More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0770 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0770  Thioredoxin domain protein  100 
 
 		 103 aa  213  9.999999999999999e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06230  thioredoxin  61.17 
 
 		 104 aa  142  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4265  Thioredoxin domain protein  64.29 
 
 		 103 aa  134  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2116  thioredoxin domain-containing protein  56 
 
 		 102 aa  118  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0609  thioredoxin  35 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5689  thioredoxin  32.91 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1331  thioredoxin  34.57 
 
 		 122 aa  63.5  0.0000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545136  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04200  thioredoxin (allergen cop c 2), putative  28.57 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.867459  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5310  thioredoxin  32.91 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5399  thioredoxin  32.91 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.35358 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2496  thioredoxin  35.8 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.525579  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1832  thioredoxin  32.1 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4021  thioredoxin  30.86 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0834665  normal  0.313604 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  33.33 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2576  thioredoxin  33.33 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00003573  decreased coverage  0.0000301117 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0358  thioredoxin  29.41 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0207  thioredoxin  33.75 
 
 		 120 aa  60.8  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3837  thioredoxin  32.5 
 
 		 120 aa  60.8  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16950  thioredoxin  32.1 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.30623  normal  0.239589 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  32.53 
 
 		 124 aa  60.1  0.000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0125  thioredoxin  30.86 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.109226 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2647  thioredoxin  33 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.623834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37753  predicted protein  38.57 
 
 		 101 aa  58.9  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0200499  hitchhiker  0.00126408 
 
 
-
 
NC_002620  TC0826  thioredoxin  35.8 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000363889  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39568  thioredoxin  32.14 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.187057 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2481  thioredoxin  36.25 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.555436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11499  thioredoxin trxB1  37.5 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0242294  normal  0.175347 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24970  thioredoxin  36.59 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0891  thioredoxin  29.7 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_56521  predicted protein  29.36 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1065  thioredoxin  30.3 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2444  thioredoxin  36.25 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0730  thioredoxin  32.1 
 
 		 120 aa  58.2  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2489  thioredoxin  36.25 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0044  thioredoxin  32.94 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48539  thioredoxin h  29.27 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21270  thioredoxin  32.5 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.724232  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0143  thioredoxin  35.8 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0675  thioredoxin  33.33 
 
 		 120 aa  57  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.576431  normal  0.854298 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1297  thioredoxin  32.5 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0320053  normal  0.47539 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  32.5 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46280  thioredoxin f  37.33 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.767302  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2638  thioredoxin  31.65 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00698501  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_56471  thioredoxin h  36.76 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0987  thioredoxin  29.11 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0052  thioredoxin  33.73 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.263175  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1647  thioredoxin  29.49 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.00109876 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1214  thioredoxin  29.27 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0537365 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1789  thioredoxin  35.9 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1979  thioredoxin  29.49 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.379887  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14280  thioredoxin  38.16 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.978477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2770  thioredoxin  27.5 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0223  thioredoxin  28.16 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0640953 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2770  thioredoxin  29.29 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117115 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2236  thioredoxin  33.7 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.773662  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0172  thioredoxin  30 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7798  thioredoxin  29.07 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  35.16 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0698118 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3670  thioredoxin  33.75 
 
 		 120 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.603645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2740  thioredoxin  33.75 
 
 		 120 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.529199 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3068  thioredoxin  28.28 
 
 		 137 aa  53.5  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.357713  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  34.21 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26335  predicted protein  36.9 
 
 		 154 aa  53.5  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2204  thioredoxin  27.16 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.134551 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3640  thioredoxin  31.65 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2066  thioredoxin  33.33 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0918718  normal  0.219337 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1776  thioredoxin  28.75 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  35.85 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0435  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  27.78 
 
 		 105 aa  53.1  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1362  thioredoxin  32.18 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05698  thioredoxin 2  36.47 
 
 		 162 aa  52.4  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  33.33 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0335  thioredoxin  37.93 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0988  thioredoxin domain-containing protein  31.76 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  33.33 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6550  thioredoxin domain protein  30.95 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.19708  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  33.33 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26095  predicted protein  27.16 
 
 		 105 aa  51.6  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00850949 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_9576  predicted protein  30.11 
 
 		 100 aa  51.6  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0356  thioredoxin  30.77 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2401  thioredoxin  35 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.85345  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5392  thioredoxin  31.33 
 
 		 123 aa  51.6  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1679  thioredoxin  35.48 
 
 		 98 aa  51.2  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31831  Thioredoxin (Trx)  34.62 
 
 		 129 aa  51.6  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.986588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2099  thioredoxin  34.88 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2254  thioredoxin  26.25 
 
 		 132 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0831587  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2342  thioredoxin  26.25 
 
 		 132 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  31.18 
 
 		 116 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2026  thioredoxin  28.57 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.12861 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  30.95 
 
 		 109 aa  50.8  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10788  predicted protein  29.33 
 
 		 117 aa  50.8  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3437  thioredoxin  29.27 
 
 		 107 aa  50.8  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0420  thioredoxin  31.76 
 
 		 142 aa  50.4  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2231  thioredoxin  32.26 
 
 		 145 aa  50.4  0.000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0118387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3584  thioredoxin  31.52 
 
 		 109 aa  50.4  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00016677  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1343  thioredoxin  36.05 
 
 		 133 aa  50.4  0.000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.160568  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  28.3 
 
 		 406 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1608  thioredoxin  24.69 
 
 		 131 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00442059  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  31.03 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1561  thioredoxin  29.11 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>