal protein L23  38.71 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0871  50S ribosomal protein L23  38.04 
 
 		 100 aa  50.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0351  50S ribosomal protein L23  43.16 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1957  50S ribosomal protein L23  42.35 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3993  Ribosomal protein L25/L23  39.08 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2948  50S ribosomal protein L23  38.04 
 
 		 104 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000296107  hitchhiker  0.000000753496 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>