More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1245 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1277  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  68.93 
 
 		 516 aa  748    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1245  putative two-domain glycosyltransferase  100 
 
 		 515 aa  1048    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.216067  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1152  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  67.38 
 
 		 515 aa  730    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000783621  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0586  hypothetical protein  56.25 
 
 		 257 aa  294  3e-78  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0388  glycosyl transferase family 2  45.42 
 
 		 270 aa  231  3e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0108663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1798  hypothetical protein  40.77 
 
 		 268 aa  219  1e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0149339 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001813  putative two-domain glycosyltransferase  46.64 
 
 		 267 aa  217  5e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.735917  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0072  glycosyl transferase family protein  45.77 
 
 		 282 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0395355 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0390  glycosyl transferase family 2  42.92 
 
 		 241 aa  212  1e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0975071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1547  glycosyl transferase family 2  42.41 
 
 		 282 aa  206  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123208  normal  0.944766 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1799  hypothetical protein  39.44 
 
 		 249 aa  203  5e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561578 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3699  glycosyl transferase family protein  40.32 
 
 		 263 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02865  putative glycosyltransferase  45.38 
 
 		 268 aa  197  3e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.690381  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0586  glycosyl transferase family protein  40.55 
 
 		 249 aa  186  8e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00112875  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2457  glycosyl transferase family protein  41.37 
 
 		 288 aa  182  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1546  glycosyl transferase family 2  39.83 
 
 		 270 aa  178  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151048  normal  0.921915 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2004  glycosyl transferase family 2  36.08 
 
 		 280 aa  177  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2399  glycosyl transferase family 2  36.19 
 
 		 280 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.378112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0609  glycosyl transferase family protein  36.68 
 
 		 253 aa  171  3e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0756  glycosyl transferase family protein  32.95 
 
 		 260 aa  167  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00258657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2052  glycosyl transferase family protein  33.07 
 
 		 255 aa  163  6e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2091  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 260 aa  161  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646647  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1246  glycosyl transferase family 2  34.75 
 
 		 253 aa  161  3e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1803  glycosyl transferase family 2  34.9 
 
 		 252 aa  160  8e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1254  glycosyl transferase family 2  33.2 
 
 		 253 aa  159  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00808348  normal  0.786627 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2344  beta-1,4-glucosyltransferase  33.6 
 
 		 249 aa  157  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2347  glycosyl transferase family protein  32.8 
 
 		 250 aa  157  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2227  glycosyl transferase family protein  33.2 
 
 		 250 aa  157  6e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.715035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2331  glycosyl transferase family protein  32.4 
 
 		 250 aa  156  7e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.839622  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1696  glycosyl transferase family protein  32.4 
 
 		 250 aa  156  8e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.792566  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2308  glycosyl transferase family protein  32.4 
 
 		 250 aa  156  8e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0968  glycosyl transferase family protein  33.06 
 
 		 263 aa  155  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1247  glycosyl transferase family 2  35.54 
 
 		 259 aa  155  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5650  glycosyl transferase family protein  32 
 
 		 250 aa  154  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2078  glycosyl transferase family protein  31.64 
 
 		 255 aa  153  7e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149982  normal  0.0473511 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3291  putative LPS biosynthesis-related protein  32.43 
 
 		 253 aa  153  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.525684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0608  glycosyl transferase family protein  34.4 
 
 		 262 aa  152  8.999999999999999e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0991  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  30.5 
 
 		 254 aa  152  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.87113  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1982  glycosyl transferase family protein  31.33 
 
 		 256 aa  150  6e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1230  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase KdtX  34.57 
 
 		 231 aa  149  9e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1905  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  30.5 
 
 		 254 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1364  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  30.89 
 
 		 254 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0334  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  30.5 
 
 		 254 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.650997  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1213  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.89 
 
 		 254 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1051  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  30.5 
 
 		 254 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519037  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0817  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase  30.5 
 
 		 254 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1204  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.13 
 
 		 254 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2051  glycosyl transferase family protein  33.73 
 
 		 280 aa  146  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1401  glycosyltransferase  33.88 
 
 		 231 aa  145  2e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.166634  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18870  glycosyl transferase family 2  32.3 
 
 		 257 aa  144  5e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0866305  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2254  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.98 
 
 		 260 aa  141  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.150124  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2202  glycosyl transferase protein  30 
 
 		 256 aa  140  4.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0472  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.74 
 
 		 234 aa  140  7e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.0043058  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0775  glycosyl transferase family 2  28.35 
 
 		 250 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4382  glycosyl transferase family 2  32.06 
 
 		 258 aa  137  4e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3224  glycosyl transferase family protein  35.15 
 
 		 273 aa  137  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0164  glycosyl transferase family 2  29.34 
 
 		 263 aa  137  6.0000000000000005e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0374  glycosyl transferase family protein  31.45 
 
 		 249 aa  137  7.000000000000001e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2605  glycosyl transferase, group 2  30.71 
 
 		 259 aa  134  3.9999999999999996e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4093  glycosyl transferase family 2  31.1 
 
 		 257 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1849  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.02 
 
 		 254 aa  134  5e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0340  alpha-L-glycero-D-manno-heptose beta-1,4-glucosyltransferase  29.02 
 
 		 254 aa  134  5e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.880408  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4837  glycosyl transferase family protein  31.76 
 
 		 257 aa  133  6.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000158905  hitchhiker  0.0000395661 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4150  glycosyl transferase family protein  31.54 
 
 		 260 aa  132  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.021853  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0291  UDP-glucose--lipooligosaccharide beta 1-4 glucosyltransferase  32.02 
 
 		 256 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0225943  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0060  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  31.54 
 
 		 260 aa  132  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000254421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0066  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.54 
 
 		 260 aa  132  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000310001  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0790  glycosyl transferase family protein  29.32 
 
 		 249 aa  130  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00661  alpha-L-glycero-D-manno-heptose beta-1,4-glucosyltransferase  31.85 
 
 		 267 aa  130  8.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0106  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 		 258 aa  129  9.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.002357  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0883  hypothetical protein  30.33 
 
 		 259 aa  129  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3955  glycosyl transferase family 2  30.5 
 
 		 263 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.304887  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0328  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 		 257 aa  128  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0852  hypothetical protein  29.92 
 
 		 259 aa  128  3e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0234  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  32.56 
 
 		 265 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.284174  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0410  glycosyl transferase family 2  32.56 
 
 		 257 aa  127  5e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.562142  hitchhiker  0.000988056 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2005  glycosyl transferase family 2  24.9 
 
 		 257 aa  126  9e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.983134  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2400  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 257 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0233946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0184  glycosyl transferase  31.98 
 
 		 260 aa  125  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.397998  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0605  b-glycosyltransferase  31.75 
 
 		 254 aa  125  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0239  glucosyl transferase  31.98 
 
 		 260 aa  125  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.762057  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001812  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  30.53 
 
 		 255 aa  124  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.825658  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0850  glycosyl transferase family 2  29.53 
 
 		 265 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.845126  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0247  putative glycosyl transferase  31.75 
 
 		 279 aa  122  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0176  putative glycosyl transferase  31.75 
 
 		 279 aa  122  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3480  glycosyl transferase family protein  26.54 
 
 		 261 aa  120  6e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0331  glycosyl transferase family protein  33.46 
 
 		 278 aa  118  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0011  glycosyl transferase family protein  26.27 
 
 		 251 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.360416  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1178  glycosyl transferase family protein  28.12 
 
 		 535 aa  117  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026276 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2519  glycosyl transferase family protein  29.3 
 
 		 257 aa  117  6e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2523  glycosyl transferase family protein  31.64 
 
 		 249 aa  116  7.999999999999999e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.357373  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2521  glycosyl transferase family protein  30.52 
 
 		 249 aa  116  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.328172  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0206  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 		 251 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.204479  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06135  putative glycosyltransferase  33.06 
 
 		 272 aa  115  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.614434  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1248  glycosyl transferase family protein  31.62 
 
 		 249 aa  115  2.0000000000000002e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.480822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1206  glycosyl transferase family protein  27.76 
 
 		 521 aa  114  5e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.959652  normal  0.0123578 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2885  glycosyl transferase family protein  26.8 
 
 		 287 aa  114  6e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0109096 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1446  glycosyl transferase family protein  27.56 
 
 		 280 aa  110  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0412  glycosyl transferase family 2  26.15 
 
 		 259 aa  110  6e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.260054 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06130  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  27.2 
 
 		 252 aa  109  9.000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.803849  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>