281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2337 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2337  phosphoheptose isomerase  100 
 
 		 214 aa  432  1e-120  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2549  phosphoheptose isomerase  79.43 
 
 		 226 aa  332  3e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000227289  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2710  phosphoheptose isomerase  81.82 
 
 		 211 aa  324  5e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.555636  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0131  phosphoheptose isomerase  73.68 
 
 		 210 aa  308  2.9999999999999997e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000153742  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1990  phosphoheptose isomerase  72.33 
 
 		 222 aa  305  4.0000000000000004e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0256  phosphoheptose isomerase  65.13 
 
 		 213 aa  254  8e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.245661 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0290  phosphoheptose isomerase  70.65 
 
 		 203 aa  248  6e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.520293 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2381  phosphoheptose isomerase  49.47 
 
 		 197 aa  176  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3308  phosphoheptose isomerase  47.89 
 
 		 193 aa  170  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.765862  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3320  phosphoheptose isomerase  47.89 
 
 		 193 aa  170  1e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000364582 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1238  phosphoheptose isomerase  52.1 
 
 		 193 aa  171  1e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3170  phosphoheptose isomerase  47.89 
 
 		 193 aa  170  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0402  phosphoheptose isomerase  46.93 
 
 		 186 aa  169  2e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.575218  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0349  phosphoheptose isomerase  46.84 
 
 		 192 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.477864 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0344  phosphoheptose isomerase  46.84 
 
 		 192 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.573238  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0340  phosphoheptose isomerase  46.84 
 
 		 192 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.648368 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0351  phosphoheptose isomerase  46.84 
 
 		 192 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.178027  hitchhiker  0.00118485 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0359  phosphoheptose isomerase  46.84 
 
 		 192 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0920  phosphoheptose isomerase  50.53 
 
 		 189 aa  168  7e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0298186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0759  phosphoheptose isomerase  46.35 
 
 		 192 aa  167  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3592  phosphoheptose isomerase  52.17 
 
 		 189 aa  167  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.020908  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1335  phosphoheptose isomerase  50.6 
 
 		 191 aa  167  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3096  phosphoheptose isomerase  47.89 
 
 		 214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286369  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00217  phosphoheptose isomerase  45.79 
 
 		 192 aa  165  4e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3385  phosphoheptose isomerase  45.79 
 
 		 192 aa  165  4e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0234  phosphoheptose isomerase  45.79 
 
 		 192 aa  165  4e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.407926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0218  phosphoheptose isomerase  45.79 
 
 		 192 aa  165  4e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0254  phosphoheptose isomerase  45.79 
 
 		 192 aa  165  4e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3398  phosphoheptose isomerase  45.79 
 
 		 192 aa  165  4e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0266  phosphoheptose isomerase  45.79 
 
 		 192 aa  165  4e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0250  phosphoheptose isomerase  45.79 
 
 		 192 aa  165  4e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00221  hypothetical protein  45.79 
 
 		 192 aa  165  4e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2087  phosphoheptose isomerase  51.72 
 
 		 189 aa  165  5e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0950  phosphoheptose isomerase  53.16 
 
 		 193 aa  165  5e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0924  phosphoheptose isomerase  52.1 
 
 		 193 aa  165  5.9999999999999996e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.708729  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2354  phosphoheptose isomerase  50.29 
 
 		 199 aa  164  6.9999999999999995e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1822  phosphoheptose isomerase  55.19 
 
 		 191 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0891  phosphoheptose isomerase  51.2 
 
 		 193 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0355  phosphoheptose isomerase  49.43 
 
 		 191 aa  161  7e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.902024  normal  0.913346 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0414  phosphoheptose isomerase  50 
 
 		 189 aa  160  1e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.113258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1118  phosphoheptose isomerase  46.59 
 
 		 194 aa  160  1e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2507  phosphoheptose isomerase  52.69 
 
 		 192 aa  159  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.211977  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2311  phosphoheptose isomerase  49.4 
 
 		 208 aa  159  3e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.720425  normal  0.582035 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  49.71 
 
 		 672 aa  159  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1410  phosphoheptose isomerase  47.49 
 
 		 186 aa  159  4e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03203  phosphoheptose isomerase  53.25 
 
 		 191 aa  159  4e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1712  phosphoheptose isomerase  52.1 
 
 		 192 aa  158  7e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.15186e-21 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3296  phosphoheptose isomerase  45.79 
 
 		 193 aa  157  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3443  phosphoheptose isomerase  45.79 
 
 		 193 aa  157  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1812  phosphoheptose isomerase  51.66 
 
 		 188 aa  156  2e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0573  phosphoheptose isomerase  41.8 
 
 		 195 aa  155  4e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1275  phosphoheptose isomerase  45.45 
 
 		 212 aa  154  7e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1338  phosphoheptose isomerase  45.3 
 
 		 194 aa  154  9e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5851  phosphoheptose isomerase  46.77 
 
 		 190 aa  154  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1897  phosphoheptose isomerase  51.97 
 
 		 192 aa  153  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.638192  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3872  phosphoheptose isomerase  45.21 
 
 		 194 aa  153  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.254676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0978  phosphoheptose isomerase  46.55 
 
 		 196 aa  153  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0530392  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0245  phosphoheptose isomerase  45.6 
 
 		 188 aa  151  5.9999999999999996e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1369  phosphoheptose isomerase  43.62 
 
 		 197 aa  151  7e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1285  phosphoheptose isomerase  47.75 
 
 		 210 aa  150  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.939986  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2619  phosphoheptose isomerase  43.32 
 
 		 280 aa  149  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0478  phosphoheptose isomerase  44.75 
 
 		 186 aa  149  2e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002778  phosphoheptose isomerase  53.02 
 
 		 191 aa  150  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3206  phosphoheptose isomerase  42.86 
 
 		 204 aa  149  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2393  phosphoheptose isomerase  53.02 
 
 		 193 aa  149  3e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2864  phosphoheptose isomerase  48.04 
 
 		 189 aa  147  8e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000412375  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0582  phosphoheptose isomerase  42.71 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.244141 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1705  phosphoheptose isomerase  49.38 
 
 		 195 aa  145  5e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2605  phosphoheptose isomerase  46.95 
 
 		 188 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0578  phosphoheptose isomerase  47.77 
 
 		 189 aa  144  7.0000000000000006e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.711121  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3790  phosphoheptose isomerase  49.68 
 
 		 200 aa  144  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3277  phosphoheptose isomerase  42.39 
 
 		 192 aa  143  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0237  phosphoheptose isomerase  45.45 
 
 		 193 aa  143  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3114  phosphoheptose isomerase  41.49 
 
 		 191 aa  143  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.169945 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1067  phosphoheptose isomerase  42.39 
 
 		 192 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3242  phosphoheptose isomerase  42.39 
 
 		 192 aa  143  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.544428  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0686  phosphoheptose isomerase  45.74 
 
 		 203 aa  143  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.111927  normal  0.369891 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2173  phosphoheptose isomerase  42.39 
 
 		 192 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0533  phosphoheptose isomerase  42.39 
 
 		 192 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.436359  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2295  phosphoheptose isomerase  42.62 
 
 		 197 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.715757  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3291  phosphoheptose isomerase  42.62 
 
 		 197 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2784  phosphoheptose isomerase  43.53 
 
 		 195 aa  142  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0579  phosphoheptose isomerase  45.68 
 
 		 186 aa  142  3e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1230  phosphoheptose isomerase  46.34 
 
 		 195 aa  142  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.243182  normal  0.207512 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1285  phosphoheptose isomerase  45.06 
 
 		 186 aa  142  4e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1166  phosphoheptose isomerase  45.06 
 
 		 186 aa  142  5e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.489496  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0770  phosphoheptose isomerase  46.49 
 
 		 187 aa  141  6e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0059313 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0354  phosphoheptose isomerase  43.65 
 
 		 210 aa  141  7e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2406  phosphoheptose isomerase  40 
 
 		 193 aa  141  7e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1756  phosphoheptose isomerase  42.54 
 
 		 198 aa  140  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.174844  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3356  phosphoheptose isomerase  42.41 
 
 		 197 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2370  phosphoheptose isomerase  45.57 
 
 		 196 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000861187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2319  phosphoheptose isomerase  45.57 
 
 		 196 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2656  DnaA initiator-associating protein DiaA  44.31 
 
 		 196 aa  139  4.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.967641  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3621  phosphoheptose isomerase  48.13 
 
 		 193 aa  139  4.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6781  phosphoheptose isomerase  46.54 
 
 		 213 aa  138  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.375812  normal  0.778027 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1609  phosphoheptose isomerase  41.99 
 
 		 201 aa  138  6e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0298  phosphoheptose isomerase  41.36 
 
 		 197 aa  138  6e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3882  phosphoheptose isomerase  41.36 
 
 		 197 aa  138  6e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118064 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1423  phosphoheptose isomerase  41.99 
 
 		 201 aa  138  6e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.831164  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>