223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0777 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0777  protein of unknown function DUF179  100 
 
 		 187 aa  388  1e-107  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0885  hypothetical protein  82.89 
 
 		 187 aa  335  1.9999999999999998e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2142  protein of unknown function DUF179  78.07 
 
 		 187 aa  325  2.0000000000000001e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0637  hypothetical protein  72.73 
 
 		 189 aa  303  1.0000000000000001e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.500132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1601  hypothetical protein  70.05 
 
 		 188 aa  295  2e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0943857  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1688  protein of unknown function DUF179  68.98 
 
 		 187 aa  291  5e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000694892 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0776  protein of unknown function DUF179  69.52 
 
 		 187 aa  286  9e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0197  protein of unknown function DUF179  46.2 
 
 		 183 aa  170  9e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7071  protein of unknown function DUF179  43.41 
 
 		 184 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4074  protein of unknown function DUF179  40.98 
 
 		 186 aa  156  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.499752  hitchhiker  0.00807045 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3626  protein of unknown function DUF179  39.89 
 
 		 186 aa  154  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0140  hypothetical protein  40.22 
 
 		 209 aa  150  8.999999999999999e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1896  protein of unknown function DUF179  39.13 
 
 		 187 aa  150  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.56007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1773  transcriptional regulator  39.78 
 
 		 182 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.728608  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09628  putative transcriptional regulator  37.16 
 
 		 186 aa  132  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.770481  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0483  hypothetical protein  37.57 
 
 		 190 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.195339  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0090  protein of unknown function DUF179  35.48 
 
 		 182 aa  110  9e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0331  protein of unknown function DUF179  36.26 
 
 		 198 aa  108  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502019  normal  0.568849 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3882  protein of unknown function DUF179  34.54 
 
 		 191 aa  107  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0726  hypothetical protein  30.68 
 
 		 186 aa  106  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58244  normal  0.917839 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1704  hypothetical protein  33.7 
 
 		 208 aa  105  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.77077  hitchhiker  0.00529814 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3774  hypothetical protein  33.52 
 
 		 198 aa  105  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.436862 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1356  protein of unknown function DUF179  32.77 
 
 		 216 aa  102  4e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02000  hypothetical protein  34.97 
 
 		 188 aa  101  8e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0367  protein of unknown function DUF179  32.83 
 
 		 192 aa  101  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.584645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03574  hypothetical protein  33.14 
 
 		 189 aa  100  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1432  protein of unknown function DUF179  31.32 
 
 		 188 aa  99.8  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.914919  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1289  hypothetical protein  34.78 
 
 		 191 aa  99.4  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3962  hypothetical protein  29.94 
 
 		 197 aa  99  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1237  hypothetical protein  32.34 
 
 		 186 aa  99.4  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.198149 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0544  hypothetical protein  32.2 
 
 		 197 aa  99.4  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0299176  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0705  hypothetical protein  29.1 
 
 		 200 aa  98.2  6e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002461  hypothetical protein  32.28 
 
 		 174 aa  97.8  8e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2389  hypothetical protein  34.21 
 
 		 198 aa  97.4  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.468382  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0019  hypothetical protein  31.18 
 
 		 200 aa  97.1  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0924  hypothetical protein  33.85 
 
 		 193 aa  97.4  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.127262  normal  0.648252 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2910  protein of unknown function DUF179  30.46 
 
 		 186 aa  97.1  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0923  hypothetical protein  34.92 
 
 		 196 aa  96.3  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3631  hypothetical protein  33.9 
 
 		 184 aa  97.1  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.66585 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1337  hypothetical protein  30.11 
 
 		 186 aa  95.9  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0174957  hitchhiker  0.000402511 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0987  hypothetical protein  34.92 
 
 		 196 aa  95.9  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0940  hypothetical protein  31.93 
 
 		 188 aa  95.1  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.335136  normal  0.481513 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4833  protein of unknown function DUF179  32.26 
 
 		 225 aa  95.1  5e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0922435  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0501  hypothetical protein  32.95 
 
 		 187 aa  95.1  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.232417  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3695  protein of unknown function DUF179  30.99 
 
 		 191 aa  94.4  8e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1153  hypothetical protein  33.53 
 
 		 198 aa  94.7  8e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2681  hypothetical protein  31.55 
 
 		 187 aa  94.4  8e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0732107  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0705  hypothetical protein  30.59 
 
 		 193 aa  93.6  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2674  hypothetical protein  32.57 
 
 		 184 aa  94.4  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000779921  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0675  hypothetical protein  30.59 
 
 		 190 aa  93.2  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3712  hypothetical protein  31.95 
 
 		 187 aa  93.6  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.081023  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1144  hypothetical protein  31.14 
 
 		 185 aa  93.2  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.496045  normal  0.0336297 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4027  hypothetical protein  29.94 
 
 		 187 aa  93.6  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375113  hitchhiker  0.00119286 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1710  hypothetical protein  32.46 
 
 		 192 aa  92.4  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.199079 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03293  Transcription regulator  29.52 
 
 		 208 aa  92.8  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.856515  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3962  hypothetical protein  29.94 
 
 		 193 aa  92  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000136745 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0532  hypothetical protein  31.03 
 
 		 201 aa  92  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2743  hypothetical protein  29.41 
 
 		 193 aa  91.7  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6057  hypothetical protein  29.57 
 
 		 201 aa  91.3  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.229198  normal  0.563539 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5633  protein of unknown function DUF179  35.77 
 
 		 146 aa  91.3  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0591685  normal  0.939371 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0659  hypothetical protein  29.31 
 
 		 201 aa  91.3  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.115513 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0368  hypothetical protein  30.72 
 
 		 187 aa  90.9  9e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0938  hypothetical protein  29.14 
 
 		 192 aa  90.9  9e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.147168  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0481  hypothetical protein  31.18 
 
 		 187 aa  90.9  1e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.756128  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_88895  predicted protein  36.42 
 
 		 288 aa  90.9  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0380911  hitchhiker  0.00603627 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1132  hypothetical protein  30 
 
 		 190 aa  89.4  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.214662  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3346  hypothetical protein  30 
 
 		 187 aa  90.1  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1179  protein of unknown function DUF179  28.18 
 
 		 184 aa  89.7  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0188247  normal  0.235234 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2223  hypothetical protein  30.77 
 
 		 195 aa  90.1  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.440526  decreased coverage  0.00358368 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0567  hypothetical protein  30 
 
 		 190 aa  89.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0835  hypothetical protein  30.18 
 
 		 187 aa  90.1  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0837  hypothetical protein  30.18 
 
 		 187 aa  90.1  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.01957  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1428  hypothetical protein  32.72 
 
 		 188 aa  89.7  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0619  hypothetical protein  30 
 
 		 190 aa  89.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39570  hypothetical protein  28.57 
 
 		 198 aa  89.4  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.336935 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2472  putative transcriptional regulator  28.11 
 
 		 189 aa  89  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.888778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1286  hypothetical protein  28.98 
 
 		 197 aa  89.4  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.921549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3341  hypothetical protein  30.18 
 
 		 187 aa  89.4  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7076  hypothetical protein  30.27 
 
 		 193 aa  89  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1361  hypothetical protein  32.1 
 
 		 188 aa  89  4e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0718  hypothetical protein  32.39 
 
 		 205 aa  89  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.236313 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3910  hypothetical protein  31.36 
 
 		 187 aa  88.6  5e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0230557  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2669  protein of unknown function DUF179  29.51 
 
 		 185 aa  88.6  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.670234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3062  hypothetical protein  29.51 
 
 		 185 aa  88.6  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5076  protein of unknown function DUF179  25.76 
 
 		 187 aa  88.6  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1199  hypothetical protein  29.17 
 
 		 187 aa  88.6  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000139258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1270  hypothetical protein  29.17 
 
 		 187 aa  88.6  5e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000905389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1200  hypothetical protein  29.17 
 
 		 187 aa  88.6  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0314769  normal  0.527879 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0469  hypothetical protein  31.55 
 
 		 189 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1471  hypothetical protein  33.33 
 
 		 205 aa  88.2  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3893  hypothetical protein  30.91 
 
 		 186 aa  88.2  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3090  hypothetical protein  30.18 
 
 		 187 aa  88.2  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132976  decreased coverage  0.00000221223 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0058  hypothetical protein  33.13 
 
 		 185 aa  88.2  6e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5392  hypothetical protein  29.12 
 
 		 204 aa  88.2  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.891404  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5481  hypothetical protein  29.12 
 
 		 204 aa  88.2  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.478764  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5768  hypothetical protein  29.12 
 
 		 204 aa  88.2  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.802117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0617  hypothetical protein  30.46 
 
 		 201 aa  88.2  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.559963  normal  0.877455 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0349  hypothetical protein  28.48 
 
 		 191 aa  87.8  8e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2659  hypothetical protein  30.99 
 
 		 184 aa  87.8  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.679405 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0983  hypothetical protein  30.9 
 
 		 217 aa  87.8  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>