200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0185 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0185  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
567 aa  1167    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.735964  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1728  Alpha/beta hydrolase fold  41.75 
 
 
578 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1290  hypothetical protein  39.48 
 
 
587 aa  442  1e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.620525  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3003  hypothetical protein  39.48 
 
 
587 aa  442  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.5786  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2780  hypothetical protein  40.14 
 
 
580 aa  439  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0442917  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3081  alpha/beta hydrolase fold  39.3 
 
 
587 aa  441  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0893  alpha/beta hydrolase fold  38.27 
 
 
589 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1253  alpha/beta hydrolase fold  38.98 
 
 
599 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1375  alpha/beta hydrolase fold  38.27 
 
 
589 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0199502  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1353  alpha/beta hydrolase fold  38.27 
 
 
589 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0830773  normal  0.156007 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1278  alpha/beta hydrolase fold  38.8 
 
 
599 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.256171 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4520  Alpha/beta hydrolase  37.35 
 
 
589 aa  410  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.233451  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3659  hypothetical protein  38.72 
 
 
583 aa  412  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.962134  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01365  predicted hydrolase  37.72 
 
 
585 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.693109  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2235  conserved hypothetical protein  37.72 
 
 
585 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01377  hypothetical protein  37.72 
 
 
585 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.748745  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1493  hypothetical protein  37.72 
 
 
585 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5537  hypothetical protein  38.21 
 
 
585 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2248  hypothetical protein  37.72 
 
 
585 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.555359  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2878  Methyltransferase type 12  37.52 
 
 
594 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.404864  normal  0.280117 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2013  hypothetical protein  38.07 
 
 
585 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.329786 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4659  alpha/beta hydrolase fold protein  37.02 
 
 
590 aa  408  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1591  hypothetical protein  37.54 
 
 
585 aa  403  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4012  Alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 
591 aa  403  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1762  hypothetical protein  37.72 
 
 
585 aa  404  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000563252 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0009  alpha/beta hydrolase fold  37.11 
 
 
584 aa  402  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2883  alpha/beta hydrolase fold  38.57 
 
 
594 aa  396  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.752135  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1173  alpha/beta hydrolase fold  38.75 
 
 
578 aa  387  1e-106  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.0000196015  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2360  hypothetical protein  36.28 
 
 
586 aa  385  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.279052  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31720  hypothetical protein  37.15 
 
 
586 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.137406  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2697  hypothetical protein  37.33 
 
 
586 aa  381  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598372  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02970  alpha/beta hydrolase fold  35.37 
 
 
332 aa  215  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3838  hypothetical protein  32.31 
 
 
285 aa  143  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2956  alpha/beta hydrolase fold  23.9 
 
 
277 aa  92.8  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3712  alpha/beta hydrolase fold protein  27.91 
 
 
290 aa  92  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3638  alpha/beta hydrolase fold  27.52 
 
 
290 aa  91.3  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475063  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3572  Alpha/beta hydrolase fold-1  27.34 
 
 
291 aa  88.6  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3693  alpha/beta hydrolase fold  26.15 
 
 
288 aa  88.6  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249037  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3541  alpha/beta hydrolase fold  27.14 
 
 
289 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.421179 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3346  putative lysophospholipase protein  25.19 
 
 
286 aa  80.9  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3215  alpha/beta hydrolase fold protein  26.77 
 
 
289 aa  80.9  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0222  acylglycerol lipase  25.09 
 
 
277 aa  80.5  0.00000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2931  lysophospholipase L2 LypA  25.51 
 
 
322 aa  78.6  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3522  alpha/beta hydrolase fold  24.54 
 
 
302 aa  78.6  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.775525 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1387  alpha/beta hydrolase fold  24.42 
 
 
275 aa  77  0.0000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.062595  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  21.25 
 
 
284 aa  76.6  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0149  alpha/beta fold family hydrolase  22.76 
 
 
277 aa  75.5  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02969  alpha/beta hydrolase  39.76 
 
 
103 aa  75.1  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3067  alpha/beta hydrolase fold protein  22.26 
 
 
306 aa  72  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0525  alpha/beta hydrolase fold  24.58 
 
 
289 aa  70.9  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.720757 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002122  lysophospholipase L2  23.7 
 
 
335 aa  70.1  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_157  hydrolase, alpha/beta fold family  22.51 
 
 
277 aa  69.7  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.379638  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2790  alpha/beta hydrolase fold protein  23.51 
 
 
276 aa  70.1  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.067584  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00300  lysophospholipase  24.74 
 
 
329 aa  68.6  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3478  alpha/beta hydrolase fold protein  23.16 
 
 
291 aa  68.9  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.786791  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4120  alpha/beta hydrolase fold  23.16 
 
 
291 aa  68.6  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.848417  normal  0.810632 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1479  alpha/beta hydrolase fold protein  26.41 
 
 
257 aa  68.6  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1433  alpha/beta hydrolase fold  26.41 
 
 
257 aa  68.2  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3691  alpha/beta hydrolase fold protein  23.77 
 
 
278 aa  67.8  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2559  alpha/beta fold family hydrolase  23.99 
 
 
280 aa  67  0.0000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0214  alpha/beta fold family hydrolase  23.99 
 
 
280 aa  67  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0415  alpha/beta fold family hydrolase  23.99 
 
 
303 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0935  alpha/beta fold family hydrolase  23.99 
 
 
303 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10184  lysophospholipase  24.43 
 
 
279 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6038  alpha/beta hydrolase fold  22.18 
 
 
294 aa  65.5  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0934  alpha/beta hydrolase fold  21.58 
 
 
320 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0871  alpha/beta hydrolase fold protein  23.81 
 
 
290 aa  65.1  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2932  alpha/beta fold family hydrolase  23.99 
 
 
303 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3556  alpha/beta hydrolase fold protein  25.26 
 
 
330 aa  64.3  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.108163 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0600  alpha/beta hydrolase fold protein  20.46 
 
 
253 aa  64.3  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0245  lysophospholipase L2  26.74 
 
 
330 aa  63.9  0.000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.200156  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2981  alpha/beta fold family hydrolase  23.62 
 
 
303 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4867  alpha/beta hydrolase fold  22.07 
 
 
328 aa  63.5  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2367  alpha/beta hydrolase fold protein  26.84 
 
 
286 aa  63.2  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0518  acylglycerol lipase  21.82 
 
 
277 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.645485  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4171  Alpha/beta hydrolase  21.79 
 
 
306 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.753522 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4455  Alpha/beta hydrolase fold  21.9 
 
 
281 aa  62  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3430  alpha/beta hydrolase fold  23.44 
 
 
267 aa  62  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1698  alpha/beta hydrolase fold protein  22.99 
 
 
559 aa  61.6  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  hitchhiker  0.0000305694 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0938  alpha/beta hydrolase fold  21.58 
 
 
320 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0579  alpha/beta hydrolase fold  22.26 
 
 
302 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1058  alpha/beta hydrolase fold  22.26 
 
 
302 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  23.62 
 
 
303 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1649  alpha/beta fold family hydrolase  22.06 
 
 
318 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1204  putative phospholipase  24.34 
 
 
638 aa  60.8  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0039  alpha/beta hydrolase fold  26.04 
 
 
324 aa  60.8  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.302219  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4904  hypothetical protein  22.87 
 
 
267 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0402  alpha/beta hydrolase  20.9 
 
 
279 aa  59.7  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4586  lysophospholipase L2  23.17 
 
 
267 aa  60.1  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1664  alpha/beta hydrolase fold  23.02 
 
 
341 aa  59.7  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4654  hypothetical protein  22.87 
 
 
272 aa  59.3  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4510  lysophospholipase L2  22.48 
 
 
277 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.811294  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5009  hypothetical protein  22.87 
 
 
267 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4878  hypothetical protein  22.87 
 
 
267 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1017  alpha/beta hydrolase fold  21.91 
 
 
302 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4869  hypothetical protein  22.69 
 
 
267 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4492  lysophospholipase L2  22.87 
 
 
267 aa  58.5  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4895  hypothetical protein  22.87 
 
 
267 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0196  lysophospholipase L2  25.17 
 
 
345 aa  58.9  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.951636  normal  0.0550864 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0149  acylglycerol lipase  22.46 
 
 
279 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.78006  normal  0.636715 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>