45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0210 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0210  V-type ATPase, D subunit  100 
 
 
209 aa  412  1e-114  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0020  V-type ATPase, D subunit  49.74 
 
 
199 aa  162  3e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0016  V-type ATPase, D subunit  46.7 
 
 
202 aa  155  3e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.304681 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1050  V-type ATPase, D subunit  46.94 
 
 
199 aa  155  4e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0806928 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2162  V-type ATPase, D subunit  47.28 
 
 
198 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1632  V-type ATPase, D subunit  30.41 
 
 
213 aa  73.9  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1100  V-type ATPase, D subunit  26.99 
 
 
206 aa  67  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2362  V-type ATP synthase subunit D  22.5 
 
 
209 aa  64.3  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1919  V-type ATP synthase subunit D  27.23 
 
 
213 aa  64.7  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.487465  normal  0.936893 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1137  V-type ATPase, D subunit  23.92 
 
 
216 aa  63.9  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00018509  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2269  V-type ATP synthase subunit D  24.62 
 
 
222 aa  63.2  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1888  V-type ATP synthase subunit D  23.65 
 
 
214 aa  62.8  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1607  V-type ATP synthase subunit D  23.65 
 
 
214 aa  62.8  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0230905  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0524  V-type ATPase, D subunit  32.53 
 
 
208 aa  57.8  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.913161  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1689  V-type ATPase, D subunit  22.34 
 
 
209 aa  57.4  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.366516 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_51058  predicted protein  32.08 
 
 
255 aa  57  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19380  V-type ATP synthase subunit D  29.27 
 
 
208 aa  55.8  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0067  V-type ATP synthase subunit D  29.93 
 
 
212 aa  53.5  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00590  vacuolar ATP synthase subunit d, putative  31.65 
 
 
258 aa  52.8  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0369  V-type ATP synthase subunit D  30.63 
 
 
214 aa  52.4  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0547  V-type ATP synthase subunit D  29.6 
 
 
211 aa  52  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0860  V-type ATPase, D subunit  24.88 
 
 
208 aa  52  0.000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1185  V-type ATP synthase subunit D  20.71 
 
 
209 aa  51.2  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00722603  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0258  V-type ATPase, D subunit  20.21 
 
 
207 aa  50.8  0.00001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1607  V-type ATP synthase subunit D  30 
 
 
232 aa  50.8  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3070  V-type ATP synthase subunit D  20.69 
 
 
220 aa  50.1  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1613  V-type ATP synthase subunit D  29.6 
 
 
214 aa  50.1  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0300  V-type ATP synthase subunit D  30.14 
 
 
214 aa  50.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2343  V-type ATP synthase subunit D  22.22 
 
 
209 aa  50.1  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.563261 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88668  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  35 
 
 
269 aa  49.7  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.877378  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2675  V-type ATP synthase subunit D  27.5 
 
 
213 aa  49.7  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1499  V-type ATPase, D subunit  20.63 
 
 
201 aa  48.1  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3440  V-type ATPase, D subunit  24.09 
 
 
212 aa  48.1  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80851  vacuolar ATPase V1 domain subunit D  36.67 
 
 
264 aa  47  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1224  V-type ATP synthase subunit D  26.44 
 
 
220 aa  46.6  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.486034 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1245  V-type ATP synthase subunit D  27.5 
 
 
206 aa  46.2  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1757  V-type ATPase, D subunit  19.23 
 
 
222 aa  46.2  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2045  V-type ATPase, D subunit  30.88 
 
 
222 aa  44.3  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0283  V-type ATP synthase subunit D  22.28 
 
 
228 aa  43.5  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.155382 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1009  V-type ATPase, D subunit  23.4 
 
 
212 aa  42.7  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0289  V-type ATP synthase subunit D  28.74 
 
 
208 aa  42.4  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1684  V-type ATP synthase subunit D  24.77 
 
 
212 aa  42.4  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0591  V-type ATPase, D subunit  27.59 
 
 
214 aa  42.4  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2761  V-type ATPase, D subunit  30.69 
 
 
209 aa  42.4  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.329458  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1441  V-type ATP synthase subunit D  22.77 
 
 
225 aa  42  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0338173  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>